| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,880,657 | C→T | 5.8% | R1521H (CGC→CAC) ‡ | ebh_2 ← | Extracellular matrix‑binding protein ebh |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,880,657 | 0 | C | T | 5.8% | 440.1 / 8.7 | 137 | R1521H (CGC→CAC) ‡ | ebh_2 | Extracellular matrix‑binding protein ebh |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (66/63); new base T (6/2); total (72/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CATTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATA > USA300TCH1516_ALE/1880517‑1880797 | cATTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTcgc > 1:130580/1‑141 (MQ=255) aTTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTcgcg < 2:111363/141‑1 (MQ=255) tttGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCgcgc > 3:77994/1‑141 (MQ=255) tttGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCgcgc > 1:308242/1‑141 (MQ=255) tttGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCgcgc < 2:382856/141‑1 (MQ=255) ttGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGCTTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCt > 1:1027333/1‑141 (MQ=255) ttGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCt < 1:887249/141‑1 (MQ=255) ttGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCAGCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCt < 1:135666/141‑1 (MQ=255) tGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTGGCTCAATTTCGCGCtt > 3:298063/1‑141 (MQ=255) tttCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCtttt > 1:627211/1‑141 (MQ=255) aaCACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGc > 2:700881/1‑141 (MQ=255) cacGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCATTTTCGCGCTTTTTAGCtt > 2:56047/1‑141 (MQ=255) acGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTc < 1:841723/141‑1 (MQ=255) cGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCa < 2:337175/141‑1 (MQ=255) tttCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCata > 1:393618/1‑141 (MQ=255) cacaTCATGATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTTTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttt > 4:11291/1‑140 (MQ=255) acaTCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttgt < 3:248864/141‑1 (MQ=255) acaTCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttgt < 2:903915/141‑1 (MQ=255) acaTCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttgt > 2:608253/1‑141 (MQ=255) acaTCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttgt < 2:234660/141‑1 (MQ=255) acaTCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttgt < 2:165126/141‑1 (MQ=255) atcatTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttgttg < 1:1043791/141‑1 (MQ=255) attattCGCTGTGGGTTGGTCTATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCTCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCATTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttgtgtctt > 2:222451/1‑136 (MQ=255) ttCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttgtt > 3:142168/1‑133 (MQ=255) ttCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATAttgtt < 4:142168/133‑1 (MQ=255) tCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTg < 2:826172/141‑1 (MQ=255) tCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTg < 1:986575/141‑1 (MQ=255) cGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGc > 2:610558/1‑141 (MQ=255) cGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGc > 4:124267/1‑141 (MQ=255) cGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGc > 1:1048444/1‑141 (MQ=255) cTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCAt > 3:365137/1‑141 (MQ=255) aTTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCAtct > 2:392132/1‑141 (MQ=255) tGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTagca > 3:317975/1‑141 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4:449295/141‑1 (MQ=255) tGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGctc > 1:137034/1‑141 (MQ=255) tGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGctc > 1:351674/1‑141 (MQ=255) gTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGctct < 2:259944/141‑1 (MQ=255) tGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACa < 2:671002/141‑1 (MQ=255) tGTAATGCACGTATTTCATTACTCGCTAATTGACTTAAAGCAACTTGTTATTCTTCATCAGTCGCATCTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTAATATTATTACTCAAATGCATCTCTAGCAGATGATCTAACa > 2:288019/1‑141 (MQ=255) gTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACaa < 2:63437/141‑1 (MQ=255) tAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAat < 2:885875/141‑1 (MQ=255) aaTGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAata > 3:174575/1‑141 (MQ=255) tGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATg < 2:966987/141‑1 (MQ=255) gCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATgg > 1:624967/1‑141 (MQ=255) aCGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTc < 1:781186/141‑1 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tCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACtt > 1:531389/1‑141 (MQ=255) cGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAAcaag < 1:755526/141‑4 (MQ=255) cGCATGTTCCGCTTGCCCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCACCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCCAGCGCTTGACTTGTTGTACCCTCAACctg > 2:688455/1‑141 (MQ=255) gCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgt < 2:132540/141‑1 (MQ=255) cATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgtt < 3:399199/141‑1 (MQ=255) cATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgtt < 4:362767/141‑1 (MQ=255) cATGTTCCGCTCGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgtt < 3:365245/141‑1 (MQ=255) aTGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgttg < 3:339573/141‑1 (MQ=255) tGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACACTATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGa > 3:335211/1‑141 (MQ=255) gTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGAt < 2:736455/141‑1 (MQ=255) ccGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTg > 2:979980/1‑141 (MQ=255) cTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTc > 1:753207/1‑141 (MQ=255) gCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCtat < 2:1075052/141‑1 (MQ=255) cTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCtatt < 2:316563/141‑1 (MQ=255) cAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCtattat > 3:26570/1‑141 (MQ=255) cAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCtattat > 2:393019/1‑141 (MQ=255) aaTTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTattatt < 2:46876/141‑1 (MQ=255) aTTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTc < 4:26701/141‑1 (MQ=255) aTTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTGGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATTGTCATTCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTc > 1:702942/1‑141 (MQ=255) cgcTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAata > 1:649541/1‑141 (MQ=255) cgcTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAata > 1:649408/1‑141 (MQ=255) cgcTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGCCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAata > 1:70011/1‑141 (MQ=255) | CATTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATA > USA300TCH1516_ALE/1880517‑1880797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |