| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_pgi | 2090108 = | 803 (4.750) | 86 (0.570) | 51/224 | 4.3 | 10.8% | intergenic (+62/‑84) | hisL/hisG | his operon leader peptide/ATP phosphoribosyltransferase |
| ? | NC_000913_3_pae_pgi | 2090141 = | 702 (4.670) | intergenic (+95/‑51) | hisL/hisG | his operon leader peptide/ATP phosphoribosyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
GCGCCAGCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_pae_pgi/2090270‑2090108‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cttccgggggctttTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAA > NC_000913_3_pae_pgi/2090141‑2090289 GCGCCAGCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATC > 1:872288/1‑150GCGCCAGCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATC < 4:1062349/150‑1GCGCCAGCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATC < 3:495814/150‑1 CAGCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCC > 4:1294320/1‑150 AGCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCG > 4:881488/1‑150 AGCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCG > 1:938342/1‑150 AGCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCG > 2:1074047/1‑150 GCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGG < 1:1159690/150‑1 AATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGG > 2:123603/1‑150 ATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGG > 1:631609/1‑150 ATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGG > 2:1917206/1‑150 TTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGC < 2:522073/150‑1 TTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTT > 4:188342/1‑142 GCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTT > 3:232918/1‑150 GCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTT > 3:821823/1‑150 GCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTT > 4:947761/1‑150 GCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTT < 1:1106184/150‑1 GCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTT > 1:1970053/1‑150 GCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGG > 4:601684/1‑146 GCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGG < 3:601684/146‑1 CTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCT > 2:513455/1‑135 CTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCT < 1:513455/135‑1 GATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTC < 2:979198/150‑1 TTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTT < 2:115803/122‑1 TGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTC > 2:1660930/1‑109 TGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTC < 1:1660930/109‑1 ATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTT > 1:1633435/1‑116 GTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTCTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAA > 3:851725/1‑150 GAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATT > 4:1113998/1‑106 TGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGG > 4:249697/1‑83 TGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGG < 1:207178/76‑1 TGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGG > 2:207178/1‑76 TTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAG > 2:136985/1‑121 TTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAG < 1:136985/121‑1 TTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGC < 1:276750/90‑1 TCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGG > 1:293501/1‑67 TCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGG < 2:293501/67‑1 CGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAA < 1:774546/144‑1 CGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAA > 2:1528277/1‑106 AATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGAC < 4:1014653/150‑1 AATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTT > 4:322306/1‑63 TAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTAC > 3:388325/1‑110 TAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTAC < 4:388325/110‑1 AAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGG < 2:440349/77‑1 AAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGG > 1:440349/1‑77 CCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTG > 1:17080/1‑135 CCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGG < 3:934594/124‑1 CCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACA < 1:1559803/86‑1 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CCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGATCAGACAGGTTTAAAGAGGCAGAACAAAAATACGGACAACACTCGGTTACGCATAGCTATACAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTt > 3:1104001/1‑149 CCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAA < 1:1051133/63‑1 CCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAA > 2:1051133/1‑63 CCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTCTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAA > 1:355094/1‑129 CCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTCTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAA < 2:355094/129‑1 CGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCT < 2:933626/150‑1 CGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAA < 1:1948565/87‑1 GGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGA < 4:456740/112‑1 GGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGA > 3:456740/1‑112 TCTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGT < 1:1467702/150‑1 CTTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAG > 3:29537/1‑93 tgCCGGGGGCGTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGGTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACACCACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGG < 2:501394/148‑1 TTCCGGGGGCTTTTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGCCAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGG < 2:1441351/150‑1 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TTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAA < 1:672869/150‑1 TTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGA > 3:465874/1‑120 TTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGA < 4:465874/120‑1 GCGCCAGCAATTCGCGTGAGTCATCACTTAAACGGCCGGATTTCTGCATAGCTATGCGTAAACGAGTGTTGTCTGTCATTTTGTTATTCCTCTTTAAACCTGTCTGAACCGTTATCAACCGCGCAATAAAAAAGCCCCCGGAAGGTGATCTTCCGGGGGCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_pae_pgi/2090270‑2090108‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cttccgggggctttTTTATTGCGCGGTTGATAACGGTTCAGACAGGTTTAAAGAGGAATAACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAA > NC_000913_3_pae_pgi/2090141‑2090289 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |