| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,144,182 | T→C | P154P (CCA→CCG) | sdrH ← | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein bindin protein SdrH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,144,182 | 0 | T | C | 100.0% | 32.0 / NA | 12 | P154P (CCA→CCG) | sdrH | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein bindin protein SdrH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (9/3); total (9/3) | |||||||||||
TCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATCTGGATTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGATTCGGACTTGGGTTTTGGT > CP000730/2144045‑2144315 | ggttgatcgggatctggtgacgggttaggatttggcttattagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggctttggtttatctGGGTCTGGTTTTGGATCcggt > 2:161366‑M2/121‑140 (MQ=255) ctggtgacgggttaggatttggcttattagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggctttggtttatctGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGt < 2:92742‑M2/34‑1 (MQ=255) ggtgacgggttaggatttggcttattagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggctttggtttatctGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGgttt > 2:228004‑M2/106‑140 (MQ=255) acgggttaggatttggcttattagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggctttggtttatctGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTatctg > 1:394833‑M2/102‑141 (MQ=255) cgggttaggatttggcttattagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggctttggtttatctGGGTCTGG‑TTTAGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTatctgga < 2:161156‑M2/41‑1 (MQ=255) gggttaggatttggcttattagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggctttggtttatctGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTatctgga > 1:86978‑M2/100‑141 (MQ=255) ttaggatttggcttattagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggctgtgggttatcgGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTatctggatct > 1:236664‑M2/97‑141 (MQ=255) tttggcttattagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggctttggtttatctGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGgttta > 1:354086‑M2/91‑140 (MQ=255) ttattagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggcttgggtttatctGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGgattc > 1:337314‑M2/85‑139 (MQ=255) tagggtctggttttggattcggatttggctttggtttatctggatctggttttggatccggatttggctttggtttatctGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGTATCTGGTTTAGGATTCGgac < 1:42489‑M2/61‑2 (MQ=255) tGGTTTTGGATTCGTAATTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTAGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTAGGTCTGGTTTTTGATTCGGCTTTTGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTCGGACTCGGACCTTGGtt > 2:236006/1‑141 (MQ=17) gTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGATTCGGACTTGGGtttt > 2:213359/1‑141 (MQ=17) ttGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTGTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGATTCGGACTTGGGTTTTGGt > 2:106235/1‑141 (MQ=18) | TCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATCTGGATTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGATTCGGACTTGGGTTTTGGT > CP000730/2144045‑2144315 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |