| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2850817 = | 70 (1.270) | 4 (0.080) | 4/226 | NT | 6.3% | intergenic (+16/+103) | pcp/USA300HOU_2693 | C15 family pyroglutamyl‑peptidase I/hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 2850866 = | 57 (1.160) | intergenic (+65/+54) | pcp/USA300HOU_2693 | C15 family pyroglutamyl‑peptidase I/hypothetical protein | |||||
TGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGTATACTTACTGAAA > CP000730/2850726‑2851005 | tGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTgg < 2:385443/141‑1 (MQ=255) gCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGga < 1:30928/141‑1 (MQ=255) tGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTgg > 1:368747/1‑141 (MQ=255) tGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTgg > 2:2837/1‑141 (MQ=255) ttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtat > 1:401646‑M1/81‑141 (MQ=255) cTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtat < 2:276786/141‑1 (MQ=255) cATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGttt > 1:205135/1‑141 (MQ=255) aTTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGtttt > 2:449378/1‑141 (MQ=255) tGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTAc < 1:143455/141‑1 (MQ=255) tGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTAc > 2:217921/1‑141 (MQ=255) gAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACt < 1:306413/141‑1 (MQ=255) aaGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACta > 1:47908/1‑141 (MQ=255) aGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACtat > 2:256652/1‑141 (MQ=255) cTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATaa > 2:617440/1‑141 (MQ=255) cTAATTCCAATGATGAGGATTGAGACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATGTGGTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TCTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTATACTATaa < 2:392968/141‑1 (MQ=255) tATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAat < 2:177364/141‑1 (MQ=255) tttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatga > 1:207711/1‑141 (MQ=255) ttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgat < 1:65691/141‑1 (MQ=255) aagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatccaaaagcaccctaagttgttagtttaagtctaactttagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatga < 2:411023‑M2/30‑1 (MQ=255) cTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGt > 1:195542/1‑141 (MQ=255) aaTGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAt > 1:147111/1‑141 (MQ=255) ggATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTa > 1:367861/1‑141 (MQ=255) tttACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAAc > 1:49073/1‑141 (MQ=255) tttACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAAc < 1:433109/141‑1 (MQ=255) tACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGa < 1:96842/141‑1 (MQ=255) tACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGa < 2:524751/141‑1 (MQ=255) acacCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGAc < 1:613092/141‑1 (MQ=255) gCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCAAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGttt > 1:442223/1‑141 (MQ=255) ccTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACGTTGTTTAg > 2:568758/1‑141 (MQ=255) ccTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAg > 1:103110/1‑141 (MQ=255) ccTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAg > 2:110424/1‑141 (MQ=255) tGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAAcaatgtcgtttagct < 1:241216/141‑15 (MQ=255) tcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAAA‑‑GTTAGACTTAAACTAACAACTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtctt < 2:411023‑M1/111‑1 (MQ=255) ggCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtctt > 1:332186/1‑141 (MQ=255) gCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTCAC‑‑TTTAGGTTTCTTGCGGAGGAGTGGTAGACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtcttc > 1:493918/1‑141 (MQ=255) cacaACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtcttct > 2:131140/1‑141 (MQ=255) acaACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTcttctt < 2:51282/141‑1 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCttt > 1:608081/1‑141 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCttt > 1:517740/1‑141 (MQ=255) aCGTAATAGTTATACGTGCACAAACAACTGCACCCTAATTTGTTAGTTTATGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATATTTATGTATTTTATCTTCACGACATTTTTTCGTCTCcttctt < 2:326243/141‑1 (MQ=255) cGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGTTTTTGTTTTATTGTTTTATAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCtttttt > 2:553770/1‑141 (MQ=255) aTAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAAc < 2:147111/141‑1 (MQ=255) tAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACt < 1:510805/141‑1 (MQ=255) tAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACt > 1:460481/1‑141 (MQ=255) ataAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTa > 1:117049/1‑141 (MQ=255) acgTGCACAAACAAAAGCACTCTAATTTGATAGTTTAAGTCAAAA‑‑ATTCGAGAGCTGTTGGTTGCTAGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTaaa > 2:496669/3‑141 (MQ=255) ataccaatcatccaaaagcaccctaaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTaa > 1:401646‑M2/62‑141 (MQ=255) gCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAAttt < 1:224050/141‑1 (MQ=255) caaacaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACa < 2:59549/141‑1 (MQ=255) aaacaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACaa < 2:368747/141‑1 (MQ=255) acaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAAt > 1:61039/1‑141 (MQ=255) AAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGt < 1:190559‑M1/141‑1 (MQ=255) AAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGta > 2:248176‑M1/1‑141 (MQ=255) AAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGta < 2:543497‑M1/141‑1 (MQ=255) aatcACCATAATTTGTAAGTTTAAGTCGAAC‑‑TTTAGGGTGCTGGTGGATGATTTGTATACAGTTTTACTATAAGGATGTATTTTAGCTAAACAACAATGTTTAGTCTTCTTTTTTGTATTTTCTTAAATATAAATATGtat > 2:166112/4‑141 (MQ=255) AAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGtat < 1:558033‑M1/141‑1 (MQ=255) AAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGtat < 2:199240‑M1/141‑1 (MQ=255) AAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGtat < 1:60163‑M1/141‑1 (MQ=255) AGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGtata < 1:310250‑M1/141‑1 (MQ=255) AGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGtata > 1:360060‑M1/1‑141 (MQ=255) GCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTataa > 2:67011‑M1/1‑141 (MQ=255) GCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTataa > 1:362303‑M1/1‑141 (MQ=255) CACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTataaa < 2:407797‑M1/141‑1 (MQ=255) ACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTataaat > 2:442557‑M1/1‑141 (MQ=255) caccctaaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTataaa > 2:333909‑M2/44‑141 (MQ=255) CTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGCTTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAaataat > 2:660998‑M1/1‑141 (MQ=255) taaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAataata > 2:461956‑M2/39‑141 (MQ=255) gTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCt > 1:15621/1‑141 (MQ=255) gTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGCTACACGGTTTTTCTATGATGATAAATACCTGAAAAACGACACATTTTTTTTTTCTTTTTTTAACTTCCTATAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCt < 1:136758/141‑1 (MQ=255) ttAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCTTaaaa < 2:184952/113‑1 (MQ=255) ttAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCTTaaaa > 1:184952/1‑113 (MQ=255) ttAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCta > 1:634202/1‑141 (MQ=255) ttAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCta < 1:199240/141‑1 (MQ=255) tAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTa < 1:611376/141‑1 (MQ=255) tAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTa < 1:354366/141‑1 (MQ=255) aaGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAAGGTATAAATAATAAATGCTATATTTAg < 1:449378/141‑1 (MQ=255) aGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGa > 2:506222/1‑141 (MQ=255) gTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGaa < 2:310250/141‑1 (MQ=255) tAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAatga < 1:341901/141‑1 (MQ=255) tAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAatga < 1:449180/141‑1 (MQ=255) tttAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAg < 2:634202/141‑1 (MQ=255) gggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGtata > 1:150139‑M2/12‑141 (MQ=255) gtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGTAtact > 2:326611‑M2/10‑141 (MQ=255) cttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGTAtacttac > 1:320336‑M2/7‑141 (MQ=255) cttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGTAtacttac > 2:334779‑M2/7‑141 (MQ=255) cttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGTAtacttac > 2:670785‑M2/7‑141 (MQ=255) tttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGTATACTTACTg < 1:2837‑M2/137‑1 (MQ=255) tttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGTATACTTACTg < 1:256652‑M2/137‑1 (MQ=255) gGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGTATACTTACTGaaa < 2:124645‑M2/140‑1 (MQ=255) | TGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAATGCTATATTTAGAATGATGAGTATACTTACTGAAA > CP000730/2850726‑2851005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |