| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 204740 | NA (NA) | 14 (0.240) | 6/84 | NT | NA | noncoding (157/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | Exported | = 204751 | NA (NA) | noncoding (168/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Exported/204663‑204740‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA < Exported/204751‑204682 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1105618/71‑1GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:2356333/1‑71GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:2577290/1‑71GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:3722622/71‑1 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:2621416/71‑1 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:4362951/71‑1 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:3641751/71‑1 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3027156/1‑71 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:3688587/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:3096593/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:224213/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1992311/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT < 1:2771717/70‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAACAT < 1:1132214/70‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:2667873/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:73764/70‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGGGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:829834/70‑1 GATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAGCCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:277794/1‑70 AACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:2849417/1‑64 AACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT < 1:2733945/60‑1 GTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1433175/57‑1 TTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:3576818/1‑56 TTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:2003464/1‑56 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:2116236/1‑57 AACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC < 1:2661399/55‑1 AACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:2558206/1‑54 AACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:3803552/1‑54 CGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA < 1:4177618/71‑1 CGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA < 1:1257591/71‑1 CGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA < 1:4341255/71‑1 CGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:3359568/45‑1 GCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:91930/1‑50 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1688268/44‑1 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1537861/44‑1 TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:3311180/1‑45 TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:3904480/1‑45 TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA > 1:2952005/1‑44 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:1722960/1‑44 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:1635644/1‑44 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:1392886/43‑1 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:3836987/43‑1 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:3625116/1‑42 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:672861/1‑42 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:1653677/1‑42 TCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:3082572/1‑43 CGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:1481657/1‑39 CGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:127742/1‑39 CGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:2368152/1‑39 GAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC < 1:1060170/41‑1 GGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:2142856/51‑1 TTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTA < 1:1612225/36‑1 TTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTA < 1:2870017/36‑1 TTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTA < 1:1963403/36‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:2404287/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:1615564/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCC < 1:903802/55‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCC < 1:3071482/55‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTC < 1:3380318/36‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:3121672/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:4176296/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCC < 1:2304297/55‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTT > 1:2176705/1‑50 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:4155083/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:4314885/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1640621/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:1429534/70‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:3479896/70‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAAT > 1:3819877/1‑64 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCC > 1:1852660/1‑52 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCC > 1:1271372/1‑52 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCC > 1:2646240/1‑52 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCC > 1:1575168/1‑52 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT > 1:1140704/1‑44 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:1506238/44‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:2874275/1‑42 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:54761/1‑42 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA < 1:1550044/42‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA < 1:3050509/42‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAA < 1:4096387/61‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:2528816/60‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:3940936/60‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:558652/60‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2190299/1‑37 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:423237/35‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:1904482/35‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTT > 1:3228239/1‑70 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:804592/1‑36 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1126006/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:3996116/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1438955/1‑68 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAA > 1:86588/1‑60 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:644184/1‑38 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:1459353/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT > 1:4405387/1‑70 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:2384794/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:2282529/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGCTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:1769368/70‑1 CCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA > 1:1831928/1‑71 CCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA < 1:847908/71‑1 CCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA < 1:3738775/71‑1 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Exported/204663‑204740‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA < Exported/204751‑204682 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |