| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_pae_pgi | 1,823,788 | C→A | L92M (CTG→ATG) | cho → | endonuclease of nucleotide excision repair |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_pae_pgi | 1,823,788 | 0 | C | A | 97.1% | 233.2 / ‑3.3 | 68 | L92M (CTG→ATG) | cho | endonuclease of nucleotide excision repair |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (39/27); total (40/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGACACCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCACGAG > NC_000913_3_pae_pgi/1823646‑1823929 | tGACACCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCt > 1:697528/1‑150 (MQ=255) gACACCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCtt < 2:805521/150‑1 (MQ=255) acCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGTATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGaa < 4:281701/150‑1 (MQ=255) acCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGaa < 1:876390/150‑1 (MQ=255) ccATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAg < 2:893586/150‑1 (MQ=255) gCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATGAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGcgcg > 1:220907/1‑150 (MQ=255) gCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGcgcg > 2:235306/1‑150 (MQ=255) cGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGAt > 3:14757/1‑150 (MQ=255) cGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGAt < 3:224764/150‑1 (MQ=255) tatCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGGCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGCTTAATCaa > 2:434359/1‑150 (MQ=255) atCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCaaa < 3:24849/150‑1 (MQ=255) tCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCCCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAg > 2:13880/1‑150 (MQ=255) cGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGa > 3:497525/1‑150 (MQ=255) aaCATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTg < 3:88151/150‑1 (MQ=255) cATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGtt < 1:235306/150‑1 (MQ=255) cATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGtt > 2:565143/1‑150 (MQ=255) cATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGtt < 1:566629/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCGCGTCGTTTCTCATTTACCGACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCTCCGGTTAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTtaat < 4:404376/150‑1 (MQ=255) cgcgTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACgg > 2:371832/1‑150 (MQ=255) gcgTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTACTAAACGGt > 2:254749/1‑150 (MQ=255) tttCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGcgcc > 1:222667/1‑150 (MQ=255) tttCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGcgcc > 1:670528/1‑150 (MQ=255) tttCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGcgcc > 3:351034/1‑150 (MQ=255) tctcATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAAc < 4:105448/139‑1 (MQ=255) tctcATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAAc > 3:105448/1‑139 (MQ=255) aTTTACGGACCCCGGATGAAGCCGCCGTGCTAAGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATc < 4:348990/150‑1 (MQ=255) aCGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCa > 1:432571/1‑150 (MQ=255) aCGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCa < 2:313623/150‑1 (MQ=255) cGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAg < 4:454878/150‑1 (MQ=255) cccGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCAACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCtg > 2:885984/1‑150 (MQ=255) ccGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGaa > 3:281850/1‑84 (MQ=255) ccGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGaa < 4:281850/84‑1 (MQ=255) cGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGCTCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAACGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCtgtg > 1:781182/1‑150 (MQ=255) cGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATAACGACGGACCAGCTGGATATGTACCGAAGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTACTCAAAGAACAACAGCCGCTGTCTAATCAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCcgtc > 2:39215/1‑149 (MQ=255) aTGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGccc < 1:577359/150‑1 (MQ=255) gccgccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCaa > 2:35150/1‑150 (MQ=255) ccgccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATc < 1:151879/86‑1 (MQ=255) ccgccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATc > 2:151879/1‑86 (MQ=255) ccgccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAAt < 4:159063/150‑1 (MQ=255) ccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTaa < 2:489157/150‑1 (MQ=255) cATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTaaa < 2:670528/150‑1 (MQ=255) gCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGa > 1:659255/1‑150 (MQ=255) gCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGACGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGa > 1:320084/1‑150 (MQ=255) cTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGaa > 1:180596/1‑150 (MQ=255) cTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGaa > 1:249528/1‑150 (MQ=255) aCGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGaaaa > 2:875800/1‑150 (MQ=255) aCGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTACCCTGCAATTAAATGaaaa > 2:881407/1‑150 (MQ=255) cGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAg > 1:342417/1‑150 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAgcgc < 1:779564/150‑1 (MQ=255) aaTCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATGAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGcgcg > 1:541520/1‑150 (MQ=255) cGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGAt > 1:237023/1‑150 (MQ=255) gACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGAtg > 2:509509/1‑150 (MQ=255) aGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTAt < 2:237023/150‑1 (MQ=255) cTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGc > 1:328665/1‑150 (MQ=255) gATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCaa > 1:424844/1‑150 (MQ=255) tACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGt < 1:565143/150‑1 (MQ=255) tACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGt < 2:362425/150‑1 (MQ=255) tACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCGCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGt > 3:568966/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTg > 1:699051/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTg > 1:538956/1‑150 (MQ=255) cgccgGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGAAATCGCCAGCTTTGTGCCCTGCAATGAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGa < 2:220907/150‑1 (MQ=255) gTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACACCAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAAATAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGAttttt < 4:14757/150‑1 (MQ=255) gTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGAttttt < 2:180596/150‑1 (MQ=255) gTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGAttttt > 1:72697/1‑150 (MQ=255) gAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCa > 4:248131/1‑150 (MQ=255) aTCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCACGa < 3:248131/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCACGAg > 2:667884/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGAGGTGGTGTATGCCAAAGCGGTGGATGTTTCACGac > 2:578307/1‑149 (MQ=255) | TGACACCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCACGAG > NC_000913_3_pae_pgi/1823646‑1823929 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |