| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2827787 = | 96 (1.010) | 4 (0.040) | 3/492 | NT | 4.1% | coding (53/780 nt) | srlD | sorbitol‑6‑phosphate dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | 2827866 = | 96 (1.050) | coding (132/780 nt) | srlD | sorbitol‑6‑phosphate dehydrogenase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CACTCCATCCCGGTTTGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATGGTGAAAGTATGGCGTACGGTTTTGGTGCTGACGCCACTAGCGAGCAAAGCGTTCTGGCGCTCTCTCGTGGGGTAGATGAAATCTTTGGTCGCGTGGATTTGCTGGTCTACAGCGCCGGAATAGCAAAAGCAGCCTTTATCAGCGACTTCCAGCTCGGCGATTTTGACCGTTCGCTACAGGTGAATCTGGT > NC_000913/2827511‑2828075 | cACTCCATCCCGGTTTGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGTAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGACTCAGGTTGCAGTTGTCATAGGTGGTGGGCAAACGTTAGGCCAGTTGCTGGGCCaatg > 1:477837/1‑283 (MQ=255)cACTCCATCCCGGTTTGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACgg > 2:76667/1‑286 (MQ=255) tCCATCCCGGTTTGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTg > 2:794926/1‑287 (MQ=255) cATCCCGGTTTGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCCGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGAAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGGCCCTGTGCCACGGTATGGCt > 2:545032/1‑288 (MQ=255) cccGGTTTGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCg > 2:108272/1‑289 (MQ=255) cccGGTTTGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCg > 2:208744/1‑289 (MQ=255) tttGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAgggg > 2:435324/1‑289 (MQ=255) tttGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAgggg > 1:310620/1‑289 (MQ=255) tGCAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTa > 1:410083/1‑289 (MQ=255) cAATTTTCACTCGGGCAGCATCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTAtc > 2:652656/1‑289 (MQ=255) 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agcaTCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCg < 1:208744/288‑1 (MQ=255) agcaTCGCTATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCg < 1:108272/288‑1 (MQ=255) ggggACCGCTGTTGGAGGCGTCGCGAAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAGGCGGAAGTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCGGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTGGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGa < 1:432773/285‑1 (MQ=255) tGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACa < 2:124099/288‑1 (MQ=255) tGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGGCGATATTCAGAGCGACaa > 2:302855/1‑289 (MQ=255) tGACCGCGGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACa < 1:435324/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |