| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 245504 | 58 (0.110) | 561 (1.060) | 243/300 | 0.0 | 63.5% | coding (618/1500 nt) | pitA | Low‑affinity inorganic phosphate transporter 1 |
| ? | DH1 | 4010290 = | 587 (1.110) | intergenic (‑543/‑84) | yjhB/insG | MFS transporter membrane protein/transposase | |||||
Only 100 of 1153 total aligned reads displayed.
GTATTTCTTTGCTTTTCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTC > DH1/4010140‑4010440 | gtggcattcatgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggct < 1:1554011‑M2/1‑1 (MQ=255) tggcattcatgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggct > 3:741397‑M2/150‑150 (MQ=255) ggcattcatgttcacgacgaagcctgctggcgcgacgcgaatcaataccaagataacgagaccaatgcctttctgagcatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacggcgataggggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTa < 2:381575‑M2/2‑1 (MQ=255) ggcattcatgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTaa < 8:1124915‑M2/3‑1 (MQ=255) tCTTTGCTTTTCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGc > 4:762472/1‑151 (MQ=255) catgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCg < 8:224094‑M2/8‑1 (MQ=255) atgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGAt < 1:771449‑M2/10‑1 (MQ=255) tttCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCa < 6:1281793/149‑1 (MQ=255) tcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAg < 1:1000379‑M2/13‑1 (MQ=255) caccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGtt > 8:338409‑M2/137‑151 (MQ=255) caccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGtt < 7:1448072‑M2/15‑1 (MQ=255) tCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGtt > 8:1745663/1‑150 (MQ=255) gTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTaa < 7:23065/149‑1 (MQ=255) acgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAgg > 4:1240923‑M2/133‑151 (MQ=255) aagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatactcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATc > 2:1774742‑M2/130‑151 (MQ=255) aagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATc > 5:1117086‑M2/130‑151 (MQ=255) aagcctgcgggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATc < 5:933156‑M2/22‑1 (MQ=255) aCCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATc > 4:1597764/1‑150 (MQ=255) 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cctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGt < 5:1005734‑M2/25‑1 (MQ=255) tttATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGtt > 4:1026052/1‑151 (MQ=255) taCCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGAcc > 5:1889518/1‑151 (MQ=255) cgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGAt < 2:669044‑M2/33‑1 (MQ=255) tGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATc > 4:1985811/1‑151 (MQ=255) tGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATc > 8:1455445/1‑151 (MQ=255) cgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCAATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATcc > 6:678389‑M2/117‑151 (MQ=255) gacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATcc > 8:513583‑M2/116‑150 (MQ=255) gacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATcc > 8:1550674‑M2/116‑150 (MQ=255) ataCCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCAAATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACAAAGATTAATGCCTATCAGTTAAGGATCAGTTGACATATCCAGt > 5:1192349/1‑151 (MQ=255) gccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTg < 8:868935‑M2/39‑1 (MQ=255) ccAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGc > 2:815942/1‑151 (MQ=255) cAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCt > 1:472718/1‑151 (MQ=255) cAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCt > 4:639597/1‑151 (MQ=255) tcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCtgt > 2:565090‑M2/108‑151 (MQ=255) 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ttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGtt < 4:401465‑M2/71‑1 (MQ=255) ccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGAtt > 5:61469‑M2/73‑151 (MQ=255) gTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGAttttt < 7:950638/150‑1 (MQ=255) tACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGAttttttt > 3:1068321/1‑150 (MQ=255) aCTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTAt > 5:1513492/1‑151 (MQ=255) 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ttGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTg < 6:1675207/150‑1 (MQ=255) atagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTgg < 7:634911‑M2/112‑1 (MQ=255) tGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGt > 5:1288112/1‑151 (MQ=255) cggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATc < 7:782184‑M2/116‑1 (MQ=255) aGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTAt < 1:302837/150‑1 (MQ=255) gCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATcc < 7:1772511/151‑1 (MQ=255) tGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCg > 7:1861659/1‑151 (MQ=255) aggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGtt > 8:1876516‑M2/31‑151 (MQ=255) tcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACg > 3:83353‑M2/27‑150 (MQ=255) gTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATtc > 7:383327/1‑151 (MQ=255) gTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATtc > 3:1230555/1‑151 (MQ=255) cAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTg > 6:917409/1‑151 (MQ=255) atacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGc < 2:1989195‑M2/133‑1 (MQ=255) aaaCACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGc < 1:571401/151‑1 (MQ=255) aaaCACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGc < 2:1378650/151‑1 (MQ=255) acgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGt < 4:1415565‑M2/135‑1 (MQ=255) cacCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGt > 7:1608758/1‑150 (MQ=255) acCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTa > 5:247002/1‑150 (MQ=255) gtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCACGTTACGATTCTCTGCgtaaac > 7:1098613‑M2/13‑149 (MQ=255) cAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTg > 3:472782/1‑150 (MQ=255) aGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACt < 3:1937141/151‑1 (MQ=255) ttAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTtct > 2:1208418/1‑151 (MQ=255) | GTATTTCTTTGCTTTTCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTC > DH1/4010140‑4010440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |