| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3186094 = | NA (NA) | 109 (1.020) | 81/296 | 0.2 | 95.6% | intergenic (+6/‑91) | yqiG/insC1 | pseudogene; fimbrial export usher family;putative membrane; Not classified; putative membrane protein/IS2 repressor TnpA |
| ? | NC_000913 | 3485933 = | 5 (0.050) | intergenic (‑117/‑185) | yhfA/crp | OsmC family protein/cAMP‑activated global transcription factor, mediator of catabolite repression | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
AACCCTTCGACCCACTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAGCGGCGTTA > NC_000913/3485785‑3486077 | gatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctac > 2:611897‑M2/149‑149 (MQ=255) ctcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatgaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctact < 2:1219380‑M2/2‑1 (MQ=255) tcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcatggggccagtctactt > 1:768874‑M2/147‑148 (MQ=255) tcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctactt < 1:156027‑M2/3‑2 (MQ=255) tcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctactt > 2:1465986‑M2/147‑148 (MQ=255) ccTTCGACCCACTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTTGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTAt > 2:861581/1‑149 (MQ=255) ccTTCGACCCACTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTACACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTAt > 1:429323/1‑149 (MQ=255) ttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttcagtgatattggttggctggaggttcagggggccagtctaCTATg > 2:30217‑M2/145‑149 (MQ=255) ttCGACCCACTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAACGCGACCTGGGTCATGCTGCAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGCAAGCTATGt < 1:689188‑M2/149‑2 (MQ=255) ttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagagtatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCt > 2:1282737‑M2/143‑149 (MQ=255) tcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattgcttgcctggagatttagggggccagtctacttaagaa < 2:1761877‑M2/8‑7 (MQ=255) cccACTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatt < 1:886189‑M2/149‑7 (MQ=255) cccctacccgcGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCACTTTTCCTGACAGAGTCCGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGCGACACCAGGAGCCACAAACCGAAAGCTCTGtggatttgc < 2:1548942‑M2/144‑10 (MQ=255) aCTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCACGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgt > 2:1306297‑M2/1‑140 (MQ=255) ggtacgccggctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTc < 2:224441‑M2/16‑1 (MQ=255) tacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcccccgctcggttgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAg > 1:1746318‑M2/132‑149 (MQ=255) cgccggcggcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGa < 1:441751‑M2/20‑1 (MQ=255) tCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctata < 2:332592‑M2/149‑17 (MQ=255) gccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTc > 1:569900‑M2/129‑144 (MQ=255) ccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATCCTAAAACAGTCAGGTTg > 2:1128157‑M2/128‑149 (MQ=255) tctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTa < 2:1653960‑M2/25‑1 (MQ=255) cTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTCATAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttcc > 1:1219359‑M2/1‑128 (MQ=255) ttGCATTTTTGCTCCTCCCCTCCGTCAATGTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttcca > 2:709804‑M2/1‑127 (MQ=255) ttGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttcca > 2:883157‑M2/1‑127 (MQ=255) tgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACa > 1:1067592‑M2/123‑149 (MQ=255) ttGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGCCATTCGAAGTGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagccatctg < 1:1023694‑M2/149‑31 (MQ=255) tccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACa > 1:7540‑M2/115‑149 (MQ=255) cggccctaagacatcaatcatctgttctctaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAAGAGTCAGGATGCTACAGTAATACAtt > 1:1089642‑M2/113‑149 (MQ=255) cTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGACGAGAGACAACAGGAGACACAAAGCGATAGCTATAtggatttgcccctatatttccagagatccgtta < 1:1122791‑M2/149‑34 (MQ=255) cTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca > 1:320564‑M2/1‑113 (MQ=255) tCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGCCCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttacagacatctgttataac < 2:1437567‑M2/149‑38 (MQ=255) taagaaatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTa < 2:158932‑M2/43‑1 (MQ=255) cggcgTCAATTTTCCTGACAGCGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCATGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa > 1:244678‑M2/3‑108 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCAt > 1:1539310‑M2/101‑149 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGCCAGGCTACTACAGTCATCCCTTGATGTACTGCAt > 1:1741507‑M2/101‑149 (MQ=255) aatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGCCAGGATGCTACAGTAATAGATTGCTGTACTGCATGTa > 2:135150‑M2/98‑149 (MQ=255) gtcatcgtttctccaatgactattctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagggatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTAGGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTAt < 2:444774‑M2/53‑1 (MQ=255) aaTTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta > 1:411678‑M2/1‑101 (MQ=255) catctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgaaattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAAAAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGc > 1:1390122‑M2/95‑149 (MQ=255) tctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCaa < 1:550352‑M2/57‑1 (MQ=255) tGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttggccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccg < 1:982266‑M2/149‑57 (MQ=255) tccaatgaccagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTCTGCTAAAACCGTCAGGATGCTACAGTAATACACTGATGTACCGCATGTATGCAAAGGACGt < 1:926751‑M2/64‑1 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTc > 1:1672998‑M2/85‑149 (MQ=255) aaaggactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggcgattcagggggccagtctcCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTca < 1:56173‑M2/66‑1 (MQ=255) cgcgGACTAGCCCAGCCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatattgccagacatctgttatcacttaactcattacaagcccgctgccgcaga > 1:938716‑M2/1‑83 (MQ=255) acgagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaacttatattgtttgtctggagattcagcgggccagtctaCTATTCTAAAACAGTCATGATGCTACAGTACTACATTGATTTACTGCATGTATGCAAAGGACTTCACATTa < 2:873349‑M2/71‑1 (MQ=255) tagtctaaaaactagtattaagactatccagttgttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTAcc > 1:1316009‑M2/77‑149 (MQ=255) cgTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagata < 1:27129‑M2/149‑69 (MQ=255) gtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatagtggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTCCCGt > 2:1237980‑M2/75‑149 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGGCGTCACATTAACGTg > 2:1411328‑M2/74‑149 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTg > 1:1572916‑M2/74‑149 (MQ=255) tatcaaaatcgcgAAACGGAAGGCGAGCGGGGGCATGCTGAAGCGAGACACCAGGGGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc > 1:67962‑M2/6‑76 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCa > 1:8326‑M2/72‑149 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCa > 1:440943‑M2/72‑149 (MQ=255) tAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacttctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc > 1:795833‑M2/1‑76 (MQ=255) aaactagtattaagactatcacttatttaagtgatgttggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCATTa > 2:1110085‑M2/69‑149 (MQ=255) aaTCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGGCATGCTGAAGCGCGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcg < 1:804082‑M2/149‑80 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATa > 2:520977‑M2/60‑149 (MQ=255) aCGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataac < 2:1687891‑M2/149‑89 (MQ=255) ggAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccc < 1:1594681‑M2/149‑91 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGcccc < 2:727010‑M2/95‑1 (MQ=255) gAAGGCGGCCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccca > 2:1395766‑M2/1‑58 (MQ=255) gAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccca > 2:429323‑M2/1‑58 (MQ=255) aCCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTAGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcact < 2:1164880‑M2/149‑99 (MQ=255) tGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatg > 2:1743729‑M2/1‑48 (MQ=255) gggTCATGCTTAAGCCGGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatttgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 2:1561140‑M2/1‑47 (MQ=255) gTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAAAGAAAATACTTGAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcccactatgcgg < 2:830452‑M2/149‑105 (MQ=255) cATGCTGGAGCGGGACGCCCGGAGACCCCAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccggacgtctgttatcacttaacccattgcaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggat > 2:1263463‑M2/1‑43 (MQ=255) cATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggattggcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccacagcactatgcggat < 2:1571269‑M2/149‑107 (MQ=255) gCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGttgatttgcccctatatttccagacatctgtaatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtgacgagcgataacccagcgcactatgcggatgcc < 1:1281954‑M2/149‑110 (MQ=255) gCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatgtgcccctatatttccagacagctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccccccgccctatgcggatgcc < 2:549404‑M2/149‑110 (MQ=255) cTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatatgttatgacttaacccgttacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgcca < 2:1524795‑M2/149‑111 (MQ=255) aaGCGAGACACCAGGGAACACAAACGCAAAGCTATGtggatttgcccctatattcccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattc > 1:1132614‑M2/1‑36 (MQ=255) aaGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagtgataacccagcgcactatgcggatgccattc > 1:874335‑M2/1‑36 (MQ=255) gttgtctggagattcagggggtcagtctaCTATGCTCAAACAGTCAGGATGCTACTGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCCAAGGAAGTCACATTATCATGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATAttt > 2:402050‑M2/30‑149 (MQ=255) gttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATAttt < 2:1390122‑M2/120‑1 (MQ=255) gCGAGACACCATGAGACACCAAGCGAAAGCTAGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgt > 2:699019‑M2/1‑34 (MQ=255) tgtctggagcttaagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGTATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCg < 2:351493‑M2/122‑1 (MQ=255) tgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCg < 1:1518433‑M2/122‑1 (MQ=255) gtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTTATACCTTGATGTACTGAATGTATGGTAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATttccg > 2:68057‑M2/27‑147 (MQ=255) ggcgggggattcagggggccagtctaCTATGCGAAAACAGTCGGGAGGCGACAGTAATACATTGGTGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGGGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCgg < 2:494532‑M2/123‑1 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGc > 2:1015704‑M2/26‑149 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGc < 1:626617‑M2/124‑1 (MQ=255) tggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCCTCTTTCGGCaa > 1:670699‑M2/24‑149 (MQ=255) acCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggctttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgtgatagtg < 2:2480‑M2/149‑123 (MQ=255) ccAGGCGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacacgcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgc > 2:897536‑M2/1‑26 (MQ=255) agattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATcc > 1:344441‑M2/21‑149 (MQ=255) ttcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCCGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCaga > 1:593711‑M2/18‑149 (MQ=255) ttcagggggccaggctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCaga < 1:78645‑M2/132‑1 (MQ=255) gagaCACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgccctatgcggatgccattcgttataatgctcga < 2:175104‑M2/149‑128 (MQ=255) gagaCACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcga > 1:1366276‑M2/1‑22 (MQ=255) gagaCACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgcgcga < 1:16510‑M2/149‑128 (MQ=255) agaCACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaa > 1:1452837‑M2/1‑21 (MQ=255) gccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAgcgg < 1:48884‑M2/140‑1 (MQ=255) aaGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatattcccagacagctgtaatcacttaacccactacaagcccgctgccgcagaaattcccgtggcgagcgataacccagcgcactattcggatgccctgcggaataatacacgaacgcctcc < 2:384506‑M2/149‑136 (MQ=255) ccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAgcggc > 1:1689626‑M2/9‑149 (MQ=255) ccagtctaCTATGCGAAAACAGTAAGGATGCAACAGTAATACTCTAAAGTACTGTATGTATGCAAAGGACGTCACATTCCCATGCAGTACAGTTGACAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAgcggc < 2:797813‑M2/141‑1 (MQ=255) aGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatctccagacatctgttatcacttaccccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctg > 1:110053‑M2/1‑13 (MQ=255) aGCCAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctg > 2:4224‑M2/1‑13 (MQ=255) aaaGCTATGtggatttgcccctatatttccggacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaag > 2:76622‑M2/1‑9 (MQ=255) | AACCCTTCGACCCACTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAGCGGCGTTA > NC_000913/3485785‑3486077 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |