Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,429,943 | C→T | 7.1% | T98T (ACG→ACA) | purF ← | amidophosphoribosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,429,943 | 0 | C | T | 7.1% | 163.4 / 2.8 | 56 | T98T (ACG→ACA) | purF | amidophosphoribosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/26); new base T (2/2); total (28/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.57e-01 |
GCGGGTAGTGGCGGAAGTTGTCCAGCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGCATATGGCGAG‑CTTCAAATACATCGCTCAC > NC_000913/2429795‑2430083 | gCGGGTAGTGGCGGAAGTTGTCCAGCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGTTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGc < 2:545787/149‑1 (MQ=255) tAGTGGCGGAAGTTGTCCAGCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAAt < 1:676791/149‑1 (MQ=255) tAGTGGCGGAAGTTGTCCAGCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAAt > 1:335964/1‑149 (MQ=255) cGGAAGTTGGCCAGCTCGGTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGCGTTGATGTGGCGTCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATa < 2:484487/149‑1 (MQ=255) ttGTCCAGCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCAGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGa > 2:607691/1‑149 (MQ=255) tggTCCAGCTCTCTGGCGAAGATATTACGCCGGATTTCCGAGTCGGAAGTGTTGTTGAGGTGTCGGCGTTTTTGTTCAAACTGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGa < 2:41078/147‑1 (MQ=255) tGTCCAGCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAg < 1:461943/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGGGtt > 1:466752/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGGGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTaa > 1:597935/1‑149 (MQ=255) gCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCTGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGTAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACg < 1:521533/149‑1 (MQ=255) ggCGAAGCTCTTAAGTGGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTCCGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACg < 2:125357/149‑1 (MQ=255) gCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGGTGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGGCCGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATAAGGGGGGGTAACGTAAAAggg > 1:68771/1‑149 (MQ=255) gCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACgg < 2:725671/149‑1 (MQ=255) gCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACgg > 1:61622/1‑149 (MQ=255) gCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGCTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACgg > 2:211987/1‑149 (MQ=255) taaGATATTAAGCAGAATTTCCGAGGCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTCCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGACGTTGTGGTCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCt < 2:46618/148‑1 (MQ=255) gAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGTGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCt > 1:537862/1‑149 (MQ=255) gAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGTGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCt > 1:537878/1‑149 (MQ=255) gacagtAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACCCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTgcg < 2:136983/144‑1 (MQ=255) tatTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTTATACTGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCt > 2:447703/1‑149 (MQ=255) tAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCa > 1:163948/1‑149 (MQ=255) aGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCaga > 1:326153/1‑149 (MQ=255) cAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCGACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAGACGGCTGCGCTTCAGAgg > 2:139331/1‑149 (MQ=255) cGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGc > 1:253251/1‑149 (MQ=255) gAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCt < 1:332467/149‑1 (MQ=255) gAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCt < 2:475134/149‑1 (MQ=255) gAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCt < 1:757439/149‑1 (MQ=255) gAGGCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCt < 2:725525/149‑1 (MQ=255) tCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGcc < 1:552699/149‑1 (MQ=255) gAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGATGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCCGCGATTCAGAGGCGCTGGAGATGCCAGc < 1:597996/149‑1 (MQ=255) aGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCg > 1:60716/1‑149 (MQ=255) ttGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTa > 2:239695/1‑149 (MQ=255) aTGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTATGGGCAAGCGTAATGCCATAAGGGGAGTTAACGTAAAACGGATGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACg > 2:288431/1‑149 (MQ=255) gtgGGGGCGTTTTTCCTCAAGCAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAAGGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGca < 2:65654/149‑1 (MQ=255) gtgGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGca < 1:762593/149‑1 (MQ=255) gtgGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGca > 1:701396/1‑149 (MQ=255) gtgGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTGTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTACCGca > 1:401493/1‑149 (MQ=255) cggcgTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTCACGCACATg > 2:51138/1‑149 (MQ=255) ggctTTTTTCTTCAAACGGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGa < 1:677737/149‑1 (MQ=255) gcgTTTTTCTTCAAACAGTTTTTGACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGAc > 1:443773/1‑149 (MQ=255) tttCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTACAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATg > 1:10669/1‑149 (MQ=255) ttcttcAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGc < 1:774265/149‑1 (MQ=255) ttcttcAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGc < 1:63069/149‑1 (MQ=255) gTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGccc < 1:795094/149‑1 (MQ=255) gTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGccc > 1:380360/1‑149 (MQ=255) cGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACg > 2:80525/1‑149 (MQ=255) cGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACg > 2:80527/1‑149 (MQ=255) gCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCAGATTACCCTGCAAACGc > 1:181939/1‑149 (MQ=255) aCTCGTGCGCGTTGGTCCGGTGTGCGTTGTGGGCAAGCGGAATGCCATACGGGGAGTTAACGGAAAGCGGCTGCGCTTCACGGGCGCCGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGc < 2:38015/149‑1 (MQ=255) aCTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGTGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGc < 2:537862/149‑1 (MQ=255) aCTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGTGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGc < 2:537878/149‑1 (MQ=255) tGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGCATATGGCGAG‑Ct < 1:717552/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGGGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGCATATGGCGAG‑CTTCAAATACAt < 2:53085/149‑1 (MQ=255) cGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGGGGAGCTGGAGCTGCCAACCGTGGGGTAACGCACATGACCAATACCCATATTGCCCGGCCAACGCTGCAAATGG‑GAGACTTCAAAtccgacg > 2:334691/1‑143 (MQ=255) ttGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGCATATGGCGAG‑CTTCAAATACATCGCt > 1:43166/1‑149 (MQ=255) gtgGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGGGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGCATATGGCGAG‑CTTCAAATACATCGCTCa < 1:211987/149‑1 (MQ=255) tgGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACCTGATCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGCATATGGCGAG‑CTTCAAATACATCGCTCAc < 1:623944/149‑1 (MQ=255) | GCGGGTAGTGGCGGAAGTTGTCCAGCTCGCTGGCGAAGATATTAAGCAGAATTTCCGAGTCGGAAGTGGTGTTGATGTGGCGGCGTTTTTCTTCAAACAGTTTTTTACGCAACTCGTGAGCGTTGGTCAGATTGCCGTTGTGGGCAAGCGTAATGCCATACGGGGAGTTAACGTAAAACGGCTGCGCTTCAGAGGCGCTGGAGCTGCCAGCCGTGGGGTAACGCACATGACCAATGCCCATATTGCCCTGCAAACGCTGCATATGGCGAG‑CTTCAAATACATCGCTCAC > NC_000913/2429795‑2430083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |