New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 4056977 = | 70 (1.300) | 4 (0.080) | 4/492 | NT | 5.6% | coding (1058/1410 nt) | glnA | glutamine synthetase |
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CGTGCTTTCGGAGAAGAAACCACCGGAATACGGATAGACGCAGAACGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCGGGAAGTAACCGCCTTTCACTGCCGGACGGTGACCTTTGTTACCACCT > NC_000913/4056971‑4057537 | cgTGCTTTCGGAGAAGAAACCACCGGAATACGGATAGACGCAGAACGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGtt < 2:204473/289‑1 (MQ=255) 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tttttAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCg > 1:502403/1‑289 (MQ=255) tttttAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCg > 2:64195/1‑289 (MQ=255) ggCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCGGGAAGTAACCGCCTTTCa < 1:418692/288‑1 (MQ=255) 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CGTGCTTTCGGAGAAGAAACCACCGGAATACGGATAGACGCAGAACGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCGGGAAGTAACCGCCTTTCACTGCCGGACGGTGACCTTTGTTACCACCT > NC_000913/4056971‑4057537 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |