| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3186094 = | NA (NA) | 57 (1.270) | 40/276 | NT | 100% | intergenic (+6/‑91) | yqiG/insC1 | pseudogene; fimbrial export usher family;putative membrane; Not classified; putative membrane protein/IS2 repressor TnpA |
| ? | NC_000913 | 3485933 = | 0 (0.000) | intergenic (‑117/‑185) | yhfA/crp | OsmC family protein/cAMP‑activated global transcription factor, mediator of catabolite repression | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AACCCTTCGACCCACTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAGCGGCGTTAT > NC_000913/3485785‑3486078 | gatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctac > 1:789272‑M2/149‑149 (MQ=255) aCCCTTCGACCCACTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACACCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGACGACCTGAGGCATGCTGAAGCGAGCCACCAGGAGACACAAAGCGAAACCt > 2:327927/1‑149 (MQ=255) tcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaatctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctacta < 2:783587‑M2/3‑1 (MQ=255) tcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattacgactataacttatttcagtgaaattggttgtctggagatgcatggggccagtctactg > 2:754838‑M2/147‑148 (MQ=255) ttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATg < 2:705168‑M2/5‑1 (MQ=255) ttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATg > 1:26637‑M2/145‑149 (MQ=255) tcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTa < 2:359753‑M2/8‑1 (MQ=255) tcccccTTCTCTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggat > 2:675296‑M2/2‑144 (MQ=255) tgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagcttcagggcgccggtctaCTATGCTAAAACa > 1:105014‑M2/137‑149 (MQ=255) ttCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCTTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGCCCCAAAGCGAAAGCTATTtgtattttccc > 2:469712‑M2/1‑138 (MQ=255) ttCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGCAGCGACACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgccc > 2:566007‑M2/1‑138 (MQ=255) tcccccgcgcttgcATTGTTGCGACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccc > 2:207506‑M2/6‑137 (MQ=255) gtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCa > 1:499639‑M2/133‑149 (MQ=255) acgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAgg > 1:77280‑M2/131‑149 (MQ=255) tCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctcta < 2:566723‑M2/149‑17 (MQ=255) cgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaagctggtattaagactatcacttagttaagtgctattggttgtctggagattcagggggccagtgtaCTATGCTAAAACAGTCAAGATGc > 1:98253‑M2/127‑149 (MQ=255) gtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactggtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCt > 1:624564‑M2/126‑149 (MQ=255) cTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTCTGtggatttgcccctatatttcc > 1:421400‑M2/1‑128 (MQ=255) gCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccaga > 1:133762‑M2/1‑125 (MQ=255) ttgtccggccctacgacatcattcatctgttctccaatgactattctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatatttgttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAAt < 2:354809‑M2/32‑1 (MQ=255) ttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattgagactatcacttatttaagtgatattggttgtgtggagattcggggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGCAAt > 2:598102‑M2/118‑149 (MQ=255) ttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAAt < 1:778867‑M2/32‑1 (MQ=255) tccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACa > 1:441082‑M2/115‑149 (MQ=255) tccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACa > 2:250745‑M2/115‑149 (MQ=255) tccggccctaagacatcaatcatctcttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACa > 1:398455‑M2/115‑149 (MQ=255) gcccctaagacatcaatcatctgttctccactgtctagtccaaaacctattattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTg < 2:365102‑M2/38‑1 (MQ=255) tACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGACATGCTGAAGCGAGACACCCGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacctctgttat < 2:245761‑M2/149‑35 (MQ=255) cctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtataCTATGCTGAAACAGTCAGGATGCTACAGCAATACATTGATg > 1:220423‑M2/109‑149 (MQ=255) cTCCACGGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca > 1:424974‑M2/1‑113 (MQ=255) aagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTAc > 2:411919‑M2/106‑149 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCAt > 1:564097‑M2/101‑149 (MQ=255) gtaatttttcctgaCAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca > 2:282800‑M2/6‑104 (MQ=255) aaTTGCCCTGCCAGCGTACGCGTACTAGCCAAAGCGCGCAACGGAAGGCGAGCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta > 2:643478‑M2/1‑101 (MQ=255) ctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCaaa < 2:77280‑M2/58‑1 (MQ=255) gttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAgg < 1:596802‑M2/60‑1 (MQ=255) tGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGGGACACAAAGCGAATGCTATGtggatttgcccctatatttccagccctctgttaccacttaacccattacactcccg < 1:539558‑M2/149‑57 (MQ=255) caatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattgtttgtctgtgtattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGAcgtac > 2:769699‑M2/84‑147 (MQ=255) caatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggtagtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTGCTGCATGTATGCAAAGGACGtcc > 2:501802‑M2/84‑148 (MQ=255) aatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTcac > 1:491190‑M2/83‑149 (MQ=255) gTACGCGTACTAACCAACGCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgc > 2:532714‑M2/1‑86 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggcgagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTa > 1:682786‑M2/79‑149 (MQ=255) tagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTAcc > 2:34267‑M2/77‑149 (MQ=255) gTACTAACCAAAGCGCTCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTTAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatat > 2:519320‑M2/1‑80 (MQ=255) gtctaaaaactagtattaagactatcactgatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGt < 2:164427‑M2/75‑1 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTg > 2:376006‑M2/74‑149 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTg > 2:211701‑M2/74‑149 (MQ=255) taaacactagtattaagactatcacttatttaagggatattgggtgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCa < 1:39574‑M2/78‑1 (MQ=255) tAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc < 1:772215‑M2/149‑74 (MQ=255) ccAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAGGCGAAAGGTGTGtggatttgccgctatatttccagacatctattgccacgtaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccggg < 1:74760‑M2/149‑77 (MQ=255) ccAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg < 1:117139‑M2/149‑77 (MQ=255) ccAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGGCATGCTGAAGCGCGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGgggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg < 2:333694‑M2/149‑77 (MQ=255) cAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtgg < 1:777704‑M2/149‑78 (MQ=255) ctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCCGTACAg > 1:329891‑M2/66‑149 (MQ=255) gcgcAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcg > 1:799411‑M2/1‑66 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAACGGACGCCACATTACCGAACAGTAAACATGATa > 1:182579‑M2/60‑149 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATa > 1:573386‑M2/60‑149 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATa > 2:214614‑M2/60‑149 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAATTGATa > 2:214637‑M2/60‑149 (MQ=255) aaCGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataa < 1:58022‑M2/149‑88 (MQ=255) aaCGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataa < 1:730446‑M2/149‑88 (MQ=255) gactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGccc < 1:503806‑M2/94‑1 (MQ=255) caatatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTCCAGTTGATAGccc > 2:400372‑M2/56‑149 (MQ=255) caatatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGccc > 1:341733‑M2/56‑149 (MQ=255) cGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGCCACCAGGAGACACACAGCCAGAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacc > 1:224164‑M2/1‑60 (MQ=255) ggAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccc < 1:18934‑M2/149‑91 (MQ=255) tatcacttatttatgtgattttgggtgtcgggagattcagggggccaggctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCtt < 2:318131‑M2/97‑1 (MQ=255) tatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCctg > 2:343794‑M2/53‑148 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCa < 1:418487‑M2/101‑1 (MQ=255) taagtgatattggttgtctggcgattcagggggctagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCg < 1:563994‑M2/108‑1 (MQ=255) ggTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcg > 2:777704‑M2/1‑46 (MQ=255) gtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGa < 1:204325‑M2/111‑1 (MQ=255) gtgagattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGa < 1:321498‑M2/111‑1 (MQ=255) tgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGaa < 2:145307‑M2/112‑1 (MQ=255) tgaatttggttggctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAATCAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTCCTGCATGTATGCAAAGGACGTCCCATGACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGaa < 2:733309‑M2/112‑1 (MQ=255) gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAg < 1:179528‑M2/113‑1 (MQ=255) gCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggggggcgataacccagcgcactatgcggatgcc < 1:13‑M2/149‑110 (MQ=255) cTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgaccgataacccagcgcactacgcggatgcca < 2:348528‑M2/149‑111 (MQ=255) cTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagaaattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgcaa < 1:433914‑M2/149‑111 (MQ=255) ggttgtctggagcttcagggggccagtctaCTATGCTAAACCAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATAtt < 2:577490‑M2/119‑1 (MQ=255) ggttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATAtt < 2:345673‑M2/119‑1 (MQ=255) gttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAgagggtagtgtgttt < 2:209835‑M2/120‑8 (MQ=255) gttgtctggagattcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATAttt > 2:107034‑M2/30‑149 (MQ=255) acCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatg < 1:708801‑M2/149‑123 (MQ=255) acCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcaataacccagcgcactaggcgggtgccattcgttataatg < 1:397882‑M2/149‑123 (MQ=255) cAGGAGACACAAAGCGAAAACTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagctcttctcgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgct < 1:582002‑M2/149‑125 (MQ=255) attcagggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCag > 2:106579‑M2/19‑149 (MQ=255) acacAAAGCGAAAGCTATGtggatttacccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatggagtaggcattcgttataatgcccgaacg < 2:763745‑M2/149‑131 (MQ=255) gggggccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACa > 2:389935‑M2/14‑149 (MQ=255) ggggccagtctaCTATGCTAAAACCGTCAGGATGCTACAGTAATAGATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAg < 2:327596‑M2/137‑1 (MQ=255) aaGCGAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgccccg < 2:4935‑M2/149‑136 (MQ=255) aaGCGAAAGCTATGtggatgtgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcaaagatgcccgtggccagcgataaccccgcgcaccatgccgaggccattcgttataatgctcgaacgccccc < 2:207580‑M2/149‑136 (MQ=255) ccattctaCGATGCTAAGACAGTCAGGCTGCTACAGCAATACATTGATTGACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAgctgc < 2:24091‑M2/141‑1 (MQ=255) ccagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAgcggc < 2:334495‑M2/141‑1 (MQ=255) cagtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGACGCATATTTCGGCAATCCCGAGACCgcggcg > 2:656738‑M2/8‑149 (MQ=255) agtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTCGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGGGGCAGCGGCGt > 2:528972‑M2/7‑149 (MQ=255) gtctaCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTCCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGCCAATCCAGAGACAGCGGCGtt > 2:62563‑M2/6‑149 (MQ=255) gAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccatgcgttataatgctcgaacgccgctgcaa < 1:178510‑M2/149‑140 (MQ=255) gAAAGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccaattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccatacgttataatgctctaacgcctctgcaa < 1:455408‑M2/149‑140 (MQ=255) aaaGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaag < 1:1271‑M2/149‑141 (MQ=255) aaGCTATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaagg > 1:529849‑M2/1‑8 (MQ=255) | AACCCTTCGACCCACTTCACTCGCGCTTGCATTTTTGCTACTCCACTGCGTCAATTTTCCTGACAGAGTACGCGTACTAACCAAATCGCGCAACGGAAGGCGACCTGGGTCATGCTGAAGCGAGACACCAGGAGACACAAAGCGAAAGCTATGCTAAAACAGTCAGGATGCTACAGTAATACATTGATGTACTGCATGTATGCAAAGGACGTCACATTACCGTGCAGTACAGTTGATAGCCCCTTCCCAGGTAGCGGGAAGCATATTTCGGCAATCCAGAGACAGCGGCGTTAT > NC_000913/3485785‑3486078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |