| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 381056 = | NA (NA) | 5 (0.100) | 5/90 | NT | NA | coding (159/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' |
| ? | AP009048 | 381083 = | NA (NA) | coding (186/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/381131‑381056‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggagaGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCT > AP009048/381083‑381152 CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGTAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC > 1:3857536/1‑71CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC > 1:958907/1‑71CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC > 1:2772106/1‑71CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:3120317/71‑1CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC > 1:409017/1‑71 TGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:5089633/1‑71 gtaTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:717535/4‑70 GTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:2360630/1‑70 GTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:5116379/1‑70 GTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:3920494/1‑70 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:1789088/71‑1 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:3617250/71‑1 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:1383843/70‑1 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:1389998/70‑1 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:2902233/1‑69 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:3446600/1‑69 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:3145893/1‑69 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:1189321/1‑69 CTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:2088426/1‑68 tggGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:2622464/4‑70 TGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAtg > 1:4002174/1‑69 TGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:4728174/1‑70 TGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:3795315/1‑70 TGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:4103437/68‑1 TGCGAAGCAGCGCCAATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:2895579/1‑70 GCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:1871916/1‑69 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAATATGGTGTATACGGAG < 1:702334/68‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA < 1:3130886/69‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:219718/68‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:3389334/1‑68 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:4921811/68‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:965800/68‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:4902891/1‑65 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:74886/1‑65 GAAGCAGCGCCCATACCCCACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:3728596/1‑64 AAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:2301248/64‑1 AGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA < 1:5192996/66‑1 AGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:158528/65‑1 AGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:713879/1‑62 AGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG < 1:1163391/62‑1 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:4776144/61‑1 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AACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:3947343/42‑1 ACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:5148593/38‑1 CCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:199768/40‑1 TACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA > 1:151094/1‑39 ACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:2804912/35‑1 CGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:4602983/1‑36 TCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGT > 1:4103770/1‑52 CCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTC > 1:2449666/1‑47 CGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTC > 1:3536769/1‑46 GATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAG < 1:2065255/71‑1 ACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGG > 1:5018199/1‑50 TATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTG < 1:4634232/47‑1 TACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCT > 1:2744665/1‑47 CGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGG < 1:739135/69‑1 CGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGA > 1:580210/1‑66 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |