| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,976,907 | A→C | 100% | E104A (GAG→GCG) | galR → | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor, autorepressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,976,907 | 0 | A | C | 100.0% | 469.5 / ‑6.7 | 125 | E104A (GAG→GCG) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor, autorepressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (58/65); minor base G (0/2); total (58/67) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTTTCCCGCGTCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTA > NC_000913/2976625‑2977189 | tGGCAGGCGTTTCAGTCTCCAGCGTTTCCCGCGTCATTAATAATTCACCCTAGGCCAGCGAGGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGGGTCGCTGAGCTATCACCCGAACGCCAACGGCCGTGCGCTGGGGCAGCTGACCACTTAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTAGTTATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGCGCGTCa < 2:636217/289‑1 (MQ=255) 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tCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGCGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCtgt > 1:327880/1‑287 (MQ=255) aTTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGCGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGtgctg < 2:426672/289‑1 (MQ=255) aTTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGCGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGtgctg < 1:74303/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |