New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 2453730 = | 68 (0.860) | 3 (0.040) | 3/250 | 12.6 | 4.7% | coding (464/936 nt) | hutG | formimidoylglutamase |
? | CP000730 | 2453790 = | 58 (0.790) | coding (404/936 nt) | hutG | formimidoylglutamase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CATCTTCTTCTAAAATTTGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAATCGACTAAA > CP000730/2453656‑2453930 | cATCTTCTTCTAAAATTTGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACg < 2:560814/141‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCTAAAATTTGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGc > 2:561625/1‑141 (MQ=255) cttcttctAAAATTTGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCaa < 1:821561/141‑1 (MQ=255) ttcttctAAAATTTGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAat > 2:869832/1‑141 (MQ=255) tAAAATTTGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATg < 1:46617/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGt < 2:519648/141‑1 (MQ=255) aTTTGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTcca < 2:207/141‑1 (MQ=255) ttGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTccacc > 2:852904/1‑141 (MQ=255) ttGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTccacc < 2:381390/141‑1 (MQ=255) tCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCaccacc > 2:439009/1‑141 (MQ=255) tCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCaccacc > 2:824991/1‑141 (MQ=255) tCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCaccacc > 1:216683/1‑141 (MQ=255) tCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCaccacc < 1:266884/141‑1 (MQ=255) aaGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCtaat < 1:880064/141‑1 (MQ=255) aaGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTCCAGCACGTGTATCAAACTGCGCAACAATATTTATCCGACCAATAGATTGCGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATAAGCGATATCATGTCCACCAACtaat > 2:646279/1‑141 (MQ=255) cTCGCTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATaaa < 2:559041/141‑1 (MQ=255) cGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATaaaaa > 1:514977/1‑141 (MQ=255) ttCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATg < 2:797372/141‑1 (MQ=255) ccAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCtaat < 1:533668/132‑1 (MQ=255) ccAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCtaat > 2:533668/1‑132 (MQ=255) ccAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGtt < 1:439009/141‑1 (MQ=255) gATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGt > 1:840172/1‑141 (MQ=255) aGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATg < 2:833198/141‑1 (MQ=255) gttgttCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATACAAATGTTTGTCTATGATTAg > 2:429817/1‑141 (MQ=255) aCGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACtt < 2:541305/141‑1 (MQ=255) cGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTc > 1:574691/1‑141 (MQ=255) tgtATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGc > 1:243472/1‑141 (MQ=255) gtATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAGTGTCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCt > 1:413959/1‑141 (MQ=255) tCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCa > 1:244718/1‑141 (MQ=255) aaaaTGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCaac > 2:707525/1‑140 (MQ=255) cgcATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGc < 2:714371/141‑1 (MQ=255) cgcATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGc < 2:152184/141‑1 (MQ=255) gcATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCa > 1:562335/1‑141 (MQ=255) gcATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCa > 2:21344/1‑141 (MQ=255) aTCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCaaa > 2:315338/1‑141 (MQ=255) tCAATATTTATCGCACCAATGTATTGTGTGTGATAGACTTTACGTCTTTCTAAATAGTGATCATACGCAAGATCATGTCCACCACCTAATAAAAAGGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAAt < 1:645992/141‑1 (MQ=255) tttATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCACATTCtttt > 2:195332/1‑141 (MQ=255) tATCANACCAATGTATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAANTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTg < 1:316780/141‑1 (MQ=255) aTCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGa < 2:597875/141‑1 (MQ=255) tCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAg > 2:603469/1‑141 (MQ=255) cacCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTAt > 2:780563/1‑141 (MQ=255) tAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCaatta < 1:824429/141‑1 (MQ=255) aTTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTACACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCaattcatt > 2:479803/1‑141 (MQ=255) tgtgTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTcc < 1:701654/141‑1 (MQ=255) tgtgTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTcc < 1:719819/141‑1 (MQ=255) gtTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCtca > 1:719058/1‑141 (MQ=255) gtTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCtca < 1:349422/141‑1 (MQ=255) ggATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCtcatga > 2:425502/1‑141 (MQ=255) ggATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCtcatga > 2:425482/1‑141 (MQ=255) gATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCtcatgat > 2:138414/1‑141 (MQ=255) cTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTcatgatcatgat > 1:903353/1‑141 (MQ=255) ttACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACAACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGCTTAGCATGTAAATGCGCTGCAAGCAAAACAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATaa > 1:413979/1‑141 (MQ=255) tACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTACTTCCTCATGATCATGATaaa > 2:823281/1‑141 (MQ=255) tACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATaaa < 2:838467/141‑1 (MQ=255) cGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACa > 1:67363/1‑141 (MQ=255) gtgtTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACAt > 1:59139/1‑141 (MQ=255) tgtTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACAtt < 2:562335/141‑1 (MQ=255) gtTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACAttt > 2:250729/1‑141 (MQ=255) aaTATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAAt > 1:427960/1‑141 (MQ=255) aaTATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAAt > 1:135864/1‑141 (MQ=255) tatTGGGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAATCg > 2:248963/1‑141 (MQ=255) atTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAATCGa > 2:405553/1‑141 (MQ=255) gAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCaa < 2:228201/81‑1 (MQ=255) gAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCaa > 1:228201/1‑81 (MQ=255) gAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAATCGACTa > 2:606597/1‑141 (MQ=255) gAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAATCGACTa > 1:110129/1‑141 (MQ=255) aGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAATCGACTaa < 1:805510/141‑1 (MQ=255) gCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAATCGACTaaa > 1:839317/1‑141 (MQ=255) gCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAATCGACTaaa > 1:856951/1‑141 (MQ=255) | CATCTTCTTCTAAAATTTGTCTAAAGCTCGTTCCAGATGTAGATTGTTGTTCAGCACGTGTATCAAAATGCGCATCAATATTTATCACACCAATAGATTGTGTTGGATAGACTTTACGTGTTGCTAAATATTGAGCATACGCAATATCATGTCCACCACCTAATAAAAATGTTTGTCTATGATTAGCAATTGACTTCGCTGCAAGCATAGCAAATTCTTTTTGAGTATCAATTAATTCCTCATGATCATGATAAACATTTCCGTAATCGACTAAA > CP000730/2453656‑2453930 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |