New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 228108 | NA (NA) | 30 (0.230) | 20/246 | 11.5 | NA | noncoding (2350/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
? | NC_000913_3_bme_pgi | = 228124 | NA (NA) | noncoding (2366/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_bme_pgi/227956‑228108 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgcTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < NC_000913_3_bme_pgi/228124‑227976 AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑C < 3:943104/150‑1 AACGTTGACCCGTAATCCGGGATGCGGACAGTGTCTGGNGGGTAGNGNGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGCCGGACAACAGGAGGGTAGGGCAGTGGCATAAGCCCGCTT‑‑G‑A‑C > 3:357555/1‑150 ACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT < 1:1112832/150‑1 ACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT < 2:857807/150‑1 ACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACGGGGGCGGTCTCCTCCGAAAGAGTAACGGAGGGGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT < 2:1373996/150‑1 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 3:667876/150‑1 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 3:289541/150‑1 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 2:1561748/1‑150 GTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCG < 2:622871/150‑1 TTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGC < 2:1103388/150‑1 TGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCacc < 2:486619/150‑4 TGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 3:55480/150‑1 TGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 3:293499/150‑1 TGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 3:16675/150‑1 TGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 4:909022/150‑1 TGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 2:1314950/150‑1 GACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA > 3:525895/1‑146 GACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 4:525895/146‑1 GACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCCT‑‑G‑A‑CT < 4:125830/125‑1 GACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCCT‑‑G‑A‑CT > 3:125830/1‑125 GTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGG > 4:549683/1‑150 GTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGG < 3:549683/150‑1 GTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT < 2:1555410/110‑1 GTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT > 1:1555410/1‑110 TTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 1:321897/127‑1 TTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA > 2:321897/1‑127 TTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 3:403538/108‑1 TTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 4:403538/1‑108 TTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAGGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 2:219175/126‑1 TTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAGGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA > 1:219175/1‑126 CTGGGGCGGCCTCCTCCTAAAGGGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAA < 2:818775/150‑1 GGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACC < 1:1023825/150‑1 GTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 4:871521/95‑1 GTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 3:871521/1‑95 CTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 2:1165168/109‑1 CTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA > 1:1165168/1‑109 CGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT > 2:879495/1‑74 CGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT < 1:879495/74‑1 ACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTC < 3:849709/77‑1 ACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTC > 4:849709/1‑77 ACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑C < 1:459638/64‑1 ACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑C > 2:459638/1‑64 TTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCTGCTTTCGCACCTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCT > 2:677936/1‑150 TAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCG < 1:1531005/72‑1 TAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCG > 2:1531005/1‑72 AATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCTGCTTTCGCACCTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCG < 1:677936/150‑1 GGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCT < 2:433198/75‑1 GGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCT > 1:433198/1‑75 ATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTAT > 2:479535/1‑52 ATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTAT < 1:479535/52‑1 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACTGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGC > 3:622936/1‑150 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGC > 3:480671/1‑150 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGC > 4:616556/1‑150 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGC > 4:144027/1‑150 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCA < 3:414172/138‑1 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCA > 4:414172/1‑138 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACC > 2:747581/1‑133 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACC < 1:747581/133‑1 TGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCA < 4:561540/150‑1 TGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGA > 4:71842/1‑139 TGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGA < 3:71842/139‑1 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCca < 4:959046/150‑3 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA < 3:414809/150‑1 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGA > 2:1133981/1‑110 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGA < 1:1133981/110‑1 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGGTTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTA < 4:323536/128‑1 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGGTTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTA > 3:323536/1‑128 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC > 3:843937/1‑150 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < 2:553518/150‑1 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < 3:529942/150‑1 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < 3:529934/150‑1 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA > 3:766289/1‑149 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA < 4:766289/149‑1 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTA < 2:162083/96‑1 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTA > 1:162083/1‑96 AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_bme_pgi/227956‑228108 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgcTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < NC_000913_3_bme_pgi/228124‑227976 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |