| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_hsa_pgi | 3,440,087 | Δ2 bp | coding (942‑943/990 nt) | rpoA ← | RNA polymerase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_hsa_pgi | 3,440,086 | 0 | C | . | 100.0% | 1157.8 / NA | 252 | coding (944/990 nt) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (132/120); total (132/120) | |||||||||||
| * | NC_000913_3_hsa_pgi | 3,440,087 | 0 | C | . | 100.0% | 1157.8 / NA | 252 | coding (943/990 nt) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (132/120); total (132/120) | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
GAACATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTA > NC_000913_3_hsa_pgi/3439937‑3440229 || aGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGTTCCGGTTACTCGTCATCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGcagagac < 2:2365833/150‑7 (MQ=255) tGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTc > 2:1409278/1‑150 (MQ=255) gCGATGGCTGCTGATGCGGTTCAGTTGACGACCACTATTACGATGGCGCATGACCTTATACTACTCAGTAAAACCATAACATGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGATTTCCAGGCGCATG‑‑AAGAGACAGTccc > 1:55462/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACgg < 1:3060078/150‑1 (MQ=255) ctgctgTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCGTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAg > 2:160012/1‑150 (MQ=255) actgTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGcc > 1:1922464/2‑150 (MQ=255) ctgTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCa > 1:3781267/1‑150 (MQ=255) tgTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAg > 2:2192870/1‑150 (MQ=255) ttGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTCCGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCa < 2:3062969/150‑1 (MQ=255) tGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCAc > 1:3946562/1‑150 (MQ=255) tGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCAc > 1:502255/1‑150 (MQ=255) gCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGCTGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACg > 1:3389298/1‑150 (MQ=255) gTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCCCGTCt > 2:2762303/1‑150 (MQ=255) gTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCt > 2:1162878/1‑150 (MQ=255) cAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTa < 1:1781553/150‑1 (MQ=255) cAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTa < 1:2081069/150‑1 (MQ=255) aGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTaa > 1:901463/1‑150 (MQ=255) cgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAg > 2:2972929/1‑150 (MQ=255) cgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAg > 1:1183687/1‑150 (MQ=255) cgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAg > 2:3395206/1‑150 (MQ=255) cgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAg > 1:786604/1‑150 (MQ=255) acCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTa < 1:359665/150‑1 (MQ=255) ccACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTaa > 1:1591399/1‑150 (MQ=255) tctTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAgaga < 2:63902/150‑1 (MQ=255) ctTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAt > 1:409442/1‑150 (MQ=255) ttACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAtt > 2:3464127/1‑150 (MQ=255) aCGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAtttt < 2:3781267/150‑1 (MQ=255) aCGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAtttt < 2:3106503/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAttttt > 1:1658657/1‑150 (MQ=255) cGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAttttt > 1:3174909/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACTGTCCACGGGAAGCCAGCCCGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTa > 2:561545/1‑150 (MQ=255) ggCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTAcc < 2:533411/150‑1 (MQ=255) gcgcATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCa > 2:740146/1‑150 (MQ=255) aTGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAggc < 2:1332466/150‑2 (MQ=255) aCCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAg > 1:1945020/1‑150 (MQ=255) aCCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGGCAGCGAGGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAg < 2:2602738/150‑1 (MQ=255) cTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGc < 2:2324513/150‑1 (MQ=255) cTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGc > 1:1083105/1‑150 (MQ=255) cTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGc > 2:733135/1‑150 (MQ=255) ttATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGGTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGATGGCCAGTATTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCAAGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCg > 1:260598/1‑150 (MQ=255) tCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGttt > 2:4090383/1‑150 (MQ=255) ccTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCCGGGGCCAGGTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGtttt < 2:3381360/150‑1 (MQ=255) cTTCTCCGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTa < 1:2554280/150‑1 (MQ=255) cTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTa > 1:60325/1‑150 (MQ=255) cTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTa < 1:2393660/150‑1 (MQ=255) ttCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTaa > 2:2019542/1‑150 (MQ=255) tctcAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAg < 2:3214812/150‑1 (MQ=255) ctcAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAgg < 1:1015722/150‑1 (MQ=255) ctcAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGGTAGGCGTTTTAAgg < 1:432072/150‑1 (MQ=255) aGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGc > 1:3006673/1‑150 (MQ=255) gTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTATTCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTAAGGCGTTTTAAGGAGCt > 2:619686/1‑150 (MQ=255) gTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCt > 2:3925826/1‑150 (MQ=255) aaaCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCAAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCCGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGGTAGGCGTTTTAAGGAGCTCaa > 1:156536/1‑150 (MQ=255) aaaCCTTAACCTGTGATCCGGGTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCaa < 1:1031415/150‑1 (MQ=255) aaCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAAc < 1:558944/150‑1 (MQ=255) aCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAAcc > 1:2475421/1‑150 (MQ=255) ttAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAATAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCg > 2:2910249/1‑150 (MQ=255) tAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCgg < 1:1436579/150‑1 (MQ=255) aaCCTGTGATCCGGGTACTCGTCAGCGATGGGTGCCGGTGGCCTGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGt < 1:4170855/150‑1 (MQ=255) tgtgATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGc < 1:2192870/150‑1 (MQ=255) gtgATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCt < 1:2802111/150‑1 (MQ=255) gATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGt > 2:1956192/1‑150 (MQ=255) aTCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTa > 2:3627631/1‑150 (MQ=255) ccGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTAcc > 2:2265488/1‑150 (MQ=255) cGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGCCAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCa > 1:2893439/1‑150 (MQ=255) ttACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGTCCAGTTTTACAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCACAGTAAGAGTTTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGAt < 1:3708087/150‑1 (MQ=255) cTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCAc < 1:1308678/150‑1 (MQ=255) tCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCAcc < 2:1083105/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCg > 1:4022889/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCg > 1:589627/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGa < 2:3694026/150‑1 (MQ=255) gTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGa < 2:1229485/150‑1 (MQ=255) gATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGt > 2:478715/1‑150 (MQ=255) gCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTATTCTCAGTAAGAGAGTTTTTACCAAGGGTAGGCGTTTTAAGGAGCTCCACCTCGGTACGCGGTACCAGATCACCGATTTAGTggc > 1:2968976/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGAt < 1:2629913/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGAt < 1:1239198/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGAGATAGTGGCTAg > 2:433029/1‑150 (MQ=255) gTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCt < 2:3304030/150‑1 (MQ=255) gTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACAAAGTTTACGCTTTTTAAGGACCTCAACCTCGTTACGCTGTACCACATCACCCATATAGTGGATAGCttat > 2:1772864/1‑148 (MQ=255) ggCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGc < 1:1413551/150‑1 (MQ=255) gCCAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCt > 2:2076142/1‑150 (MQ=255) ccAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTTAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCtt > 1:722964/1‑150 (MQ=255) ccAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCtt > 2:1678251/1‑150 (MQ=255) cAGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCttt > 1:2250847/1‑150 (MQ=255) aGTTTTCCAGGCGCATG‑‑GAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGGACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGTCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTa < 2:1487615/150‑1 (MQ=255) aGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTa > 2:2734743/1‑150 (MQ=255) aGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTa < 1:733135/150‑1 (MQ=255) aGTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGGCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTa < 2:1926358/150‑1 (MQ=255) aGTTTTCAAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTGTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGTATAGCTTCTGCTTTa > 1:3835307/1‑150 (MQ=255) gTTTTCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTaa > 1:2748424/1‑150 (MQ=255) ttttCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAg < 2:3851693/150‑1 (MQ=255) tttCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAgg < 1:3248279/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGc < 2:836113/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCa > 1:2419585/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAg < 1:2964386/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAg > 1:1881433/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGt > 1:1106442/1‑150 (MQ=255) aGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGtt > 2:2899599/1‑150 (MQ=255) aGGCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGtt < 2:1282738/150‑1 (MQ=255) ggCGCATG‑‑CAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATATTTTACCAAGGTTAGGCGTGTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTATGCTTTAAGGCAGTTa > 1:67000/1‑150 (MQ=255) || GAACATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTA > NC_000913_3_hsa_pgi/3439937‑3440229 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |