Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | USA300TCH1516_ALE | 1,789,169 | 0 | A | T | 6.0% | 363.1 / 10.6 | 118 | V117V (GTT→GTA) | gapA2 | Glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase 2 |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ACTTTTGCAACTGGACCAATGCAATTAGTAGTACATGAAGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACTTTTTTGGCACCTGCTTTAATATGTGCGATGGCTTTATCACCATGATTAAATTTACCAGTTGCATCTATAGCAATATCGATATCTAATTCTTTCCATGGCAAGTTTTCAGGATTGCGATCAGCAACCAATTTAATTTT > USA300TCH1516_ALE/1789029‑1789309 | tttGCAGCTGGACCAATGCAATTAGTAGTACATGAAGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACt < 2:755775/141‑1 (MQ=255) tttGCAACTGGACCAATGCAATTAGTAGTACATGAAGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACt > 2:1015770/1‑141 (MQ=255) ttGCAACTGGACCAATGCAATTAGTAGTACATGAAGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACtt < 2:300719/141‑1 (MQ=255) cTGGACCAATGCAATTAGTAGTACATGAAGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACTTTTTTgg < 3:332599/141‑1 (MQ=255) 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aTGAAGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACTTTTTTGGCACCTGCTTTAATATGTGCGATgg < 3:68880/141‑1 (MQ=255) gAAGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACTTTTTTGGCACCTGCTTTAATATGTGCGATGGCt > 2:355009/1‑141 (MQ=255) aaGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACTTTTTTGGCACCTGCTTTAATATGTGCGATGGCtt < 2:161512/141‑1 (MQ=255) aGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTAACATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAATACTTTTTTGGCACCTGCTTTAATATGTGCGATGGCttt > 2:824916/1‑141 (MQ=255) cATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACTTTTTTGGCACCTGCTTTAATATGTGCGATGGCTTTAt > 2:938283/1‑141 (MQ=255) aCTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACTTTTTTGGCACCTGCTTTAATATGTGCGATGGCTTTATCAcc > 2:563376/1‑141 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ACTTTTGCAACTGGACCAATGCAATTAGTAGTACATGAAGCATTACTAAAAATGTCAAATGCTTCTATATCTAATTGGTTATCATTTACGCCTTTAACTACCATTTGAACATGTCCACCTTTTGAAGGACCAGTTAACAAAACTTTTTTGGCACCTGCTTTAATATGTGCGATGGCTTTATCACCATGATTAAATTTACCAGTTGCATCTATAGCAATATCGATATCTAATTCTTTCCATGGCAAGTTTTCAGGATTGCGATCAGCAACCAATTTAATTTT > USA300TCH1516_ALE/1789029‑1789309 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |