New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_000913_3_bme_pgi 716720 =288 (1.180)17 (0.110)
+TATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATT		 8/128 18.8 8.2% intergenic (‑123/+1) ybfG/ybfI pseudogene/pseudogene
?NC_000913_3_bme_pgi 720995 = 302 (1.240)intergenic (+155/+61) ybfK/kdpE uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

ATTACTGAAACCGGTATTGGGTATCGGTTTATGCTTTGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  NC_000913_3_bme_pgi/716759‑716720
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAA  >  NC_000913_3_bme_pgi/720995‑721029
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
ATTACTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTT           <  2:4656568/100‑1
ATTACTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTT           <  1:5003358/100‑1
ATTACTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTT            <  2:4465142/99‑1
ATTACTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTT            <  2:4465085/99‑1
ATTACTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTT            <  2:3113693/99‑1
ATTACTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAAGTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTT           <  1:4745908/100‑1
ATTACAGAAACCGGTATAGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTT           <  1:5069886/100‑1
 TTACTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTA          <  2:5632901/100‑1
    CTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAAn        <  2:377431/99‑2
    CTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATT       <  1:2428707/100‑1
    CTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATT       <  1:2165336/100‑1
    CTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATT       <  1:1094383/100‑1
    CTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAAT        <  1:761091/99‑1
    CTGAAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAAT        <  1:3238925/99‑1
       AAACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAA     <  1:1600202/99‑1
         ACCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAA  <  1:4162731/100‑1
          CCGGTATTGGCTATCGGTTTATGCTTTGAATATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATTAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAAT    <  2:4401022/97‑1
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
ATTACTGAAACCGGTATTGGGTATCGGTTTATGCTTTGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  NC_000913_3_bme_pgi/716759‑716720
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAA  >  NC_000913_3_bme_pgi/720995‑721029

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.