| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | DH1 | 4,549,890 | Δ6 bp | coding (1051‑1056/1266 nt) | rhlB → | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | DH1 | = 4549889 | 20 (0.060) | 332 (1.050) | 190/290 | 0.0 | 94.8% | coding (1050/1266 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| ? | DH1 | 4549896 = | 17 (0.050) | coding (1057/1266 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB | |||||
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ACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCCGC > DH1/4549746‑4550046 | gaagttacccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaa < 4:104471‑M2/1‑1 (MQ=255) tttacccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCg > 5:1233586‑M2/148‑151 (MQ=255) tttacccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCg > 4:634891‑M2/148‑151 (MQ=255) ttacccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCgg > 4:936008‑M2/147‑151 (MQ=255) ttacccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCgg > 3:690524‑M2/147‑151 (MQ=255) tacccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGt > 6:1206053‑M2/146‑151 (MQ=255) tacccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGt > 3:786049‑M2/146‑151 (MQ=255) acccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTc > 1:539913‑M2/145‑151 (MQ=255) acccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTc > 7:971019‑M2/145‑151 (MQ=255) ccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCAc < 4:1202673‑M2/9‑1 (MQ=255) tggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCActct > 3:1154042‑M2/140‑151 (MQ=255) ggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCActct < 1:1140088‑M2/12‑1 (MQ=255) atctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttaaccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATc > 6:996652‑M2/135‑149 (MQ=255) ggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAg < 8:273472‑M2/17‑1 (MQ=255) ggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCt < 8:350377‑M2/20‑1 (MQ=255) ggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTg < 8:876855‑M2/21‑1 (MQ=255) gatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTgg < 5:1054031‑M2/22‑1 (MQ=255) gatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTgg > 7:1079947‑M2/130‑151 (MQ=255) attctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCgt > 1:562255‑M2/127‑151 (MQ=255) ctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGtgtg > 6:21760‑M2/124‑151 (MQ=255) tgcttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgaattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTTGCGagtg > 8:641266‑M2/123‑150 (MQ=255) ggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCgtgt < 7:583346‑M2/27‑1 (MQ=255) ggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGa > 2:722505‑M2/122‑150 (MQ=255) gttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAag < 6:157888‑M2/31‑1 (MQ=255) ttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGa > 5:667828‑M2/120‑148 (MQ=255) ttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGa > 5:141863‑M2/120‑148 (MQ=255) ttgccaccgacgttgccccgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaacattacgttcaccgtattggtcgtacagctcgcgcaAGCGGTCACTCTATAAGCCTGGCGTGTGa > 6:524578‑M2/120‑148 (MQ=255) tgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAaga < 4:424077‑M2/32‑1 (MQ=255) gccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAagag < 3:345282‑M2/33‑1 (MQ=255) ccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGt > 1:213410‑M2/117‑150 (MQ=255) caccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTAt > 3:1240842‑M2/116‑151 (MQ=255) accgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATg > 3:52667‑M2/115‑151 (MQ=255) ccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGc < 2:206562‑M2/38‑1 (MQ=255) ccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGc > 1:1238708‑M2/114‑151 (MQ=255) gacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCAt > 8:171061‑M2/112‑151 (MQ=255) ccgttggcgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacacgatgactgtgtagattaggttcaccgtattggtcgttcaggtcgcgcaAGCTGTGACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGATTATGCAtt < 2:746583‑M2/41‑1 (MQ=255) acgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCAtt < 7:67148‑M2/41‑1 (MQ=255) gttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGa < 3:85560‑M2/43‑1 (MQ=255) 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tacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACa > 1:696203‑M2/54‑150 (MQ=255) cccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATc > 5:867996‑M2/52‑151 (MQ=255) ctgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATcc > 1:39457‑M2/51‑151 (MQ=255) ccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGC‑AATACAATCCg > 2:1017577‑M2/51‑151 (MQ=255) gatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCgg > 6:847185‑M2/49‑151 (MQ=255) atgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGa < 7:1179723‑M2/104‑1 (MQ=255) gaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATtg < 1:792674‑M2/111‑1 (MQ=255) aagatttcgttcaccgtataggtcgtagaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTTTCAGCGTGGGGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTGAATTGCGGTAATCAAATACAATCCGGACGCAttgag < 4:795561‑M2/113‑2 (MQ=255) aCGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATtga < 1:1050512/150‑1 (MQ=255) agattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATtgatg < 7:171269‑M2/114‑1 (MQ=255) gattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATtgatga < 7:893101‑M2/115‑1 (MQ=255) attacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATtgatga < 4:449840‑M2/115‑1 (MQ=255) attacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGAc < 7:1253802‑M2/116‑1 (MQ=255) acgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCg > 5:396109‑M2/33‑150 (MQ=255) cgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGAt < 4:1138332‑M2/120‑1 (MQ=255) gttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATc > 8:647286‑M2/31‑151 (MQ=255) accgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGCCCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCCGACGCATTGATGACCCATCAGcc > 3:468656‑M2/27‑151 (MQ=255) ccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCa < 5:294023‑M2/126‑1 (MQ=255) tggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAAc > 3:111337‑M2/20‑149 (MQ=255) cgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACgcgc > 1:233854‑M2/5‑151 (MQ=255) caAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGccc < 8:922656‑M2/149‑1 (MQ=255) aAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCgcccc > 6:744824‑M2/2‑150 (MQ=255) | ACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCCGC > DH1/4549746‑4550046 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |