Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB1–insA | insB1, insA |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1978503 | 1979278 | 776 | 109 [1] | [0] 109 | insB1–insA | insB1,insA |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1978502 | 1 (0.010) | 101 (0.990) | 78/280 | 0.2 | 99.5% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB1 | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/IS1 transposase B |
? | NC_000913 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978347‑1978502 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cataaatgTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATA > NC_000913/1979279‑1979426 TTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAAC < 2:89725/149‑1 ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAAT < 1:704184/149‑1 ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAAT < 2:422731/149‑1 ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAAT > 1:1162741/1‑149 AATGGGTCTTTACCCTTATCCAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATA < 1:9447/149‑1 TGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATGACGTAACATAAATGTATAAG < 2:395539/149‑1 GGGTCTTTACACTTAACTAAGATTTTTCCGAAATCGACGCAATTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGTGGCTGCGACTTTCAATAATGCGTGATGGAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGT < 2:81495/149‑1 TCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACTTAAATATGTAAGTCAT > 1:1559162/1‑149 CTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACACGTCACTACACGCACAGACAAAGGAGGGGGGCTGCGAATTTCAATAATGCGTGATGAAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGGCAT‑A > 2:604089/1‑149 TTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAAGGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑AC > 1:472175/1‑149 TTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGCCAT‑ACT > 1:1344032/1‑149 ACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTATCATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTT > 2:1119685/1‑149 CACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTT < 1:1643091/149‑1 CTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGT < 2:2946/149‑1 TTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTACCATAAATGTATAAGTACT‑ACTTTTGTT > 1:57850/1‑149 TTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTT > 1:15741/1‑149 CTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGG < 1:1630838/149‑1 TAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGG > 2:1385683/1‑149 AAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACACCGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAACACACTCAATTACGTGACATAAATGTATAAGTCATAATTTTTGTTTTGGt > 1:65863/1‑148 AAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTCTCAATAATCCGTGATGCAGATCAAACAAAACACTCAATTACTTAACATAAAAGTAAAAGTCAT‑ACTTCTGTTTTGGtg > 2:79070/1‑147 GATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCGCATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGT < 2:1011731/149‑1 TTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGTTGTAT > 2:1206766/1‑149 TTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTT < 1:1494128/149‑1 TTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTC > 1:1035821/1‑149 TCCTAAATCTACGCACCTGTACGCGTCACTACACGCCCATACAACGGAGTGGCGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGCTCACACAACACTCTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCA < 2:1710480/149‑1 CTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAAT < 1:1015292/149‑1 CTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAAT < 2:1687226/149‑1 TAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATC > 1:318568/1‑149 ATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGT > 1:1304052/1‑149 ATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGGTTTGGGTGTATTTCAATGTGT > 1:1018574/1‑149 GACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAA > 1:607503/1‑149 GACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAA > 1:1770335/1‑149 GACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAACACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTGTAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGTTGTATTTGCATCTGGTAA > 2:370785/1‑149 ACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACAGTCAATTACTTAACATAAATGTATAACTCAT‑ACTCTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAA < 1:1160239/149‑1 GCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAA < 1:1420920/149‑1 GCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAA < 2:1500592/149‑1 AACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGa > 1:1683805/1‑148 AACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTATTAAAAAGT > 2:1749120/1‑149 ACTGTACCCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTT < 1:163351/149‑1 TACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTC > 1:1649391/1‑149 TCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCT < 2:943859/149‑1 TCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTGTAAAAGTTTTTCGCT > 1:449491/1‑149 TCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACG > 2:230823/1‑149 TCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACG > 1:48301/1‑149 TCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACG > 2:1498279/1‑149 CACTACACGCACATACATCGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGC < 1:919940/149‑1 CACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGC < 2:1463203/149‑1 CTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCCCACAAAACACTCAATTACTTAACATAAAGGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTA < 1:788587/149‑1 CTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTA < 1:918707/149‑1 ACACGCACATACAACGGAGGGGGGCGGCTATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACGTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGC < 1:811950/149‑1 CACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCA > 1:1583939/1‑149 ACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAA > 2:1337020/1‑149 ACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAAT > 1:1342830/1‑149 CGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTACTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAA < 2:405118/149‑1 CGGAGGGGCGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAA < 1:1632562/149‑1 GAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAATTGAAACg > 1:1729653/1‑148 gGGGTGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACCCTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAG < 1:16533/148‑1 GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGGGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTCTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGG > 1:1645316/1‑149 GGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGA < 1:1265542/149‑1 GGGGCCGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAA < 1:451297/149‑1 GGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAAT > 1:779914/1‑149 CTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAAT < 2:1642411/149‑1 CTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAAT > 1:1071405/1‑149 GATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAA > 1:1356288/1‑149 TTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATG < 2:1405661/149‑1 TCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCATTTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGG < 1:959726/149‑1 TCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGG > 1:598854/1‑149 TCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGG < 2:477371/149‑1 AATAATGCGTGATTCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGAT < 1:1346146/149‑1 AATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGAT > 1:723529/1‑149 ATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGAGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTG > 1:637167/1‑149 GCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCG > 2:182083/1‑149 GTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCA < 1:1521007/149‑1 GATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACA < 2:281584/149‑1 ATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAG > 1:384292/1‑149 GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGAGATGTTGCGCACAGTC > 1:1777180/1‑149 GATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAA < 1:559131/149‑1 TCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAGTCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATAGGATGTTGCGCACAGTCAACAT > 2:1039274/1‑149 TCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAAT > 1:244337/1‑149 ACACAAAACACTCAATGACTTAACATAAATGTATAAGTCAG‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAA < 2:1202158/149‑1 CACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAAC > 2:1670357/1‑149 AAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGGGCACAGTCAACATAAATCA > 2:878034/1‑149 AAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCA > 1:515824/1‑149 ACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTA > 2:1370822/1‑149 TCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAA > 1:572024/1‑149 CAATTACTTAACCGAAAGGTATAAGTCAT‑ACTTTTGGTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAATATAACTCACCGTAAAT < 1:1116128/149‑1 CAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAAT < 1:422612/149‑1 AATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATA > 1:77955/1‑149 AATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATA > 1:10754/1‑149 CTTAACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTCTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAACTAACTCACCGTAAAATATCAT > 2:578062/1‑149 AACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTG < 2:1649391/149‑1 AACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTG < 1:551398/149‑1 AACATAAATGTATAAGTAAT‑ACTTTTGTGTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAAGCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTG < 2:1162741/149‑1 ACATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGC < 1:1337020/149‑1 ATAAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTACTA > 2:627375/1‑149 AAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATA > 1:203161/1‑149 AAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATA > 1:1063695/1‑149 AAATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAAAAAGCAAAAAGGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCAAAGGCAAAAAAACTCACCGTAAAAAATCATCTGCTATA > 1:58759/1‑149 AATGTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAACAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAA < 2:1356288/149‑1 GTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATA > 1:403212/1‑149 TTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978347‑1978502 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cataaatgTATAAGTCAT‑ACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATA > NC_000913/1979279‑1979426 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |