New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3638587 = | 18 (0.740) | 3 (0.130) | 3/480 | NT | 14.1% | coding (947/1500 nt) | pitA | phosphate transporter, low‑affinity, tellurite importer |
? | NC_000913 | 3638810 = | 19 (0.810) | coding (1170/1500 nt) | pitA | phosphate transporter, low‑affinity, tellurite importer |
CTCAACCGCCTGAAAGGTATGTTGACCACCGATGTGGAAAGCTACGACAAGCTGTCGCTTGATCAACGTAGCCAGATGCGCCGCATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTT > NC_000913/3638583‑3639083 | cTCAACCGCCTGAAAGGTATGTTGACCACCGATGTGGAAAGCTACGACAAGCTGTCGCTTGATCAACGTAGCCAGATGCGCCGCATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGACTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTAGCGCTGGCGTCAGGTCACGGTAAGATGATTGGCTGGCGCAGTGGGGc > 2:45603/1‑275 (MQ=255) tGTTGACCACCGATGTGGAAAGCTACGACAAGCTGTCGCTTGATCAACGTAGCCAGATGCGCCGCATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCCTGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGaaa > 2:67310/1‑275 (MQ=255) cacaccggtgcatactcgatggtgctaagcatgtcggacttcagtttcttcaacaggcgctgatcgtcagcactcacgccaggcatcttcaccactttgtcgatagtgtcagaaacgcacagcataatgcggcgcatctggctacgttgatcaagcgacagcttgtcgtagctttccacatcggtggtcaacatacctttcaggcggtCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGaa > 2:7438‑M2/209‑274 (MQ=255) accaccGATGTGGAAAGCTACGACAAGCTGTCGCTTGATCAACGTAGCCAGATGCGCCGCATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCgg < 1:192813/275‑1 (MQ=255) aTGTGGAAAGCTACGACAAGCTGTCGCTTGATCAACGTAGCCAGATGCGCCGCATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTc > 1:92436/1‑197 (MQ=255) ggAAAGCTACGACAAGCTGTCGCTTGATCAACGTAGCCAGATGCGCCGCATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCgcgc < 2:92437/197‑1 (MQ=255) aGCTACGACAAGCTGTCGCTTGATCAACGTAGCCAGATGCGCCGCATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCCGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGTAAATTGGTCAGAAAGGCATGAc > 2:77134/1‑275 (MQ=255) aTCAACGTAGCCAGATGCGCCGCATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGACAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGcc > 2:85302/1‑275 (MQ=255) ttcttcaacaggcgctgatcgtcagcactcacgccaggcatcttcaccactttgtcgatagtgtcagaaacgcacagcataatgcggcgcatctggctacgttgatcaagcgacagcttgtcgtagctttccacatcggtggtcaacatacctttcaggcggtCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAg < 1:7438‑M2/112‑1 (MQ=255) ccagagtgtcggcATTATGCTGTGCGTTTCTGACACGATCGACAAAGTGGTGAAGAGGCCGGACGGTAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTGAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGGGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGAcgg < 1:77133/264‑1 (MQ=255) ccgcATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCCGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGACgtgt > 1:30599/1‑275 (MQ=255) aacgcacagcataatgcggcgcatctggctacgttgatcaagcgacagcttgtcgtagctttccacatcggtggtcaacatacctttcaggcggtCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGACGGTTTCCACTACTCACGTAc > 2:137546‑M2/96‑274 (MQ=255) aGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCCGTTTCCACTACTCACGTACTctcctc > 1:12444/1‑275 (MQ=255) cTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCCTGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGa < 2:178389/274‑1 (MQ=255) cTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGa < 1:85301/274‑1 (MQ=255) aggCTTAGCACCATCGAGTATGCACGGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGGATCGGTACGAGGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTa < 1:45474/271‑1 (MQ=255) tCGAGTATGCACCGGTGGGGAGCATCATGGCGGGCGCGCTGGCGGTAGGTAGCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGGCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCGTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGt < 2:30599/274‑1 (MQ=255) gCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGGTGGTGGTAGATGGTGGGGGCTTACAGctgtctcttataccaatctc > 2:160493/1‑256 (MQ=255) aCCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGAAGGGGGTAGTTGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTc > 1:72366/1‑275 (MQ=255) cGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGAtggtg < 1:160492/240‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCATCATGGCGGGCGCGCTGGCGTTAGGTAGCGGTACGATGATTGGCTGGAGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGa < 1:45603/275‑1 (MQ=255) gtgtGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCGCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGGAGATGGTGGCGGGTTACAGCGTACAACCGTGACCCGCCTTCTgc > 1:172750/1‑273 (MQ=255) gtgtGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTAAGCTAAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCTGGATGCCGGTTTCCAATACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGTGGGGACGATGTGGGTCGATGGTGGCGGCATACAGGGTAAAACCGTGACAAGCCTTCTgc > 2:44311/1‑273 (MQ=255) tccagctgggcggtGGGGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCt < 2:72367‑M2/260‑1 (MQ=255) catcatGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCg > 2:23783/1‑251 (MQ=255) tcatGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAACATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTCCCGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGgtg > 2:48993/1‑275 (MQ=255) catGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTg > 1:113434/1‑71 (MQ=255) catGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCCGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGTCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCCTTACTCACGTACTCCCCCCTTCTGTCGCGGGGGCGATGGGGGTAGTTGGGGGCGGGTTACAGCGTAAAACCTTGCCCACCATTCTCGTGGCCTggggct > 1:154878/1‑272 (MQ=255) atGGCGGTGGGGCTGGCGTTGGGTATCGGTAGGATGATTGACTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGtt < 1:121099/275‑1 (MQ=255) atGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGAc < 1:23783/251‑1 (MQ=255) gcggtCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGaa < 2:113435‑M2/66‑1 (MQ=255) cggtCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCg > 2:134046‑M2/5‑243 (MQ=255) gtCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCTGGACCAGCATTCTGCTGGCCTGGGTGTTTAcc > 1:156895‑M2/3‑273 (MQ=255) gtCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCCCCTCTTCTGGCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGGTGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCATCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTTcc > 2:6977‑M2/3‑273 (MQ=255) cgcgCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGCGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCCCGTACTCTCCCCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTTGCGGCTTACAGCGGAAAACCGTGACCCGCCTTCTGATGTCCTGGGGGTTTGCCCtt > 1:175773/1‑274 (MQ=255) cgcgCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGAc < 1:134045/243‑1 (MQ=255) | CTCAACCGCCTGAAAGGTATGTTGACCACCGATGTGGAAAGCTACGACAAGCTGTCGCTTGATCAACGTAGCCAGATGCGCCGCATTATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTT > NC_000913/3638583‑3639083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |