| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 331646 | 86 (0.840) | 3 (0.030) | 3/258 | NT | 3.4% | intergenic (+150/‑725) | betT/yahA | choline transporter of high affinity/c‑di‑GMP‑specific phosphodiesterase |
| ? | NC_000913 | = 331653 | 89 (0.930) | intergenic (+157/‑718) | betT/yahA | choline transporter of high affinity/c‑di‑GMP‑specific phosphodiesterase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTATTGCATAAAACCGCGCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTT > NC_000913/331500‑331793 | ttATTGCATACAACCGCGCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTGCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTACCATCTATTGATGATTACCATACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAAc < 1:429717/149‑1 (MQ=255)ttATTGCATAAAACCGCGCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAAc > 2:235416/1‑149 (MQ=255) tATTGCATAAAACCGCGCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGCCAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAAcc > 2:1075469/1‑149 (MQ=255) gCATAAAACCGCGCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACa < 2:680451/149‑1 (MQ=255) aTAAAACCGCGCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACAtt < 1:602765‑M2/149‑3 (MQ=255) aaCCGCGCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTAAAtttggg < 1:1245043‑M2/149‑7 (MQ=255) aCCGCGCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACAtttgggc > 2:1043100‑M2/1‑142 (MQ=255) cgcgCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACAtttggtctg < 1:159344‑M2/149‑10 (MQ=255) tCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTGCCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTAGCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATg > 2:1793993/1‑149 (MQ=255) cTGCATATGGCGCTGTTACTCCTACCTCTTGGTACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGt < 2:689395/149‑1 (MQ=255) tGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGGTATATCTAGACGGTTAAGCCCTTAGTATCGAGTGATGATTACCAAACACCAGATAATAACCAAGCAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGtt > 2:456898/1‑149 (MQ=255) cATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATACAAAAAAAAAGATCTATAGCTGCCCAACACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCa > 2:1357270/1‑149 (MQ=255) atatGGCGCTTTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTACGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCaa < 2:1790964/149‑1 (MQ=255) atatGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGttaca > 2:387096/1‑146 (MQ=255) atatGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCaa > 1:1197612/1‑149 (MQ=255) atatGGCGCTGTTTCTCCTACCGCTTGATACGTTATATCGATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACAtttgggctgcaatagttcttttc > 2:236746‑M2/1‑126 (MQ=255) atGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATa > 2:1036625/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAATGTAGGTtttgggctgcaatagttcttttcttt < 2:211865‑M2/149‑27 (MQ=255) ggCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACACCAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCCATAAg > 2:529680/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTTCATTTGGGCTGTTGCGTATGTTCAATAAg > 1:552915/1‑149 (MQ=255) cgcTGCTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTCAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGtt < 2:1272435/149‑1 (MQ=255) gcTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATATGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGttt > 2:322782/1‑149 (MQ=255) aCCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGATTAGTCTTATTTaa > 2:295344/1‑149 (MQ=255) ctctTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATg > 2:571583/1‑149 (MQ=255) ctctTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATg > 1:464923/1‑149 (MQ=255) ctctTGATACGTTATATCTATACGGCTAAGCCCTTAGTATCTATTGAAGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATg > 1:1014087/1‑149 (MQ=255) aTACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAata > 1:1652195/1‑149 (MQ=255) aCGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATAtt > 2:1259629/1‑149 (MQ=255) tgtgtgatCTAGACGTTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCTAAAACCTACATTTGGGCTGTTACCAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTg < 1:1715578/143‑1 (MQ=255) cGTTATATCTATACGGTTAATGCCTTAGGATCTATTGATGACTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTg < 2:903740/149‑1 (MQ=255) gTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGc > 1:732141/1‑149 (MQ=255) tataTCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTg > 2:923126/1‑149 (MQ=255) atatCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGa > 1:1652923/1‑149 (MQ=255) tataCGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAACAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAGACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTGGTCGTATTTAATGTAGATATTGCTGATCAtt > 1:1434251/1‑149 (MQ=255) taCGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGACACTAAGAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTATAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCAtttc > 2:9509/1‑148 (MQ=255) ggTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACACAAGCTAAGCGAACAGAAAAGAACTATGGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTGGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGaaa < 1:140843/149‑1 (MQ=255) ggTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAacctacatttgggctgcaatagttcttttcttttttattatctgttgtctggtaatcatcaatagatactaagg > 1:211865‑M1/1‑75 (MQ=255) ggTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCCACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGaaa < 1:6228/149‑1 (MQ=255) tAAGCCCTTAGGATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGa < 1:281224/149‑1 (MQ=255) aaccgttAGGATTTATTGATGATTACCAGACAAAAGATAATAAAAAAGAAAAGAACCATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACg < 1:174832/144‑1 (MQ=255) ccTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAATGTAGGTtttgggctgcaatagttcttttcttttttattatctgttgtctggtaatcatcaatagatactaagggcttaacc > 1:211865‑M2/1‑74 (MQ=255) cTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAAGAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGGTCATTTGAAATGACGCatt > 1:1105908/1‑149 (MQ=255) cTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGGCTTGTTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGCAAGGACGCatt > 2:931217/1‑149 (MQ=255) tAGTATCTATTGCTGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCattat < 1:660317/149‑1 (MQ=255) gTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTc < 1:510575/149‑1 (MQ=255) tATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCa < 1:705452/149‑1 (MQ=255) aTCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACCTTTGGACTGTTGCGAATGTTCAATAAGATTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCAt > 1:1670612/1‑149 (MQ=255) aTCTATTGATGACTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCAt < 1:409210/149‑1 (MQ=255) aTTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATgaga > 1:1028236/1‑149 (MQ=255) aTTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATgaga > 1:1028630/1‑149 (MQ=255) ttGATGATTACCAGACTACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTACGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGaa > 1:1144006/1‑149 (MQ=255) ttGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGaa > 1:1741914/1‑149 (MQ=255) ttGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGaa > 1:269526/1‑149 (MQ=255) atgatTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAGTGACGCATTATTCATTAGGAAtg > 1:694767/1‑149 (MQ=255) atgatTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAAtg > 1:1596605/1‑149 (MQ=255) atgatTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAAtg > 2:1029136/1‑149 (MQ=255) atgatTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAAtg > 2:46201/1‑149 (MQ=255) atTACCAGACAACAGGTAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATgtgt < 1:233949/149‑1 (MQ=255) atTACCAGACAACAGATAATAAAGAAGAAAAGAACTATTGCAGCGCAGAACCTACATTGGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATgtgt > 2:165756/1‑149 (MQ=255) 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caGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACAATTGGGCAGTTGCGAATGTTCAATAAGATTAGCCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGAAGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCaa > 2:749346/1‑149 (MQ=255) caGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATGGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCTTTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCaa < 1:1024098/149‑1 (MQ=255) aaGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCaa < 2:1146296/148‑1 (MQ=255) aGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAAc > 2:743609/1‑149 (MQ=255) ataataAAAAAGAAAAGAACTATTGCGGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTg < 2:841737/149‑1 (MQ=255) 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aagaaaagaaCTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACg > 2:880504/1‑149 (MQ=255) gaaaagaaCTATTGCAGCCCAAAtgtaggttttgggctgcaatagttcttttcttttttattatctgttgtctggtaatcatcaatagatactaagggcttaaccgtatcgatataacgtatcaagcggtaggagaaacagcgccatat > 2:236746‑M1/1‑23 (MQ=255) aagaaCTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAAcc > 1:1749687/1‑149 (MQ=255) gaaCTATTGCAGCCCAGAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCAt < 2:1421361/149‑1 (MQ=255) aaCTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCAtt > 1:924329/1‑149 (MQ=255) aaCTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCAtt > 1:668824/1‑149 (MQ=255) aCTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAACTGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCAttt < 1:1203122/149‑1 (MQ=255) ttGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATAAACTGAACTTAACGCCAAGATTTGTTa > 2:1037398/1‑149 (MQ=255) tGCAGCCCAAACCCTACAGTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTAt < 2:953392/149‑1 (MQ=255) gCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTAtt > 1:897268/1‑149 (MQ=255) cAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTTGTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAACTGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTAttt > 2:503470/1‑149 (MQ=255) cAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTAttt > 1:1543210/1‑149 (MQ=255) cAGACCAAAtgtaggttttgggctgcaatagttcttttcttttttattatctgttgtctggtaatcatcaatagatactaagggcttaaccgtatagatataacgtatcaagaggtaggagaaacagcgccatatgcagacatggcgcg < 1:159344‑M1/149‑141 (MQ=255) tcccAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGATAGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTaa < 2:240196/148‑1 (MQ=255) gCCCAAAtgtaggttttgggctgcaatagttcttttcttttttattatctgttgtctggtaatcatcaatagatactaagggcttaaccgtatagatataacgtatcaagaggtaggagaaacagcgccatatgcagacatggcgcggt > 2:1043100‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTaa < 1:1793993/149‑1 (MQ=255) cccAAAtttaggttttgggctgcaatagttcttttcttttttattatctgttgtctggtaatcatcaatagatactaagggcttaaccgtatagatataacgtatcaagaggtaggagaaacagcgccatatgcagacatggcgcggtt < 1:1245043‑M1/149‑144 (MQ=255) cAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCGTATTTAATGTAAATATTGCTGCTCATTTGAAATGCCGCATTATTCATGCGAAATGTGTATCGTAAATCACCTGAAATAAACGTAACCATTTTTTATTTATGGt > 1:849051/1‑149 (MQ=255) cAAAACCTACATCTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGAATAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGAAAACATGAGTTATTCAAgat > 2:1054805/1‑147 (MQ=255) aatgtaggttttgggctgcaatagttcttttcttttttattatctgttgtctggtaatcatcaatagatactaagggcttaaccgtatagatataacgtatcaagaggtaggagaaacagcgccatatgcagacatggcgcggttttat < 1:602765‑M1/149‑148 (MQ=255) aaaCCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGttt < 2:349368/149‑1 (MQ=255) | TTATTGCATAAAACCGCGCCATGTCTGCATATGGCGCTGTTTCTCCTACCTCTTGATACGTTATATCTATACGGTTAAGCCCTTAGTATCTATTGATGATTACCAGACAACAGATAATAAAAAAGAAAAGAACTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTT > NC_000913/331500‑331793 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |