| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3992759 | 67 (1.050) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845388‑3845672 | taaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcacacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctg < 2:175397‑M1/1‑1 (MQ=255)cATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAg > 2:370296/1‑143 (MQ=255)cATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCAGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAg > 1:300090/1‑143 (MQ=255) ctggtagcgtgagcatagttcaacggcctgctgacctcgcgcacgcgtgtgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCAcc > 2:728807‑M1/139‑143 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catttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATc < 1:555976‑M1/122‑1 (MQ=255) ccATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGCATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGCTGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATcccc > 2:1153149/1‑143 (MQ=255) ccATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATcccc > 2:512784/1‑143 (MQ=255) cATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCcg > 2:1107763/1‑143 (MQ=255) ccctctgcgcgtacctGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAGGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGACGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCcgc > 1:818230‑M1/17‑143 (MQ=255) ccgctgcgcttaccgGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGCATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCcgcg > 1:430020‑M1/16‑143 (MQ=255) cgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAACGCGGTAGCTCCGCCGATGAGCCGTTTATTCAGAAGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATACCCgcgc < 2:876260‑M1/129‑1 (MQ=255) ccGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGCGCCGTTTACTCAGCTGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATGCCCGCGCTa > 1:186576/1‑143 (MQ=255) cGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaa > 1:225444/1‑143 (MQ=255) ggCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaaa < 1:276415/143‑1 (MQ=255) cgcttacctGCACCGAGACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGCTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGCTGGAGTTTCCTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaaa > 1:427765‑M1/10‑143 (MQ=255) gCTGATGAGCCCCGACACGGCGCCGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaacc < 1:920020/143‑3 (MQ=255) ttacctGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGACTGCCCTCCCCTACCCGTTGGGCGGTATGGCCAGATAGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTa < 2:1139165‑M1/137‑1 (MQ=255) tgatgaGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTa > 2:96202/1‑143 (MQ=255) acctGTACCTACACTGCTCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTCAAAGCCGCCGCCCGTTAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAAc > 2:80258‑M1/5‑143 (MQ=255) ctGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTGAACCTACCCa < 2:960276‑M1/141‑1 (MQ=255) | CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845388‑3845672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |