| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_pgi | 2900306 = | 183 (1.010) | 22 (0.140) | 20/244 | 16.2 | 11.5% | intergenic (‑33/‑286) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein |
| ? | NC_000913_3_pae_pgi | 2900346 = | 176 (1.100) | intergenic (‑73/‑246) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGTGAGAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_pae_pgi/2900470‑2900306‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaagttacctttctCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTAT > NC_000913_3_pae_pgi/2900346‑2900494 TGTGAGAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACGGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATATTGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGG < 1:1420616/150‑1 TGAGAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATTCTCGGAGGCTAAAAATTATCTGCAGTGACCAGAGATGATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGG > 1:185801/1‑150 TGAGAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGG > 3:943140/1‑150 GAGAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGA < 2:120868/150‑1 AGAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAA > 1:962810/1‑150 AGAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAA < 1:1752722/150‑1 GAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCTCGGGGGAAG > 4:1076202/1‑150 GAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAG > 3:721651/1‑150 GAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAG > 4:656574/1‑150 AGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGT > 2:1713639/1‑150 AGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGT > 2:474923/1‑150 GTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTT < 1:631101/150‑1 TAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTA > 3:492166/1‑150 TAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTA < 2:621782/150‑1 TAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTA > 3:492060/1‑150 acCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACC > 1:561835/3‑150 ATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACC < 2:388983/150‑1 TCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCT > 2:582405/1‑150 TCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCT > 2:551357/1‑150 TCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCT > 1:1584853/1‑150 CACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTT < 3:852032/150‑1 CACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTAACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTT > 1:1054499/1‑150 ACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTT > 4:207297/1‑150 TGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGA > 1:664825/1‑133 TGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGA < 2:664825/133‑1 GAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGG < 1:1819147/104‑1 GAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGG > 2:1819147/1‑104 ATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGCAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACCGGAGATAATTTTTAGCATAAGAGCATAAC > 4:721274/1‑150 TAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGC < 1:1501844/140‑1 TAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGC > 2:1501844/1‑140 AGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCG > 2:117101/1‑150 AGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTAC < 1:313782/81‑1 AGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTAC > 2:313782/1‑81 CTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGTATAAG > 3:321917/1‑116 CTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGTATAAG < 4:321917/116‑1 AAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAAGTAACTTCCCTCTCGCTGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGCTAACTGGAGATAATTTTTAGCACAAGGGCATCACTGCTAAAGTGATCGTTATCACACTGTGATAATCGTA > 4:1149359/1‑150 TCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAA > 1:174577/1‑150 AGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGC > 1:472554/1‑150 GGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGAT > 3:120133/1‑150 GGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACA > 1:755594/1‑103 GGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACA < 2:755594/103‑1 TAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTTATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCCTAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTT < 1:1156617/130‑1 TAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTTATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTT > 2:1156617/1‑130 TAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTA < 2:472554/150‑1 AACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTAC > 3:882744/1‑150 ACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACT > 4:1187319/1‑150 ACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACT > 1:566211/1‑150 CTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGGGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTC > 2:1726008/1‑150 CTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTC < 3:1187319/150‑1 TTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCT > 3:458076/1‑150 CCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCA < 3:1149359/150‑1 GGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTC > 3:809030/1‑150 GGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTC > 1:907998/1‑150 GGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACTCCTCT > 4:962903/1‑150 GGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCT < 4:458076/150‑1 GGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAA > 1:1915229/1‑143 GGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAA < 2:1915229/143‑1 GAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAA > 1:1233573/1‑51 GAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAA < 2:1233573/51‑1 AAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGC < 2:1080380/150‑1 AAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCT > 1:1154239/1‑134 AAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCT < 2:1154239/134‑1 AAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTT > 1:1630605/1‑109 AAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTT < 2:1630605/109‑1 AGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCT > 3:453117/1‑150 AGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCT < 2:873269/150‑1 TTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTT > 4:860232/1‑150 TTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTT > 4:429533/1‑150 TACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTC < 3:1045132/150‑1 ACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACCCCTCTGCTTTCC < 4:111361/150‑1 ACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCC < 3:1109781/150‑1 ACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCC < 1:1490937/150‑1 ACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCC > 2:357161/1‑150 CCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCA < 4:1222654/150‑1 CTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTC < 2:1414981/85‑1 CTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTC > 1:1414981/1‑85 TTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATG > 2:662907/1‑150 TCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTT < 2:674122/150‑1 CTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTA < 1:138044/150‑1 TCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTAT > 4:75229/1‑150 TCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTAT > 1:1188705/1‑150 TCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATT < 1:1776765/85‑1 TCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATT > 2:1776765/1‑85 TCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATGTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCTTGTTAT > 4:562872/1‑150 TGTGAGAGTAATCACGCTTCTGCTTTTTAAAATTATTTGACAATACGAATATCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_pae_pgi/2900470‑2900306‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaagttacctttctCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTAT > NC_000913_3_pae_pgi/2900346‑2900494 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |