New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	CP000730	= 1066493	35 (0.640)	3 (0.060)	3/238	NT	7.6%	intergenic (+361/+176)	fmt1/qoxD	S12 family carboxypeptidase/possible cytochrome c oxidase subunit IV
	?	CP000730	= 1066509	40 (0.780)					intergenic (+377/+160)	fmt1/qoxD	S12 family carboxypeptidase/possible cytochrome c oxidase subunit IV

ATCTAACTGGAAATGATAATTTAATAATGTACACTTTTGATTGTTTAAACATGTACAATTTTTAAAAACCTAGGGATAATTTTATTGACGTGAACAACATTGAGATTATCTTTAGACATAAATATGGATTTTGAAGTTACTATATTTATTAGTTGTGGTTGTTAATGTATTAATTGAATTGATTATAATGATTGTCTTATAAGATATAGAAGGGGACTTAACCATTTAAAAATTGAAGGAAAATAAAAACCAGCTAACAAAAGTGTTAGCTGGTTAAAC  >  CP000730/1066369‑1066647                                                                                                                                             |                                                                                                                                           aTCTAACTGGAAATGATAATTTAATAATGTACACTTTTGATTGTTTAAACATGTACAATTTTTAAAGACCGTTGTATAAGTTTTTTGACGTGAACAACATTGAGATTATCTTTAGACATAAATATGGATTTTGAAGTTACt                                                                                                                                            >  1:673959/1‑141 (MQ=37) 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                                                                                                                 aGACATAAATATGGATTTTGAAGTTACTATATTTATTAGTTGTGGTTGTTAATGTATTAATTGAATTGATTATAATGATTGTCTTATAAGATATAGAAGGGGACTTAACCATTTAAAAATTGAAGGAAAATAAAAACCAGc                           >  1:364869/1‑141 (MQ=255)                                                                                                                           tataGATTTTTAAGTTACTATATTTATTATTTGTGGTTTTTAATGTATTAATTGAATTGATTATAATGATTGTCTTATAAGATATAGAAGGGGACTTAACCATTTAAAAATTGAAAGAAAATAAAAACCAGCTAACacttt                  <  2:413953/141‑5 (MQ=255)                                                                                                                           tatGGATTTTGAATTTACTATATTTATTAGTTGTGGTTGTTAATGTATTAATTGAATTGATTATAATGATTGTCTTATAAGATATAGAAGGGGACTTAACCATTTAAAAATTGAAGGAAAATAAAAACCAGCTAACacttt                  <  2:34577/141‑5 (MQ=255)                                                                                                                           tatGGATTTTGAAGTTACTATATTTATTAGTTGTGGTTGTTAATGTATTAATTGAATTGATTATAATGATTGTCTTATAAGATATAGAAGGGGACTTAACCATTTAAAAATTGAAGGAAAATAAAAACCAGCTAACacttt                  <  1:272137/141‑5 (MQ=255)                                                                                                                            atGGATTTTGAAGTTACTATATTTATTAGTTGTGGTTGTTAATGTATTAATTGAATTGATTATAATGATTGTCTTATAAGATATAGAAGGGGACTTAACCATTTAAAAATTGAAGGAAAATAAAAACCAGCTAACactttt                 <  1:522050/141‑6 (MQ=255)                                                                                                                            atGGATTTTGAAGTTACTATATTTATTAGTTGTGGTTGTTAATGTATTAATTGAATTGATTATAATGATTGTCTTATAAGATATAGAAGGGGACTTAACCATTTAAAAATTGAAGGAAAATAAAAACCAGCTAACAAAAgt                 >  2:564244/1‑141 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.