| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,116,703 | T→G | 100% | K173N (AAA→AAC) | glpK ← | glycerol kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,116,703 | 0 | T | G | 100.0% | 279.8 / ‑6.7 | 86 | K173N (AAA→AAC) | glpK | glycerol kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (47/38); total (47/39) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GAAGAACGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATTTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCAGACCGGTATTGCT > NC_000913/4116557‑4116843 | gaagaaCGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCAtgtt > 1:1179936/1‑149 (MQ=255) aagaaCGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTc < 1:1242033/149‑1 (MQ=255) aagaaCGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTc < 1:1191554/149‑1 (MQ=255) agaaCGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTcc < 2:1322314/149‑1 (MQ=255) gaaCGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACCCGGCCCTGAGTCATGTTccg > 1:1151535/1‑148 (MQ=255) acgacgCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGa < 1:31443/149‑1 (MQ=255) cgacgCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGAt > 2:1004495/1‑149 (MQ=255) acgCCCTTCTGGCCGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCCCTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGGTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATaa < 2:1258780/149‑1 (MQ=255) cACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGcc < 1:503437/149‑1 (MQ=255) cTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCAc > 2:248587/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTCAGCGGTCACATGGACCCGGCCCTGAGCCATGTTCCAGATAAGcccca > 1:26303/1‑146 (MQ=255) ttCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGCTAAGCCCCg > 1:348743/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACg > 2:820611/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGGTCAAGATAGGCCACg > 1:581357/1‑149 (MQ=255) tCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGt > 1:268564/1‑149 (MQ=255) ggCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGACGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATc > 1:915994/1‑149 (MQ=255) cagcaTCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCaa < 2:1147182/149‑1 (MQ=255) agcaTCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAAc < 1:1231999/149‑1 (MQ=255) caTCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCAGGTTCCAGATAAGCCGCGTATCAACCg > 1:1042064/1‑149 (MQ=255) caTCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTAGAACAACATAGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCg > 1:1084419/1‑149 (MQ=255) tctcGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTa > 2:244608/1‑149 (MQ=255) gcgcgcgGAATATCCAGCGCTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTAcc < 1:1017892/148‑1 (MQ=255) cgcgGAATATCCACCACTTCCAGCACTTTGTCGGCCCAGGCCAGGGTATGGATGTTGAACAAAATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCaaa < 1:916322/149‑1 (MQ=255) tatCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGTTGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAAt < 2:435102/149‑1 (MQ=255) 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tcCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTcgccgga > 2:238298/1‑145 (MQ=255) tcCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGGCATGGTCCAGATAAGCCACGGATCAACCGTACCAAACAGCACTTGACCACGACGTGCACGCTCGCgagc > 1:95373/1‑148 (MQ=255) ccAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCCCGACGTGCACGCTCGCGAGAGc > 1:76109/1‑149 (MQ=255) ccAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGc > 1:1091982/1‑149 (MQ=255) aGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCt > 1:389544/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTc > 1:862487/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTcc < 1:670862/149‑1 (MQ=255) cAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGATCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTGCCCACGACGGGCACGCTCGCGAGAGCCTTCca > 1:966611/1‑149 (MQ=255) ggTATGGATGTTGAACAACATGGTACAAGAGGCGTAGGAGTAATCGGTTACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAAACGTACCAAAAAGCACTTCCCCACGACGTGCACGCTCGCGGAAGCCTTCCCCAt > 2:297323/1‑149 (MQ=255) aTGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACCGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTACACATGGt > 2:637610/1‑149 (MQ=255) tGGATTTTGAACAACGCGGTACGAGAGGCGTTGGTGTATTCGGTCACATGGCCACGGCCCTGATTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACTCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTc < 2:356857/149‑1 (MQ=255) ggATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCCACCGTACCAAACGGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCg > 1:646876/1‑149 (MQ=255) tGATCAACGTGGTACGAGAGGCGTTTGTGGAATCGGTCACATCGTCACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTACCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCTTTACACATTGTCGAGGATc < 2:358497/149‑1 (MQ=255) tGAACCACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATc < 2:358025/149‑1 (MQ=255) aacaacATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCca < 2:802361/149‑1 (MQ=255) aacaacATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCca < 1:1289746/149‑1 (MQ=255) acaacaGGGTCCGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCcac < 1:174206/149‑1 (MQ=255) caacaTGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCCCGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGCCGTGCACGCTCGCGAGAGACTTCCAAATAGTCGAGGATCcact > 1:589374/1‑149 (MQ=255) caTGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACGCGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCTCATGGTCGAGGATCcacttca < 1:958028/149‑1 (MQ=255) tGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGCGCCTTCCACATGGTCGAGGATCcccttcact > 2:783618/1‑149 (MQ=255) ggTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGCCACATGCACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCcacttcactt < 2:1098008/149‑1 (MQ=255) gTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTACCttt > 2:1206864/1‑149 (MQ=255) cGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCGACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGt > 1:1032802/1‑149 (MQ=255) cGAGAGCGGTGGGCGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATTTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCGCCACGGCGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGt < 2:581357/149‑1 (MQ=255) gagaGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTg > 1:297446/1‑149 (MQ=255) 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acacaTGGACGCGGCCCGGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTCCCAAACAGCAATTCACCACGAAGTGCACGCCCGCGAGAGCCTTCAACATGGTCGAGGATCCACTCCTCTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATc < 2:26303/148‑1 (MQ=255) cacaTGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGCACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTATGGGTCAATCa < 2:1159699/149‑1 (MQ=255) acttGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAGGCCACGTATCAACCGTACTAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTTGCGAGAGCCTTCCACGTGGTCGGGGATTCACTTCACTTTGGTGCCGGAAAAGTACGGGTCATTCAc > 2:481926/4‑149 (MQ=255) acaTGGACACCGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCAc < 1:168157/149‑1 (MQ=255) tGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCAg < 2:389544/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGAGTCAGGTCCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTCCAAAGCCGCAACTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCAGACCGGTa < 2:1292364/149‑1 (MQ=255) ccTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGCTCCACGTCCCTTTGGTGCCAGAAAAGTAGGGGTCAATCACCCGACCGGTATtg > 2:395752/1‑149 (MQ=255) tGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCAGACCGGTATtgct > 2:1190760/1‑149 (MQ=255) | GAAGAACGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATTTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCAGACCGGTATTGCT > NC_000913/4116557‑4116843 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |