Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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JC JC | NC_000913 | 1,351,197 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (‑158/+205) | fabI ← / ← ycjD | enoyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase, NADH‑dependent/DUF559 family endonuclease‑related protein |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | 81 (0.640) | 61/274 | 1.3 | 98.7% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
? | NC_000913 | 1351197 = | 1 (0.010) | intergenic (‑158/+210) | fabI/ycjD | enoyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase, NADH‑dependent/DUF559 family endonuclease‑related protein | |||||
* | ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | 85 (0.670) | 69/272 | 0.8 | 100% | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1351202 | 0 (0.000) | intergenic (‑163/+205) | fabI/ycjD | enoyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase, NADH‑dependent/DUF559 family endonuclease‑related protein |
TTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608158‑608008 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTGCCGAATATTCT > NC_000913/1351197‑1351344 TTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 2:321927/149‑1 TTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 4:309902/149‑1 AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 2:292051/148‑1 AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 5:549842/148‑1 AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 8:259072/148‑1 AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 4:284110/148‑1 AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCATAATACCACAACCCGTAAGTTAGCGCTTATGGG > 3:369264/1‑149 AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCAAGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 6:199125/148‑1 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCT > 3:279349/1‑149 CCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTT > 6:103996/1‑149 CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTT > 1:508722/1‑149 CGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCAC < 2:45691/144‑1 CGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCAC > 1:45691/1‑144 GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAAC < 1:164629/149‑1 TCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCT < 8:404349/148‑1 CAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATAAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCC > 1:337886/1‑149 AGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCC > 7:525939/1‑148 CTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAG < 4:56172/149‑1 CTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTCACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGA < 3:22818/148‑1 CGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGG > 2:406863/1‑149 CGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAG < 3:488421/146‑1 CGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAG < 4:360806/146‑1 cggcgtcCCAATACGGGCCAGAATTGCTGACCAGGTCGCGTGAGAGAAAATCATCGGCACGTTAAATCATATCCGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGC < 2:479851/142‑1 GCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTCCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGC > 3:68023/1‑147 CCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGt < 8:356795/148‑2 CCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGGTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGA < 8:482680/149‑1 CAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGAC > 5:536833/1‑149 ATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCACACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACC > 2:130720/1‑148 TGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTAT < 4:279349/149‑1 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGT > 3:408362/1‑149 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGT > 4:154267/1‑149 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTCCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGT < 4:68023/149‑1 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TGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAG < 6:510339/105‑1 TGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAG > 5:510339/1‑105 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACA < 5:302330/149‑1 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACA < 1:335572/149‑1 TAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGG < 4:475466/149‑1 TAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGG < 1:406863/149‑1 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AGTTAGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGA < 2:272353/148‑1 AGCGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTG > 2:532114/1‑149 CGCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTGCC < 8:87056/149‑1 tCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTACACCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGAACGTATTGTGCAAATATTTTTAACCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGG < 6:448410/134‑1 GCTTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGG > 5:448410/1‑135 TTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTGCCGAA > 2:507049/1‑149 TTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTGCCGAA > 3:207584/1‑149 TTATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTGCCGAA > 6:24727/1‑149 ATGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTGCCGAA < 1:97049/147‑1 GCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACGAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTGCCGAATATTCT > 7:409944/1‑149 TTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608158‑608008 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTGCCGAATATTCT > NC_000913/1351197‑1351344 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |