| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | CP000730 | 2,144,161 | 4 bp→TGGTTTATCT | coding (480‑483/1254 nt) | sdrH ← | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein bindin protein SdrH |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP000730 | 2144161 | 2144164 | 4 | 22 [0] | [0] 17 | sdrH | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein bindin protein SdrH |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2144160 | 0 (0.000) | 17 (0.540) +TGGTTTATCT |
13/250 | 1.8 | 100% | coding (484/1254 nt) | sdrH | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein bindin protein SdrH |
| ? | CP000730 | 2144165 = | 0 (0.000) | coding (479/1254 nt) | sdrH | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein bindin protein SdrH | |||||
TCGAGCCACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATCTGGATTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCT > CP000730/2144022‑2144231 | tCGAGCCACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtg > 1:5248‑M1/1‑139 (MQ=255) cGAGCCACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtgg < 1:208104‑M1/141‑4 (MQ=255) accaGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatc < 1:257039‑M1/141‑10 (MQ=255) aaTGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggt > 1:219668‑M1/1‑127 (MQ=255) aTCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttgg > 1:289374‑M1/1‑117 (MQ=255) ccccAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggat < 1:191847‑M1/141‑27 (MQ=255) ccAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGCTTCGGATTTGGTTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctgggtttggatcc > 2:271765‑M1/1‑113 (MQ=255) ggTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggt > 2:161366‑M1/1‑110 (MQ=255) ttGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggttt < 1:33102‑M1/141‑34 (MQ=255) ttGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggttt < 2:202415‑M1/141‑34 (MQ=255) tGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggtttt < 1:327699‑M1/141‑35 (MQ=255) cGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTt > 1:24852‑M1/1‑103 (MQ=255) cGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTt < 2:24852‑M1/104‑2 (MQ=255) cTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggttttggtttcgggt < 2:92742‑M1/141‑45 (MQ=255) ggTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggttttggtttcgggttt > 2:228004‑M1/1‑95 (MQ=255) aCGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggttttggtttcgggttatctg > 1:394833‑M1/1‑91 (MQ=255) cGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggtttagatccggttttggtttcgggttatctgga < 2:161156‑M1/141‑52 (MQ=255) gggTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggttttggtttcgggttatctgga > 1:86978‑M1/1‑89 (MQ=255) ttAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTGtgggttatcggggtctggttttggatccggttttggtttcgggttatctggatct > 1:236664‑M1/1‑86 (MQ=255) tttGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggttttggtttcgggttatctggatctggttta > 1:354086‑M1/1‑80 (MQ=255) ttattaGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTgggtttatctgggtctggttttggatccggttttggtttcgggttatctggatctggtttaggattc > 1:337314‑M1/1‑74 (MQ=255) taGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTtggtttatctgggtctggttttggatccggttttggtttcgggttatctgtatctggtttaggattcggac < 1:42489‑M1/141‑72 (MQ=255) | TCGAGCCACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATCTGGATTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCT > CP000730/2144022‑2144231 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |