| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | = 20030 | NA (NA) | 3 (0.060) | 3/92 | NT | NA | coding (285/504 nt) | insB | IS1 transposase InsAB' |
| ? | AP009048 | = 20039 | NA (NA) | coding (276/504 nt) | insB | IS1 transposase InsAB' | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP009048/19956‑20030‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcaccCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCAC < AP009048/20039‑19970 CGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:4857861/1‑71CGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:1981894/1‑71CGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:1253326/1‑71CGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:4930346/1‑71 GCTTTCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:5237896/1‑70 GCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATC < 1:4988296/71‑1 GCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATC < 1:3881456/71‑1 GCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:1350394/1‑70 GCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:525205/1‑70 GCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT < 1:3291018/70‑1 GCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:3130045/1‑70 GCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:20415/1‑70 GCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:1642191/1‑70 GCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT < 1:517510/70‑1 CTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCA > 1:4091598/1‑71 CTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATC < 1:2774127/70‑1 CTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGGCATCCATATC < 1:4053205/70‑1 TTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC > 1:1277158/1‑71 TTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATC > 1:1005486/1‑69 TGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC > 1:1902169/1‑70 TGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC > 1:4970129/1‑70 TGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC > 1:2549839/1‑70 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC < 1:4763387/70‑1 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC < 1:736558/70‑1 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC < 1:3081391/70‑1 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:665372/69‑1 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:1926705/69‑1 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:1367824/69‑1 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:3675093/69‑1 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:1607629/69‑1 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:3235235/69‑1 GCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:2861860/69‑1 ACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT < 1:2663992/59‑1 TGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCA < 1:4481136/58‑1 CTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCCTTTGACGTGGTGATA < 1:234316/71‑1 CTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATC > 1:2067519/1‑52 TCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:5238566/1‑48 CAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATAT > 1:5080271/1‑42 GGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCA > 1:560693/1‑39 GGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCA > 1:567038/1‑39 GGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:3820796/39‑1 GATTCATACAGCGGGCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:653606/38‑1 TTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:589739/36‑1 TTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCA > 1:4964753/1‑35 GGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCCTTTGACGTG > 1:1989448/1‑37 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCT > 1:3616529/1‑71 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCT < 1:4537166/71‑1 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCT < 1:1492360/71‑1 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCT < 1:681319/71‑1 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGC > 1:3361838/1‑70 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGC < 1:2006065/70‑1 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGC < 1:5133818/70‑1 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGC < 1:4995318/70‑1 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAG < 1:4478712/69‑1 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTG < 1:3316049/60‑1 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCACGCCTGAAGGGAAAGCT > 1:1441323/1‑71 TCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATG < 1:1414646/49‑1 CACCCTTTGACGTGGTGATATGTATGACGGATGGCTGGCCGC < 1:3658333/42‑1 CACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:382946/1‑71 CACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:4087933/1‑71 CACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:1850438/1‑71 CACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:1162994/1‑71 CACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:2348835/1‑71 CACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCT < 1:223627/70‑1 CACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCT > 1:1156429/1‑70 CACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTG < 1:623432/44‑1 CACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGC > 1:1185711/1‑39 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGC < 1:4572700/71‑1 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGC < 1:1882703/71‑1 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:4414598/1‑70 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:4618885/1‑70 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG < 1:4646170/70‑1 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:1415514/1‑70 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:1437965/1‑70 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG > 1:4032592/1‑70 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTG < 1:2874440/70‑1 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCT < 1:3032855/69‑1 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGG > 1:3747197/1‑62 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCC > 1:3816534/1‑52 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCC > 1:328073/1‑52 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAA > 1:3726499/1‑49 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTG > 1:3953316/1‑43 ACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGC > 1:1895525/1‑41 CCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCA > 1:4205678/1‑71 CCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCA < 1:2189981/71‑1 CCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCA > 1:3026106/1‑71 CCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAG > 1:1047287/1‑60 CCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAA > 1:1581678/1‑48 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCAC > 1:5130194/1‑71 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCAC > 1:4809370/1‑71 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCAC > 1:301353/1‑71 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCAC > 1:654914/1‑71 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCAC > 1:1879560/1‑71 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGG > 1:598256/1‑60 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTA < 1:4908063/43‑1 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTA > 1:3503106/1‑43 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTA < 1:2103212/43‑1 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTA > 1:1461682/1‑43 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGT < 1:5012886/42‑1 CCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGC > 1:271902/1‑39 CGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP009048/19956‑20030‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcaccCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCAC < AP009048/20039‑19970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |