| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 205293 | NA (NA) | 5 (0.070) | 3/92 | NT | NA | noncoding (710/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | Exported | = 205316 | NA (NA) | noncoding (733/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
AGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Exported/205220‑205293‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggttCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATAC < Exported/205316‑205247 AGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAG < 1:400262/71‑1AGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAG < 1:2074239/71‑1AGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAG < 1:1867003/71‑1AGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAG > 1:3188140/1‑71 GTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGG > 1:1996804/1‑71 TCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT < 1:3545119/71‑1 TCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT > 1:3093377/1‑71 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |