| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2406863 | 2 (0.040) | 46 (1.030) | 37/274 | NT | 95.9% | intergenic (‑224/‑696) | lrhA/alaA | transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes/glutamate‑pyruvate aminotransferase; glutamic‑pyruvic transaminase (GPT); alanine transaminase |
| ? | NC_000913 | 2996360 = | NA (NA) | intergenic (‑2/+10) | ygeO/insD1 | pseudogene, orgA family, part of T3SS PAI ETT2 remnant/IS2 transposase TnpB | |||||
TGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAGGCGGCATCAAGAGCAGGGATCCGTCATTTAT > NC_000913/2406715‑2407010 | tgtgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACT < 2:27319‑M1/149‑1 (MQ=255) tCCCTCGCAGTTTCATCCGGACCCCGGACGAAAGTAAAATTGCATATGAATTGAAATAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggattt < 2:614219‑M1/149‑7 (MQ=255) tggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCtttt < 1:714595‑M1/16‑1 (MQ=255) cgggcaGTTTCATCCGGAACCCGGCCGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcc < 1:723‑M1/147‑10 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCGGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccct < 1:37205‑M1/149‑13 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccct < 2:802489‑M1/149‑13 (MQ=255) gccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTAttt > 1:276423‑M1/128‑149 (MQ=255) ttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatt > 1:689697‑M1/1‑132 (MQ=255) cggctgcgtttcgccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTAt > 2:753403‑M1/126‑149 (MQ=255) tCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTACAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATTTCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggttttgcccctatatttcca < 2:360684‑M1/149‑22 (MQ=255) cgcttctccggcctcaacacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaacctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATg > 1:415383‑M1/120‑149 (MQ=255) tttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATgcg < 2:784257‑M1/32‑1 (MQ=255) tccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagagtcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCgtg < 2:103233‑M1/36‑1 (MQ=255) cGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgt < 2:182074‑M1/149‑31 (MQ=255) gaaagaaaAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatca < 2:187245‑M1/149‑36 (MQ=255) gAAAGTAAAAATGCACATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatca < 2:187217‑M1/149‑36 (MQ=255) ctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGtat < 2:649279‑M1/43‑1 (MQ=255) aaaccatccatcattagttcttcactgactagtctaaaaactaggattaagactatcacttatttaagtgttattggttgtctggcgattcagggggccagtctAGTCACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTAtaa > 1:719908‑M1/105‑149 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaatactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTAtaaatgta < 1:510205‑M1/50‑1 (MQ=255) aaaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCGTATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc < 2:183830‑M1/149‑44 (MQ=255) aatctgctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTAtaaatgtaaat > 2:216577‑M1/97‑149 (MQ=255) aatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTAtaaatgtaaat < 1:344375‑M1/53‑1 (MQ=255) ccatctgttctacactgactgtgctaaatactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTGCTATTTATCACATGCGCGTGTTTGTATaaatgtaaatgt > 1:413818‑M1/95‑149 (MQ=255) atatGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca > 1:405330‑M1/1‑100 (MQ=255) tatGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaa < 1:79390‑M1/149‑51 (MQ=255) ttGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttgccacttaacctattagaagccagc > 1:266174‑M1/1‑93 (MQ=255) tccaatgactagtctaaaatctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCCCTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGt > 1:689213‑M1/85‑149 (MQ=255) ccaatgcctagtttaaaaactagtagtaagactatcacttatttaagtgatatttgttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGtt > 2:284729‑M1/84‑149 (MQ=255) cTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCACATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacctattacaagcccgctaccg > 1:619795‑M1/1‑88 (MQ=255) aatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAGATGTGGTTCCTTGTTcc < 1:700653‑M1/68‑1 (MQ=255) atgactagtccaaaatctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGCGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCa > 1:599218‑M1/81‑149 (MQ=255) gtctaaaaattagtattaagactatcacttattttagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCATTCTTTGCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAATTGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGt > 2:750225‑M1/74‑149 (MQ=255) caTTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattccaaccccgctgccgcagatattcccgtggc > 1:217595‑M1/1‑72 (MQ=255) tggtccgTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgag < 1:779372‑M1/146‑81 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTg > 2:300762‑M1/62‑149 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACACGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTg > 1:532277‑M1/62‑149 (MQ=255) ttCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacattcgttatcacttaagccattacaagccagctgccgcagatattctcgtgtcgaggg > 2:19389‑M1/1‑67 (MQ=255) ttCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcg > 1:479675‑M1/1‑67 (MQ=255) ttCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcg > 2:761454‑M1/1‑67 (MQ=255) ttCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTGACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaaacccgctgccgcagatcttcccgtcgcgagcg > 2:19363‑M1/1‑67 (MQ=255) ttATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGTATCGCATATCTATTATGTTAGTggatttgctcctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtgccatgcgataac > 2:297062‑M1/1‑62 (MQ=255) tataATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacc > 1:102926‑M1/1‑61 (MQ=255) taATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccca > 2:580837‑M1/1‑59 (MQ=255) ctatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATAcgc > 1:12195‑M1/53‑149 (MQ=255) tcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGaa < 1:188975‑M1/100‑1 (MQ=255) tcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTAGGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTTCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGaa < 1:164285‑M1/100‑1 (MQ=255) tGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcg < 2:107494‑M1/149‑94 (MQ=255) acttatttaagttatattcgttgtctcgagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCTTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAaca > 2:158008‑M1/48‑149 (MQ=255) tGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgccct > 2:27508‑M1/1‑52 (MQ=255) ttttagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTAc > 1:61186‑M1/43‑149 (MQ=255) ttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTAcc > 1:317082‑M1/42‑149 (MQ=255) aagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCaa > 2:310996‑M1/40‑149 (MQ=255) aGATCACAGAATAAATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattccaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgccctatgcgg > 2:55062‑M1/1‑46 (MQ=255) gttcaattggttgtctggagattcagggggcccgtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTAGGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACa > 2:353664‑M1/38‑149 (MQ=255) gtgatgttggttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTCGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACa > 2:81788‑M1/38‑149 (MQ=255) agcacagaATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatctttccagacatctgttatcacttaacccattactagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggat < 2:90194‑M1/147‑106 (MQ=255) aTCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggat > 1:530082‑M1/1‑44 (MQ=255) aTCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggat > 1:529991‑M1/1‑44 (MQ=255) tCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatg < 1:606885‑M1/149‑107 (MQ=255) cacaGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgc < 2:135197‑M1/149‑108 (MQ=255) acaGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccaagcgcactatgcggatgcc > 1:256821‑M1/1‑41 (MQ=255) caGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcgctatgcggatgcca > 2:305422‑M1/1‑40 (MQ=255) aGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctcttgtcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggaggccat > 1:484189‑M1/1‑39 (MQ=255) cagatcttCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgt < 1:252256‑M1/146‑115 (MQ=255) ttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGa < 2:450971‑M1/122‑1 (MQ=255) ttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGa < 2:366216‑M1/122‑1 (MQ=255) ttgtctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTCTTCTATGTATGAGATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACCCGTACCAACAGCAATGGtgg < 2:566186‑M1/122‑2 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAggc > 2:344375‑M1/25‑149 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAggc < 1:489286‑M1/125‑1 (MQ=255) tggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAggcgg < 1:316876‑M1/127‑1 (MQ=255) tCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatg < 1:335375‑M1/149‑122 (MQ=255) ggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAggcggc < 2:61210‑M1/128‑1 (MQ=255) ggagattcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAggcggc < 1:634431‑M1/128‑1 (MQ=255) cAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgc > 2:38775‑M1/1‑27 (MQ=255) tcagggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAGGCGGCATCAag > 1:784257‑M1/16‑149 (MQ=255) aTCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatgttcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaa < 1:23973‑M1/149‑128 (MQ=255) aTCGCATATCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaa < 2:321761‑M1/149‑128 (MQ=255) gCATATCTATTAAGTTTCTgtttttgcggctatatttcgagacatctgttatcacttaatccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacga > 2:589677‑M1/1‑19 (MQ=255) ggggccagtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAGGCGGCATCAAGAGCa > 2:297388‑M1/12‑149 (MQ=255) atatCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct > 1:336551‑M1/1‑17 (MQ=255) atatCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct < 1:409108‑M1/149‑133 (MQ=255) atatCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct < 1:469791‑M1/149‑133 (MQ=255) atatCTATTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct > 1:711653‑M1/1‑17 (MQ=255) cgattAAGTTACTggatttgcccctatattgccagacatctgttatcatttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgtggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgc < 2:217595‑M1/147‑137 (MQ=255) gtctAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATTACATTCGTGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCGTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAGGCGGCATCAAGAGCAGGGATcc > 1:32870‑M1/5‑149 (MQ=255) aTTAAGTTACTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaa < 2:689697‑M1/149‑139 (MQ=255) gTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAGGCGGCATCAAGAGCAGGGATCCGTCAt < 1:366216/149‑1 (MQ=255) gTTACCCACCCTTTTCTATTTATGACAGGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCCGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAGGCGGCATCAAGAGCAGGGATCCGTCAt < 2:144281/149‑1 (MQ=255) cTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagggcactatgcggatgccattcgttataatgctcgcacgcacctgcaagggtctttg > 1:135135‑M1/1‑2 (MQ=255) cTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttg > 2:609225‑M1/1‑2 (MQ=255) | TGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAGGCGGCATCAAGAGCAGGGATCCGTCATTTAT > NC_000913/2406715‑2407010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |