New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 754763 | 21 (0.250) | 8 (0.100) | 8/512 | NT | 28.3% | intergenic (‑295/‑414) | gltA/sdhC | citrate synthase/succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
? | NC_000913 | 755100 = | 20 (0.240) | intergenic (‑632/‑77) | gltA/sdhC | citrate synthase/succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
CCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATGACGCGCAGTTATAG > NC_000913/754478‑755050 | ccTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTc < 1:399439/289‑1 (MQ=255) ttAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCAt < 2:225620/289‑1 (MQ=255) ttGCGTACGACTGCCTGAACTGAAAGTGGCTGTCGCACATCAACATGGCTTGACGCGTTGTGTATATGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTAGAGAGCTCTAGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACgtctccaggtaacaga < 2:358129‑M1/289‑17 (MQ=255) cTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATg < 1:455038/287‑1 (MQ=255) gCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCttt < 1:324920/289‑1 (MQ=255) ccGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCttt > 1:213251/1‑288 (MQ=255) aaCTTAAATTTGCCTTCGCGCATCAACCTGGCGTTACCCGTTGTTTATTTGGCTCGCCGCGCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACgtctccaggtaacagaaagttaacctctgtgc < 2:206586‑M1/288‑33 (MQ=255) ttACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGAGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTg > 2:487593/1‑288 (MQ=255) tACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACg < 1:336058/237‑1 (MQ=255) tACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACg > 2:336058/1‑237 (MQ=255) cccGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCaa > 2:27332/1‑289 (MQ=255) aTTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACgtctccaggtaacagaaagttaacctctgtgcccgtagtccccagggaataataagaacagcatgtgggcgttattcat < 2:650847‑M1/289‑80 (MQ=255) aTTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACgtctccaggtaacagaaagttaacctctgtgcccgtagtccccagggaataataagaacagcatgggggcgttattcat > 2:645400‑M1/1‑210 (MQ=255) gggTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACgtctccaggtaacagaaagttaacctctgtgcccgtagtccccagggaataataagaacagcatgtgggcgttattcatgataagaaatgtgaaaaaacaaagacctattccggg > 2:333313‑M1/1‑174 (MQ=255) ggTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGAt < 2:213251/288‑1 (MQ=255) tACAGAGGTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGGCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCa < 1:608326/288‑1 (MQ=255) gagCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACgtctccaggtaacagaaagttaacctctgtgcccgtagtccccagggaataataagaacagcatgtgggcgttattcatgataagaaatgtgaaaaaacaaagacctattccggggatccg > 2:332399‑M1/1‑167 (MQ=255) aGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCtat > 1:722882/1‑286 (MQ=255) cTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATtat < 2:335531/106‑1 (MQ=255) cTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATtat > 1:335531/1‑106 (MQ=255) ttGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAACTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAaca < 2:706142/289‑1 (MQ=255) tCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCAc > 2:38505/1‑288 (MQ=255) aatgaatTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCg > 2:588249/1‑289 (MQ=255) ttCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGtttt < 1:27332/289‑1 (MQ=255) ccACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACgtctccaggtaacagaaagttaacctc > 2:56022‑M1/1‑40 (MQ=255) ccACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACgtctccaggtaacagaaagttaacctc < 1:56022‑M1/67‑28 (MQ=255) aCATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa > 2:457913/1‑203 (MQ=255) aCATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa < 1:457913/203‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAgtgt > 2:583901/1‑289 (MQ=255) gAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATGAcgcg < 1:588249/289‑1 (MQ=255) gAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATGAcgcg < 2:722882/289‑1 (MQ=255) gACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCCAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACGGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCACCGGGACGCAGTGCTTTTAATGAccgggatttctg > 2:674211/1‑278 (MQ=255) aCTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa > 1:754090/1‑175 (MQ=255) aCTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa < 2:754090/175‑1 (MQ=255) aCTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATGACGCGCAGTTATAg > 1:423772/1‑289 (MQ=255) | CCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATGACGCGCAGTTATAG > NC_000913/754478‑755050 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |