| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,357,064 | C→A | 5.3% | D519Y (GAC→TAC) | cadA ← | lysine decarboxylase, acid‑inducible |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,357,064 | 0 | C | A | 5.3% | 218.1 / 2.7 | 76 | D519Y (GAC→TAC) | cadA | lysine decarboxylase, acid‑inducible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/39); new base A (2/2); total (35/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
TTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGC > NC_000913/4356916‑4357207 | tttttCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTtcgtc < 1:331018/149‑1 (MQ=255) ttCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAg < 2:527618/149‑1 (MQ=255) cGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCGGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTAttt < 2:638422/149‑1 (MQ=255) gCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTc > 1:106032/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGGCGAggcacttg > 2:560808/1‑143 (MQ=255) ggTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCTCGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAATAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTGTTTCGcc > 1:486640/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCa < 1:593673/149‑1 (MQ=255) tCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCGCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACg < 1:703940/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGGGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTACAAGTACCGTTGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGa < 1:360534/149‑1 (MQ=255) ggTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATg < 1:653646/149‑1 (MQ=255) gTCGAACGCCCGGTTAAGGTCAGTCAGAGCACGCCGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGGTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGc < 2:138459/149‑1 (MQ=255) gTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGc > 1:594625/1‑149 (MQ=255) tCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGTCTCAGTGCTTTGGTTTTATCGATACCGATTCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTTGTCGAGGTATTTTGCCTCGATGCt > 1:210807/1‑149 (MQ=255) tCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTCTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGGTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGGATTTCCCCCCGATGCt > 2:590390/1‑149 (MQ=255) aacgaacgTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCCGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGc < 1:27666/149‑1 (MQ=255) aCGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGcc < 1:71131/149‑1 (MQ=255) gcccGTTTAAAGTCCGCCAGCTCACGCCGCAGGCTTAGTGCTTTGGTCTTATCGACACCGATGCTGAACACGAACAGCAGGTTATACGGCCCGGGTTTCTCAAAAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCgg < 1:213270/146‑1 (MQ=255) aCGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCAGGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGaa > 2:710555/1‑149 (MQ=255) gTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGACTa < 2:131950/149‑1 (MQ=255) tttAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATAc > 2:737836/1‑149 (MQ=255) tAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCa < 2:127329/149‑1 (MQ=255) aaGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGTTGCTGAATAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGAAGCCCTGTTTGTGGAGGGATGTCGCCCCGATTATGGCCGGAATAcaaca > 2:377581/1‑145 (MQ=255) aaGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCaaa < 1:523471/149‑1 (MQ=255) gtcagAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAATGGCt > 2:448618/1‑149 (MQ=255) tcagAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTAGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTc > 2:83545/1‑149 (MQ=255) acagAGCACGCAGCAGGCTCAATGATTTGGTCTTATAGATACCGATGCTGAACAGGAACCACAGGCAATACGATATGGTTTTGTTAACAACTAAGACATGTTCGAAGAGGTATTTCGCCACGCTGCTGGCCGGAATACCCAAGACGCTc > 2:232076/2‑149 (MQ=255) cagAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCa > 2:732948/1‑149 (MQ=255) gagCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATg > 1:715959/1‑149 (MQ=255) cACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTg > 1:43171/1‑149 (MQ=255) cGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCGCGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGcc < 1:232105/149‑1 (MQ=255) gcagcaGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCCGAAGACCAAAGTCACCCAAGGTGCCg > 2:368073/1‑149 (MQ=255) cTCATTGCTTTGGTCTTAGCGATACCGATGCTGAACAGCAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTc < 2:22216/149‑1 (MQ=255) cTCAGTGCTTCGTTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTc < 2:123356/149‑1 (MQ=255) cTCAGGGCTTTGGTCTTAGCGATCCCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTc < 2:682808/149‑1 (MQ=255) cAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAAGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAATCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCa > 1:334569/1‑149 (MQ=255) cTTTGGTCGTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATcccc < 1:293454/149‑1 (MQ=255) tttGGTCTTATCGGTACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATTCCAAAGTTGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCg < 2:725825/149‑1 (MQ=255) ttGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCgg < 2:174529/149‑1 (MQ=255) tGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGa < 2:387695/149‑1 (MQ=255) ggTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTAACCGGCAATTTTTTGTCAACAGCGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGGATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAg > 2:311533/1‑149 (MQ=255) ttATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGGATACCAAAATCGCTCATGGTGCCGTCTTGTTACATACCCGGAGCcag > 2:245139/1‑149 (MQ=255) cGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAgg < 1:737836/149‑1 (MQ=255) cccGATGCTGAACAGGAACGGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGCGTCAGCAGGGTGa < 2:251964/148‑1 (MQ=255) ccGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGAc > 1:121151/1‑149 (MQ=255) cGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTTGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAATGTCGCTAAAGGTACTCTTGGTTTCCATCCCAGGTCTCAGCAGGGTGACt < 1:554498/149‑1 (MQ=255) gATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACtt < 2:362818/149‑1 (MQ=255) gCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCTGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGa < 1:218555/149‑1 (MQ=255) cTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTAGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGAt < 1:83545/149‑1 (MQ=255) cTGAACAGGAACAGCAGGTAATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTAGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGAt < 1:232076/149‑1 (MQ=255) tGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATc > 2:43882/1‑149 (MQ=255) tGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCACGGAGTCAGCAGGGTGGCTTTGGTc > 2:24047/1‑149 (MQ=255) aacgggaacagCAGGTTATACGGACCGGTTTGCTCAACAACGATGCCATGCTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCCGGCCGGAATACTAAAGTCGCTCATGGTGCAGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCgg < 2:604891/149‑1 (MQ=255) aacaggaacagCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACTAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCgg > 2:645070/1‑149 (MQ=255) acaggaacagCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGCCTTTGATCggg > 1:211678/1‑149 (MQ=255) acaggaacagCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCggg > 1:228928/1‑149 (MQ=255) acaggaacagCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCggg < 1:483370/149‑1 (MQ=255) caggaacggCTGGTTTTACGGCCCGGTTTTCTCAACAACGAGGCCATGATCGTCGCGGTATTTCGCCACGATGCGGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGt < 2:268351/149‑1 (MQ=255) acagCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGa < 1:467818/149‑1 (MQ=255) cagGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACa < 1:188716/149‑1 (MQ=255) tataCGCACCGGTGTTCTCAACAACGCTGCCAGGTTCGTCGAGGGATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGc < 1:241470/149‑1 (MQ=255) cGGACCGGTTTTCCCAACAACGATGCCAGGTTCGTCGAGGTATTTCGCCGAGGTGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGt < 1:21639/149‑1 (MQ=255) gACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTa < 2:654210/149‑1 (MQ=255) gTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATCCATGTGCTCGTTAtaggt > 2:751063/1‑145 (MQ=255) gTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGAt < 1:732948/149‑1 (MQ=255) gTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGAt > 1:537177/1‑149 (MQ=255) ttttCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCGCGTTCTCGCTg > 2:372156/1‑149 (MQ=255) ctcAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCACGATACATGTGCTCGTTATCGATGtttt > 1:467413/1‑149 (MQ=255) tcAACACCGATGCCATGCTCGTCGAGGTATTTCGCCATGCTGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGttttt < 1:606435/149‑1 (MQ=255) caacaaCGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTg > 1:371350/1‑149 (MQ=255) aacaacGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGTTCGGGTCAGGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGa > 1:445632/1‑149 (MQ=255) acaacGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCGGCAGGGTGACTGTAATCGGGTCAAGATACATGTGATCGTTATCGATGTTTTTTaa > 1:288041/1‑149 (MQ=255) caacGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAg < 2:106032/149‑1 (MQ=255) gATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGt < 1:674426/149‑1 (MQ=255) gATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGt > 1:714223/1‑149 (MQ=255) tGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCCGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGt < 2:416029/149‑1 (MQ=255) gTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTg > 2:201629/1‑149 (MQ=255) ttCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGc > 1:754553/1‑149 (MQ=255) | TTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGC > NC_000913/4356916‑4357207 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |