| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 56 (0.770) | 47/282 | 0.6 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1293039 | 0 (0.000) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 0 (0.000) | 78 (1.070) | 53/282 | 0.3 | 100% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCT > NC_000913/1292890‑1293173 | gcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct < 1:781396‑M1/1‑1 (MQ=255) cgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaccaccatcataccctacatcagtaagttggcagcatcacctt < 1:95412‑M1/2‑1 (MQ=255) tgatgtccggcggtgcgtttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTtgtg > 2:423038‑M1/139‑143 (MQ=255) tccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacttcaaagacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgcc < 1:180806‑M1/10‑1 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATAATGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTACATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTCCTCTATTTTGTGCCGggt < 2:809878‑M2/143‑4 (MQ=255) cggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagcaccagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttcgcagcatcaccTTGTCCCGCcac < 2:866574‑M1/12‑2 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaa > 1:956639‑M2/1‑138 (MQ=255) ttAAGTGCTTCGCTCAGTGTAGTAATCTCAAACCTATATTGGACTAGTTTTCCGGTAGAACAAGAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgac > 1:300005‑M2/1‑134 (MQ=255) tgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataaata < 1:843558‑M1/18‑1 (MQ=255) gcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAatat < 1:788194‑M1/19‑1 (MQ=255) tgtGCTTCGCGCATTGGAGGAATCTAAAACGTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGGAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactcc > 2:582653‑M2/2‑131 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATACCTATCt < 1:464719‑M1/21‑1 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATAtcg < 1:978085‑M1/21‑2 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCt < 1:1001886‑M1/21‑1 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggaggcacagctgatacaaacagaacccactggaccacctcaaacaccacatcatacactaaatcagtcacttggcagcatcaccTTGTGCCGCCACCAAATATCt < 2:237242‑M1/21‑1 (MQ=255) tttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccacttgaccacctcaaaaacaccataatacactaaatcagtaagatggcagcataaccTTGTGCCGCCAATAAATACCtt < 1:810546‑M1/22‑1 (MQ=255) tttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATatcct < 2:63853‑M1/22‑3 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaagtt < 2:1101959‑M2/143‑18 (MQ=255) gccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTc > 1:1098553‑M1/119‑143 (MQ=255) gttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcattcactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCAGCCAATAAATCTCTTTtcaca < 2:363560‑M1/28‑3 (MQ=255) gttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATATTTTCATa < 1:398358‑M1/28‑1 (MQ=255) gttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccaacatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCAGCCAATAAATAACTTTTCATa < 2:349030‑M1/28‑1 (MQ=255) ggacgcgccgacccgggagtggctgaacaggagcgacaggtgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaa > 2:269951‑M1/115‑143 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAACTATCTTTTCATAAAATTAg < 2:132180‑M1/35‑1 (MQ=255) tagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgt < 1:389040‑M2/143‑29 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGCGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtt > 1:1258320‑M2/1‑114 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCACAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtt > 1:365773‑M2/1‑114 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTATATTTTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttt < 2:928706‑M2/143‑31 (MQ=255) taATCTCACACTTATATTTGTGTTGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 2:205912‑M2/1‑112 (MQ=255) cccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGa < 2:1200807‑M1/40‑1 (MQ=255) cccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGa < 2:1045563‑M1/40‑1 (MQ=255) aTCTCAAACTTATATTGGGGGGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttat > 1:670827‑M2/1‑110 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 1:1294420‑M2/143‑37 (MQ=255) cAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc > 1:303416‑M2/1‑106 (MQ=255) cAAACTGATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc > 2:1191261‑M2/1‑106 (MQ=255) agtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAACATTAGCCAGAAAAGAc < 1:876481‑M1/46‑1 (MQ=255) aaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcag > 1:196065‑M2/1‑104 (MQ=255) tgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATACCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACCCGGCa < 1:345313‑M1/52‑1 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc < 2:802810‑M2/135‑38 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc < 2:164408‑M2/135‑38 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc > 1:802810‑M2/1‑98 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAAACGCGGCat < 1:1010049‑M1/53‑1 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcagctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTGCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata > 1:243462‑M1/88‑143 (MQ=255) gtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGTAATGTAGGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg > 2:647817‑M2/1‑91 (MQ=255) agggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGccc > 2:843558‑M1/84‑143 (MQ=255) gggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCt > 1:521156‑M1/83‑143 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt > 1:393386‑M1/80‑143 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt > 1:880608‑M1/80‑143 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttcgcagcactatcGTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGACCTCTTTa < 2:465979‑M1/66‑1 (MQ=255) gccgatagactctgaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTac > 1:814422‑M1/77‑143 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCCTAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCGTATAGCCCTATTTaca < 1:355198‑M1/68‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 2:1037040‑M1/68‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 1:1084124‑M1/68‑1 (MQ=255) aGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATGGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg > 1:259005‑M2/1‑80 (MQ=255) taataaTAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag < 1:154990‑M2/143‑67 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagc > 1:928706‑M2/1‑76 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATCTCTTTTCATACAATTACCCAGCAACGACGCGGCATATAGCcctatttacaaagatca < 2:675309‑M1/75‑8 (MQ=255) ataataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagct < 1:699848‑M2/143‑69 (MQ=255) taataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctc > 1:434775‑M2/1‑74 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGACCTATTTCAACCTATGAttt < 2:41805‑M1/78‑1 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTAAACCGATGATTTCgcag < 2:596168‑M1/83‑1 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGCTGATTTCgcagc < 2:1322239‑M1/84‑1 (MQ=255) aTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATGCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaga > 1:1241229‑M2/1‑60 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa < 1:1164333‑M2/143‑85 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 2:389040‑M2/1‑59 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaagcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGt > 1:866574‑M1/51‑143 (MQ=255) cctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGgttc < 1:630991‑M1/95‑2 (MQ=255) aGTTGTGCCATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacga > 2:734351‑M2/1‑56 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCCTATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAccacgagagcataa < 2:102030‑M1/96‑6 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 2:129553‑M1/96‑1 (MQ=255) ttGGGCAAGAGCCAGGCATGTAAGTCATTCAAATTTGTGCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaactcattcatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca > 1:689474‑M2/1‑54 (MQ=255) gcgacagccagGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTGCTTTATTCTGTGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcca > 1:243873‑M2/6‑50 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaactaattgatagtgttttatgttcagataatgccccatgactttgccatgcacctccacccgtattctcaacgaccgcgact < 2:1003817‑M2/143‑96 (MQ=255) aTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatggctccaacttattgatagtgttttatgttcagataaggcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgggaacgacagcgagtt < 1:689011‑M2/143‑97 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgaatttgagaacgccagcgacgtccga < 2:740394‑M2/143‑101 (MQ=255) tcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCGGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTc < 1:746954‑M1/109‑1 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAACTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgggtttgagaacgacggcgacttccgtct < 2:1094240‑M2/143‑103 (MQ=255) ggAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc > 1:841371‑M2/1‑40 (MQ=255) atacactaattcattaagttggtagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGTAAAGACGTGGCATATAGCCCTATTTACACTGATGATTTCACAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCAt > 2:848901‑M1/33‑143 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt > 2:480348‑M1/31‑143 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt > 1:1045563‑M1/31‑143 (MQ=255) cactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTCGCCAGAATAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACAGATGATTTAGCCGCACGTGAGGGTAAAACTTCAGGATTCATGTc < 2:154459‑M1/114‑1 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTGTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAtt > 1:586476‑M1/25‑143 (MQ=255) ggAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgtctccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagagctacagcgacttccgtcccagccgtgcc > 2:1225606‑M2/1‑31 (MQ=255) gAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcccg < 1:781797‑M2/143‑114 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTa < 1:1177172‑M1/122‑1 (MQ=255) cAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacattgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgtccggtgc < 1:724275‑M2/143‑119 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct > 1:22309‑M2/1‑24 (MQ=255) aaaaTTGGTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct > 2:366285‑M2/1‑24 (MQ=255) gttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAGACTTCCTGATTCATGTCATATATTATGGGga < 2:89793‑M1/128‑1 (MQ=255) ttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACTTTTTATGGGgag < 1:993492‑M1/129‑1 (MQ=255) tGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctc > 1:28507‑M2/1‑19 (MQ=255) gcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGAtt < 1:516096‑M1/132‑1 (MQ=255) ttCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactgcaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcattcagctccaccgattgtgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcag > 1:1150238‑M2/1‑17 (MQ=255) catcaccTCGTGCCGCCAATAAATATCTTATCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGGATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCTGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCg > 1:562888‑M1/8‑143 (MQ=255) caccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAg < 1:476638‑M1/139‑1 (MQ=255) tttttgGACCGggtaatgactccgacttagtgatagtgttttgtcttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag > 2:1128262‑M2/2‑11 (MQ=255) ccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGc < 1:501162‑M1/141‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCGAGGAATGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCt < 2:158133‑M1/142‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGCCAATAAATATCATTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTACCTGATTCATATCCAAAGAGAGGGGGAGATTAACGTAGGCt < 2:517198‑M1/142‑1 (MQ=255) | GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCT > NC_000913/1292890‑1293173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |