Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,322 | 0 | G | A | 61.9% | 109.1 / 190.3 | 202 | intergenic (+380/‑754) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
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(MQ=40) aataatAAGGGCACGGGGGGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTAAAGAACATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATc < 1:37600/141‑1 (MQ=14) aaGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTAAAGAATATGCCCCAATTTTGTATCAATTGTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAAATACAAATAGGGTATTGATGAGACTTACATCAAAATa > 1:77369/1‑141 (MQ=11) | TAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATA > CP000730/76183‑76459 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |