| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 2859968 = | 88 (1.560) | 3 (0.070) | 3/82 | NT | 5.1% | intergenic (‑48/‑118) | ygbI/ygbJ | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted dehydrogenase, with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
| ? | AP009048 | 2860005 = | 40 (0.880) | intergenic (‑85/‑81) | ygbI/ygbJ | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted dehydrogenase, with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain | |||||
ATTGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGTGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/2860047‑2859968‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttatgtgaaTCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAAC > AP009048/2860005‑2860074 ATTGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATT > 1:699236/1‑71ATTGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATT > 1:2765971/1‑71ATTGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATT > 1:4262565/1‑71ATTGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATT > 1:3824750/1‑71ATTGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGCTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATT > 1:549232/1‑71 TTGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTT < 1:1152244/71‑1 TTGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTT < 1:517416/71‑1 TGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTT < 1:2078915/70‑1 TGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTT < 1:423747/70‑1 GTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTA > 1:1496916/1‑71 GTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTT < 1:2939889/70‑1 TGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTAT > 1:3966647/1‑71 AATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGT < 1:4552593/71‑1 ATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGTG < 1:975752/71‑1 ATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGTG < 1:448162/71‑1 ATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGTG < 1:3959155/71‑1 ATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGT > 1:4551652/1‑70 ATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGTGAA > 1:3400207/1‑71 ATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGTGAA > 1:3394111/1‑71 GAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATG < 1:3335814/57‑1 TAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATT < 1:4686892/47‑1 AACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTT > 1:520538/1‑48 CGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTCTGTGTTATTTT > 1:2634203/1‑46 GTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTA > 1:5050859/1‑45 GTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTA > 1:3819210/1‑45 GTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTT > 1:2723743/1‑44 GTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTT > 1:4477574/1‑44 ATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGT‑TGTTATTTTATGTG < 1:3210574/46‑1 CTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGT > 1:645512/1‑38 AAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCAC > 1:1267729/1‑70 AAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCT < 1:3248723/52‑1 TTAACATTGTGTGTTATTTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAG > 1:3317675/1‑54 TTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCA < 1:4350317/57‑1 TTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCAC < 1:4085747/50‑1 GTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCA > 1:1130877/1‑44 GAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAA < 1:4602611/57‑1 ATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAAC < 1:2211517/71‑1 ATTGTGAATATAAGCGCTGGAAGATAACGGTATGGTGATCTGATTCACATAAATTAACATTGTGTGTTATTTTATGTGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/2860047‑2859968‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttatgtgaaTCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAAC > AP009048/2860005‑2860074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |