New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2262030 | 11 (0.160) | 46 (0.670) | 41/282 | 0.7 | 80.8% | coding (334/939 nt) | fruK | fructose‑1‑phosphate kinase |
? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | intergenic (+32/‑55) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase |
GGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTA > NC_000913/2514132‑2514407 | ggCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc < 2:971834/143‑1 (MQ=255) ggCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc < 1:384091/143‑1 (MQ=255) cTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATa > 2:400333/1‑143 (MQ=255) cTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGACTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGACGGAGACAATTCCCATa > 1:3108/1‑143 (MQ=255) tgaatgaaGAGCCAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATaa < 2:1123686/143‑1 (MQ=255) atgaaGAGCAAGTTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgcg < 2:817513/143‑1 (MQ=255) atgaaGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgcg < 2:1049320/143‑1 (MQ=255) aaGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTCAGACCATACATAAAAAAGCCCGGGCCAATTCCCATAAGCGCTa > 2:233840/1‑143 (MQ=255) gCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGCGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGCCCATGCATAAAAAAGCGGGGTACGATCCCCAGAAGCGCTAACtc > 1:1100202/1‑142 (MQ=255) atgTAACGTTGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAg < 1:744025/141‑1 (MQ=255) aGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAg < 1:1016948/143‑1 (MQ=255) gttgaCGTGTGTTCTCGCTTGCGCCTGAAGCTGGTTTAGGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAAGCGCG‑GCACTGGTGCTGTACGGCCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAgg < 1:829963/139‑1 (MQ=255) gTAACGTGGTTTCTCGCTTCGTTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAggg < 1:736938/143‑1 (MQ=255) gTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCGTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGGAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGACAATTCCAATAAGCGCTCAACTAAggggtctg > 1:745497/1‑138 (MQ=255) gTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCa < 1:892318/120‑1 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gTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTg > 2:671492/1‑143 (MQ=255) tttACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGc > 2:1108391/1‑143 (MQ=255) tttACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGc > 2:855442/1‑143 (MQ=255) aCGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGGTATGCTTTAACGTGCCgg > 2:10312/1‑142 (MQ=255) aCGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGa < 1:1054857/143‑1 (MQ=255) aCGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGCCTGTGGTCTTACGCCGGATATGACTTGACGTGCCGa 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tacgtaAAGAAGGCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGCTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGACCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACt < 1:429373/143‑1 (MQ=11) tacataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACt < 1:650302/143‑1 (MQ=255) cataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGCTTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGACGAACTgg > 1:274649/1‑143 (MQ=255) aataccaaaGCCGGTGATTATTCCCATATGCTCTAACTTACGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATCTTGGTAAGCCCGAAAAACttt < 1:490423/137‑3 (MQ=11) gtgaagaaGCCGGGGATAATGCCCATAGGCGCTAACTTAAGGGCTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGa < 2:341000/137‑1 (MQ=11) ataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGa < 1:223337/143‑1 (MQ=255) taAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGACCGAAGAACTGGAt > 1:20076/1‑143 (MQ=255) aaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATCGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACCTc > 1:696401/1‑143 (MQ=255) aGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCg < 2:1007364/143‑1 (MQ=37) ccGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGc < 2:502646/143‑1 (MQ=35) cGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCa > 2:859607/1‑143 (MQ=35) gggATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACg > 2:364686/1‑143 (MQ=35) gATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTa > 1:324384/1‑143 (MQ=34) | GGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCA‑GCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTA > NC_000913/2514132‑2514407 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |