| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1603870 = | 84 (1.560) | 4 (0.080) | 4/482 | NT | 5.7% | coding (852/1029 nt) | lsrC | autoinducer 2 import system permease protein |
| ? | NC_000913 | 1604608 = | 51 (0.980) | coding (562/993 nt) | lsrD | autoinducer 2 import system permease protein | |||||
CTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACA > NC_000913/1604325‑1604888 | cTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAAt < 2:15211/289‑1 (MQ=255)cTTACTGCTCGGCGCATGGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTGTACCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCGGGGACTCCCCGTGCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAAt < 1:269150/289‑1 (MQ=255) aCTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTaagggt > 2:154907/1‑285 (MQ=255) aCTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAAtgtg > 1:222885/1‑289 (MQ=255) tattgagatctaacattcgcgggttaattgcaccaaatgcgacaatctcaataacgagcagtgcggcaagagccagttcccaaccgtagcgaatacgcattatgcggcctcccgttttttacctgacgaagcgggtttaacggatggcggtggcgtcataaagcgggcatatttttgccgccgtagattacgttccagcgcacaacgcaggcgtccatcaaacaccagcaccgccagcagaaccagacccgcgataaaatcattccaccatgccggaCGTAATGTGttt > 1:272155‑M2/278‑289 (MQ=255) taaCGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTg < 2:118156/288‑1 (MQ=255) tataCCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGAtt > 2:162484/1‑288 (MQ=255) ccAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGt < 2:222885/289‑1 (MQ=255) cAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGtt > 2:356903/1‑289 (MQ=255) aGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATCGCGCGCTGTCAGTTaa > 1:125021/1‑288 (MQ=255) aaCCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCg > 1:181509/1‑287 (MQ=255) aaCCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCg < 2:181509/287‑1 (MQ=255) aCCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTAc < 1:401112/289‑1 (MQ=255) cGCTGGTGATTACCCTTGGGACGCGGTATCTGGTGGCCGGAATCGCTCTGCTGCTGTCC‑GGTATGGCCGTAGCGACGTGGTACGAAGGTATTGGTGGATGCCTGAGGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTTATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCtt < 1:176793/289‑1 (MQ=255) cTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTAt > 2:3732/1‑289 (MQ=255) tgcggcaagagccagttcccaaccgtagcgaatacgcattatgcggcctcccgttttttacctgacgaagcgggtttaacggatggcggtggcgtcataaagcgggcatatttttgccgccgtagattacgttccagcgcacaacgcaggcgtccatcaaacaccagcaccgccagcagaaccagacccgcgataaaatcattccaccatgccggaCGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTAt > 1:332553‑M2/217‑289 (MQ=255) gggATTACCGTTGGCCGGCTGTATCTGTTGTCCGGGACCGCGCTGCTGCTTTCCTGGTTTGG‑CGGTGGTACGGGGTTCCAAGGTTTTTGTTGATTTCCGGTTGCCGTTACAGATTTCGCTTACCTGGCTGTGGTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTTATATGTCTCCCCGTTTTCTGGCTTTGGCTGCCAAAAACCCATGCCGGACGTTATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTAtgtg < 1:154907/287‑1 (MQ=255) tGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTAtgtg < 2:244517/288‑1 (MQ=255) tGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTAtgtg < 1:356903/288‑1 (MQ=255) ggcaagagccagttcccaaccgtagcgaatacgcattatgcggcctcccgttttttacctgacgaagcgggtttaacggatggcggtggcgtcataaagcgggcatatttttgccgccgtagattacgttccagcgcacaacgcaggcgtccatcaaacaccagcaccgccagcagaaccagacccgcgataaaatcattccaccatgccggaCGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTAtgt < 2:332553‑M2/75‑1 (MQ=255) ttACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGct < 2:3083/289‑1 (MQ=255) ttGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTTCGCTCTATg > 2:1722/1‑288 (MQ=255) tCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTg > 2:388472/1‑289 (MQ=255) tGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATTCCGGGGCTGGCg > 1:270024/1‑286 (MQ=255) ccGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGCCGGGGCTTGCGTCTGc > 1:367101/1‑289 (MQ=255) tgctgcTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCtgt < 2:358447/289‑1 (MQ=255) gTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTACCTTCCTGATATGTCTCCTCGTCTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATc > 2:50299/1‑289 (MQ=255) aTGGCCGGGGCGACGGGGTACGAGGGTATTGGTGGATTCCCGTTGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCg < 1:1722/288‑1 (MQ=255) ttGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCgg > 1:339247/1‑289 (MQ=255) ttCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCCGCACGTTCCGCTCGCGGTGcgtcgt > 1:391360/1‑289 (MQ=255) gTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGcc < 2:51203/288‑1 (MQ=255) ttCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGGTCAGCACGTTCCGGTCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCACGCCATCAcc > 1:246099/1‑288 (MQ=255) gCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCAccgccg < 2:339247/289‑1 (MQ=255) gCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCAccgccg < 2:451318/289‑1 (MQ=255) gATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTg > 1:220812/1‑289 (MQ=255) gtgCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGc < 1:162484/288‑1 (MQ=255) gCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCggg > 2:191536/1‑289 (MQ=255) cTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGTGGTCGCCGTTGTGCTGCTGGTATCGTACTTTGGTTCAGCACGTTCCGATTCCGGTTCGTCGTTTCCGATTCCCGCCATCACTGCCGTGGTGCTTGGCggg > 2:367602/1‑288 (MQ=255) ggACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc < 1:191536/288‑1 (MQ=255) gagtCCCCGTTCCGCTGATTAGCTTCCTGATATGTTTCTTCGTTTTCTGGTTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTCATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCa < 1:25391/285‑1 (MQ=255) gACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCaa > 1:500512/1‑289 (MQ=255) gACTCCCCGGTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCTTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGCTTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGTTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCa < 1:373083/288‑1 (MQ=255) caacgcaggcgtccatcaaacaccagcaccgccagcagaaccagacccgcgataaaatcattccaccatgccggaCGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAata < 2:272155‑M2/214‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGcgtcg > 2:412740/1‑241 (MQ=255) ccccGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGcgtcg < 1:412740/241‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc > 1:232074/1‑283 (MQ=255) ccccGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc < 2:232074/283‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATAtt > 1:22431/1‑289 (MQ=255) aTCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAGTGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTggttccggtt < 2:125021/289‑1 (MQ=255) tcctcGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATCTTTCTGGTGGTTCCGGTTCCATTCTCGGCACCg > 1:66608/1‑288 (MQ=255) ctcGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGTGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCa > 2:336280/1‑289 (MQ=255) ttCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCgg > 2:489002/1‑289 (MQ=255) ctgtggcgGCATACATCCCAGGCCGGCCGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAATGCCCGCGCGGGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGTGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTtta < 1:389430/285‑1 (MQ=255) tctggctGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTttat < 2:22431/288‑1 (MQ=255) cATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGACCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCACTATTTTTGGTGGTTCCGGTTCCATTATGGGCTCCGCATTTGGTGTTTTGTTGGTGGGat > 1:224162/1‑289 (MQ=255) taaacccaaggccggaCGTAATGTGTTGTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGatat < 1:388472‑M2/273‑1 (MQ=255) tAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGatat < 2:500512/289‑1 (MQ=255) aCCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTCTGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTTTTCGTGGGTTTTTTGc > 1:258035/1‑289 (MQ=255) atgccggaCGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGcaaca < 2:220812‑M2/281‑1 (MQ=255) tgccggaCGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc < 2:128245‑M2/210‑1 (MQ=255) tgccggaCGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc > 1:128245‑M2/8‑217 (MQ=255) | CTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGCTGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCC‑GGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGGATTCCCGATGGCGTTTACAGATTTCGCTAACCTGGATGTGCTGGGACTCCCCGTTCCGCTGATTATCTTCCTGATATGTCTCCTCGTTTTCTGGCTCTGGCTGCATAAAACCCATGCCGGACGTAATGTGTTTTTGATTGGGCAAAGCCCGCGCGTGGCGCTTTATAGCGCGATTCCAGTTAACCGTACCTTATGTGCGCTCTATGCCATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACA > NC_000913/1604325‑1604888 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |