Read alignment evidence... | |||||||||||
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Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
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aaaaaCAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGCGATTTTGCGCAACAAAGTCGTTTTAGATAATGCGAAAAAACAGCCTTTCCGGTACTCTACGGCGGtt > 2:646560/1‑107 (MQ=255) aaaCAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGCGATTTTGCGCAACAAAGTCGTTTTAGATAATGCGAAAAAACAGCCTTTCCGGTACTCTACGGCGGTTTTATCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTaaa < 1:758419/150‑1 (MQ=255) | AGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGATAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGCGATTTTGCGCAACAAAGTCGTTTTAGATAATGCGAAAAAACAGCCTTTCCGGTACTCTACGGCGGTTTTATCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAA > NC_000913_3_pae_pgi/2891943‑2892237 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |