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cgcAGCTTTAATATCCGGCGTAAAGGCAGAGAATTTCATTGGACAACCAACGGTCAGATATTTTCCACGCAACGGTTGTTCCACTTCAACAACACTGCCACTTTGGCGCAAAGAGGGATCAAGTGAAATTTCTTTCATACTTAAAACCGGTGCACAAGGAATATCAAACTGAGTCAAATAGGCCACCGCTTCATGTTTATCAATAGTGACAGTGTATTTTTCGATTTCAGCAAAAATATCGAAAATATGTGGCTGTCGTGCATGGGctgtact > 1:176631/1‑273 (MQ=255) gcAGCTTTAATATCCGGCGTAAAGGCAGAGAATTTCATTGGACAACCAACGGTCAGATATTTTCCACGCAACGGTTGTTCCACTTCAACAACACTGCCACTTTGGCGCAAAGAGGGATCAAGTGAAATTTCTTTCATACTTAAAACCGGTGCACAAGGAATATCAAACTGAGTCAAATAGGCCACCGCTTCATGTTTATCAATAGTGACAGTGTATTTTTCGATTTCAGCAAAAATATCGAAAATATGTGGCTGTCGTGCATGGGCTGTACTGTATGCCGGATCGGTa < 1:395668/288‑1 (MQ=255) gcAGCTTTAATATCCGGCGTAAAGGCAGAGAATTTCATTGGACAACCAACGGTCAGATATTTTCCACGCAACGGTTGTTCCACTTCAACAACACTGCCACTTTGGCGCAAAGAGGGATCAAGTGAAATTTCTTTCATACTTAAAACCGGTGCACAAGGAATATCAAACTGAGTCAAATAGGCCACCGCTTCATGTTTATCAATAGTGACAGTGTATTTTTCGATTTCAGCAAAAATATCGAAAATATGTGGCTGTCGTGCATGGGCTGTACTGTATGCCGGATCGGTa < 1:61017/288‑1 (MQ=255) cGGCGTAAAGGCAGAGAATTTCATTGGACAACCAACGGTCAGATATTTTCCACGCAACGGTTGTTCCACTTCAACAACACTGCCACTTTGGCGCAAAGAGGGATCAAGTGAAATTTCTTTCATACTTAAAACCGGTGCACAAGGAATATCAAACTGAGTCAAATAGGCCACCGCTTCATGTTTATCAATAGTGACAGTGTATTTTTCGATTTCAGCAAAAATATCGAAAATATGTGGCTGTCGTGCATGGGCTGTACTGTATGCCGGATCGGTAATCCATTCTGGttt > 1:85002/1‑288 (MQ=255) gagaATTTCATTGGACAACCAACGGTCAGATATTTTCCACGCAACGGTTGTTCCACTTCAACAACACTGCCACTTTGGCGCAAAGAGGGATCAAGTGAAATTTCTTTCATACTTAAAACCGGTGCACAAGGAATATCAAACTGAGTCAAATAGGCCACCGCTTCATGTTTATCAATAGTGACAGTGTATTTTTCGATTTCAGCAAAAATATCGAAAATATGTGGCTGTCGTGCATGGGCTGTACTGTATGCCGGATCGGTAATCCATTCTGGTTTGCCGATGGCTTTAc > 1:18285/1‑289 (MQ=255) | CACAGGAATACCTACAACACCATAAATAGTGTCAATATTATTCTGTTTTAATGCTTCAACGATGATATGCATACCATCTGTCATTTGAAGTTGATCTGACATGATTAATAACCTCGAAATTTTTATAAATTGGGAGCCAGAAGCCCCCGTTAATATCAGATGGCGTGGTTTTGCTTCATTGCAGCAATTTCATCGTCGCTATAACCCAGCTCCTGCAATACAGCAGCGGTATGTTCACCTAATAGCGGCGCAGCTTTAATATCCGGCGTAAAGGCAGAGAATTTCATTGGACAACCAACGGTCAGATATTTTCCACGCAACGGTTGTTCCACTTCAACAACACTGCCACTTTGGCGCAAAGAGGGATCAAGTGAAATTTCTTTCATACTTAAAACCGGTGCACAAGGAATATCAAACTGAGTCAAATAGGCCACCGCTTCATGTTTATCAATAGTGACAGTGTATTTTTCGATTTCAGCAAAAATATCGAAAATATGTGGCTGTCGTGCATGGGCTGTACTGTATGCCGGATCGGTAATCCATTCTGGTTTGCCGATGGCTTTAC > NC_000913/2491849‑2492413 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |