| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_hsa_pgi | 3,440,086 | C→A | G315V (GGC→GTC) | rpoA ← | RNA polymerase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_hsa_pgi | 3,440,086 | 0 | C | A | 97.3% | 303.3 / NA | 110 | G315V (GGC→GTC) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base A (62/45); total (63/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGC > NC_000913_3_hsa_pgi/3439941‑3440231 | acaGCCTCGCGATGGCTGCGGTGGCGGATCAGCTGACGACCACTCTTCCGATGGCGCATGCCCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTACCCTGCGATCCGGTTACTCGTCCGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCa < 2:1071238/147‑1 (MQ=255)aTAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCa > 1:964156/1‑149 (MQ=255) aGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCaga > 1:1578200/1‑149 (MQ=255) aGCCTGGCGATGGCTGCTGGTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGAAGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAACACCTTAACCTGAGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGGGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCaga < 2:567400/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCTATGCTTGACGGTGGCCAGTTTTCAAGGCGCATTACCagag > 1:164525/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGATGGCTGGTGTTGCGGATCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGGATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAgaga < 1:1128629/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGAGGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTACGACCTTAGCCTGTGATCCGGTTACTCGTCGGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGGTTTCCAGGCGCGTGAGCagagc > 2:1120186/1‑148 (MQ=255) tGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACa > 1:668112/1‑149 (MQ=255) tGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACa > 2:237775/1‑149 (MQ=255) gCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCAAGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGAGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGt > 2:1111432/1‑149 (MQ=255) gctgctGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACgg > 2:1653067/1‑149 (MQ=255) gctgctGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACgg < 1:837612/149‑1 (MQ=255) gctgctGTTGCGGTTCAGTTCACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGAGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACgg < 1:308573/149‑1 (MQ=255) ctgTTGCGGTTCAGTTGACGCCCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTACAACCTTAACCTGGGATCCGGTTACTAGTCATCGATGCTTGCCGGTGGCCAGATTTCCAGGCGCATGACCAGGGACAGTCCACGGGAAg > 2:1035613/1‑149 (MQ=255) ttGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCa > 1:865866/1‑149 (MQ=255) ttGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCa > 1:402020/1‑149 (MQ=255) ttCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGt > 1:865857/1‑149 (MQ=255) cAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCt < 1:481439/149‑1 (MQ=255) aGTTGACGACCACTCTTCCGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCtt < 2:536561/149‑1 (MQ=255) aGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCGAGTTTTCCAGTCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCtt > 1:281307/1‑149 (MQ=255) gTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCCGCGATGTTTGCCGGTGGCGAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCttt > 2:1557363/1‑149 (MQ=255) gTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCAGTGCACCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCttt > 1:1574336/1‑149 (MQ=255) ttGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTTCTGGTCAGAGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGCTGCCAGCTCTTCTTTa > 1:253926/1‑149 (MQ=255) gacgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAAt > 1:458097/1‑149 (MQ=255) cgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAAtct < 2:357450/149‑1 (MQ=255) acCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCa < 2:69133/149‑1 (MQ=255) cACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCTGTTAGTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGTCCAGTTATGCTGGCGCATGACCACACACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGGCTTTAATCTCAGt > 2:1133582/1‑149 (MQ=255) aCTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGGATGACCAGAGACAGTCCACGGGTAGCCATCAAGTCTTTAATCTCAGTa > 2:718506/1‑149 (MQ=255) aCGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGGGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGCCAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTAATGAAGAGAt > 1:1530816/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAtttt > 2:4495/1‑149 (MQ=255) tGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAttttt < 2:1359240/149‑1 (MQ=255) tGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTAGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACTGGAAGCCAGCAAGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAttttt > 1:1095639/1‑149 (MQ=255) ggCGCATGACGTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCCGCCATGCTTCCCGGAGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGACGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAtttttt > 1:1316873/1‑149 (MQ=255) 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ccTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGtt > 2:42694/1‑149 (MQ=255) cTTATCCTTCTCAGTAAATCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCTATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTACGAGATTTTTTACCAAGGTTa < 1:1043557/149‑1 (MQ=255) ttATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAg < 1:1272239/149‑1 (MQ=255) tATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAgg < 2:229260/149‑1 (MQ=255) aTCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGc < 1:818907/149‑1 (MQ=255) 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tgtgATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTa > 2:1164459/1‑149 (MQ=255) tgATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACg > 1:1330546/1‑149 (MQ=255) tCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGAGCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGATAGGCGTTTTAAGGAGATGAACCTCGGTACGCTg > 2:442299/1‑149 (MQ=255) ccGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCAAGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCATTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGt > 2:843456/1‑149 (MQ=255) cGGTTACTCGGCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGGCATTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTa < 1:317300/149‑1 (MQ=255) 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tGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCACTAATAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTGTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAg < 2:964156/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGGCTTTATTCTCAGTAAGAGCTTTTTTACGAAGGTTAGGCGGTGTAAGGAGCTCCACCTCGGTACGCTGTCCCAGATCCCCGCTTTAgg > 2:1475556/1‑148 (MQ=255) cTTGCCGCTGGCCAGTTTTACAGGAGCCAGACAAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGAAAGAGAATTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTg < 2:253926/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGAt < 1:42694/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCt < 2:668112/149‑1 (MQ=255) ccAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGCGCTCAACCTCGGTACGCTGTACGAGATCTACGATATAGTGGATTGCTTCTg > 1:1548136/1‑149 (MQ=255) ccAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTg < 2:865857/149‑1 (MQ=255) ccAGTTTTCCAGGCGCACGCCCAGACTCAGTCCACGGTTAGCCAGCACGTCTATAATCTCAGTAAGAGCTTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTg < 2:157812/149‑1 (MQ=255) cAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCCGCACGACTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTAAAGGAGCGCGACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGc > 1:890080/1‑149 (MQ=255) gTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCtt < 1:373967/149‑1 (MQ=255) 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cAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGc > 2:476478/1‑149 (MQ=255) cggCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCa > 2:573290/2‑149 (MQ=255) aGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGcc > 2:1559385/1‑148 (MQ=255) aGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCa > 2:566827/1‑149 (MQ=255) aGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCa > 1:736117/1‑149 (MQ=255) aGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCa < 2:458097/149‑1 (MQ=255) aGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCa > 2:12397/1‑149 (MQ=255) aGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCa > 2:145552/1‑149 (MQ=255) gcgcATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATAACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTGAAGGCAGt > 1:159580/1‑149 (MQ=255) gcATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTa < 2:1028864/149‑1 (MQ=255) aTGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGc > 1:594059/1‑149 (MQ=255) aTGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGc > 1:946688/1‑149 (MQ=255) | ATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGC > NC_000913_3_hsa_pgi/3439941‑3440231 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |