| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1662000 = | 341 (0.950) | 16 (0.050) | 15/136 | NT | 5.7% | intergenic (‑87/+68) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1662039 = | 240 (0.790) | intergenic (‑126/+29) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1662101‑1662000‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTCA > USA300TCH1516_ALE/1662039‑1662128 AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 2:739818/91‑1AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT > 2:3574378/1‑91AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 2:3413005/91‑1AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 2:2713106/91‑1AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 2:1090680/91‑1AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 1:6460268/91‑1AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 1:514664/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGTTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 2:5337334/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 1:2029544/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 1:2128071/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 1:4888172/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 2:969886/91‑1 ACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTT < 2:2595456/91‑1 ACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTT < 1:4773568/91‑1 CAAACAAACTTTACGCCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAAGTTAAATTAACGTTAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATGAGGGGTTTC < 2:793130/91‑1 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:1998498/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:5594896/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:2966181/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC < 2:2467437/91‑1 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:364195/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:5110824/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:5110702/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:4828726/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC < 2:5258411/91‑1 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGATTC > 2:2703259/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATATCAAAATAAGAGGTTTC > 2:579739/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATAATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCACAAAATAAGAGGTTcc > 2:580855/1‑89 AAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCA > 1:1424284/1‑91 AAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCA < 1:280023/91‑1 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCAC > 2:508806/1‑91 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCAC < 2:5326723/91‑1 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCAC > 2:3550314/1‑91 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCAC > 2:1582476/1‑91 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCAC < 1:4083007/91‑1 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCAC < 1:3964629/91‑1 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAACAAAAAAGTTGAAATCTCATAATAAGAGGTTACAC > 2:784063/1‑91 ACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAATAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACC > 1:5796634/1‑91 ACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACa > 2:6015921/1‑90 ACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACC > 1:2233411/1‑91 ACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACC < 2:1815858/91‑1 ACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACC < 1:2452510/91‑1 ACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACC > 2:1856713/1‑91 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT < 1:5694583/91‑1 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT < 2:5162457/91‑1 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT < 1:6265079/91‑1 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT > 2:400698/1‑91 AAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTT > 1:5016365/1‑91 AAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTT < 1:6916171/91‑1 AACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTT < 2:5706485/91‑1 AACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTT < 1:1694408/91‑1 AACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTT < 1:4331961/91‑1 AACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTT < 2:6702203/91‑1 ACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTT > 2:2012664/1‑91 ACTTTACACCGTGAAACAAAATAAACATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTAAAATCTCAAAATAAGAGGAATCAACTTTT > 2:6061227/1‑91 CTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT > 2:1291368/1‑91 CTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT < 1:6246316/91‑1 CTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT < 2:3296983/91‑1 CTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT > 1:6155120/1‑91 CTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT < 2:5687045/91‑1 CTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT < 1:6905901/91‑1 CTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT < 2:2449786/91‑1 AATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTT < 2:5681079/91‑1 AATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTT < 2:362691/91‑1 AATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTT > 1:834781/1‑91 TTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTAATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCAC > 2:264361/1‑91 AAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAAGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAG > 2:6645533/1‑91 GGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGT > 2:2094617/1‑91 TGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTT > 2:465211/1‑91 ATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTT > 2:4556419/1‑91 CAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCAC > 2:6196907/1‑91 AAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAAC < 1:4454343/91‑1 TTTCATCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATT < 2:3996826/91‑1 TTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATT < 1:4613318/91‑1 TTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATT < 1:1125670/91‑1 TTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTCGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATT < 1:6762433/91‑1 TTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTAGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATT < 1:6762514/91‑1 TTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTT < 1:2179417/91‑1 TTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTT < 1:3330779/91‑1 TTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTT < 1:3641845/91‑1 TTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTT < 1:5219805/91‑1 TTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTT > 2:2967703/1‑91 CACCTTTTTTATTGTTGATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCT < 2:6655365/91‑1 CACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAATGTTTGTTTGTTTTCACGTGTACAGAATTTCT > 2:286245/1‑91 CACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAATTTTGTTTATTTTCACGTGAACAGAATTTCT < 2:3165097/91‑1 CACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCT < 1:5687045/91‑1 CACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCT < 1:1537440/91‑1 CACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCT < 1:6997437/91‑1 ACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTT > 1:1481570/1‑91 ACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCT > 1:2344330/1‑90 ACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCT < 2:2344330/90‑1 CCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTC < 1:1907355/91‑1 CCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTC > 1:4182799/1‑91 CTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCA > 2:3839163/1‑91 TTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCAT < 2:5230290/91‑1 TTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATT > 2:1145547/1‑91 TTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATT > 1:5927280/1‑91 TTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTT > 1:2404241/1‑91 TTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTT > 1:6172042/1‑91 TTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTC > 2:5919509/1‑91 TTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTCA > 1:6473400/1‑91 AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1662101‑1662000‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTCA > USA300TCH1516_ALE/1662039‑1662128 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |