| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,537,741 | 0 | G | A | 9.9% | 242.4 / 3.4 | 93 | intergenic (+27/‑6) | yfeK/yfeS | uncharacterized protein/WGR domain protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/40); new base A (2/8); total (45/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.21e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
ATCGATTACTGGGAAGCCGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCACGATGAAAAATCGAATAAATTTTGGTGGATAGATTACGAAGGGGATAGTTTAGCTGTCAACTATGGCAAGGTAGGTAGTATTGGTAAATTCCAGACAAAAGAGTTCGATAATGAAGAACA > NC_000913/2537594‑2537889 | aTCGATTACTGGGAAGCCGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACaggagg > 2:458303/1‑149 (MQ=255) tCGATTACTGGGAAGCCGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGGAATTAATCCGCGTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGt > 1:1735422/1‑149 (MQ=255) ttACTGGGAAGCCGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACa < 2:1263278/149‑1 (MQ=255) tACCGGGAAGCCGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACAt < 1:707593/149‑1 (MQ=255) aaGCCGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGaaaaaa < 1:1816376/149‑1 (MQ=255) ccGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGc > 1:1021950/1‑149 (MQ=255) tataTTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCttt > 1:871336/1‑149 (MQ=255) tgAAGATCCCCGGTAAGAGAGAAAAGAAAACAAAGCCTTTTTTACATTCGTTAAATGCGAAGACGGAAAAAACGGAACCTGCGGAACGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAACGCTTTATTTATc < 2:693370/149‑1 (MQ=255) gAAGCTCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTGGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCa < 1:1710305/149‑1 (MQ=255) gAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCAGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCa < 1:347043/149‑1 (MQ=255) aaGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCAc > 1:631644/1‑149 (MQ=255) aaGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCAc > 1:632137/1‑149 (MQ=255) gATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCACGa < 1:652744/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |