Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,023,245 | A→G | 6.2% | E170E (GAA→GAG) | tatC → | TatABCE protein translocation system subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,023,245 | 0 | A | G | 6.2% | 198.3 / 2.2 | 66 | E170E (GAA→GAG) | tatC | TatABCE protein translocation system subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/27); new base G (2/2); total (37/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCGGATGTCTTCTCGCAAACGCTGTTG > NC_000913/4023097‑4023389 | gcatggcatTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGaa < 4:265089/149‑1 (MQ=255) gcatggcatTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGaa < 1:214139/149‑1 (MQ=255) gcatggcatTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGaa < 7:267858/149‑1 (MQ=255) ggcatTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGTCGATGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGc > 2:69543/1‑149 (MQ=255) gcatTCGCCTACTTTGGGGGCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGGAGGTATCCACCGACATCTCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGc < 2:264347/148‑1 (MQ=255) gCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAg < 2:253370/148‑1 (MQ=255) tACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAAt > 2:77189/1‑149 (MQ=255) tACTTTGTGGGCTTTCGGCTGGCATTTGGCTTGCGTGCCAATACCGCGCTGGTAGGGGTGCAGGTATCCACCGTGTTCGACCTCTATTTAAGCTGCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTGCTTTGAAGTGACGGTAGCAAt < 5:26319/149‑1 (MQ=255) cTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAAt < 4:140256/147‑1 (MQ=255) tttGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATtgt > 2:182037/1‑149 (MQ=255) gtgGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCTTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGATGTGCCGGTAGCAATTGtgct > 6:273366/1‑149 (MQ=255) gtgGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGtgc < 6:105614/148‑1 (MQ=255) tgGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGtgctg > 7:189051/1‑149 (MQ=255) tCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGctgctg > 7:301071/1‑149 (MQ=255) tttCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCtactgtg > 6:161913/1‑149 (MQ=255) tCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCtgctgtgct > 8:142099/1‑149 (MQ=255) tCCGCTGGAATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCAACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTACTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCtgctgtgct > 3:96352/1‑149 (MQ=255) cGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCtgctgtgctg < 4:268560/148‑1 (MQ=255) cTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGAt < 1:103729/149‑1 (MQ=255) gCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATggg < 8:301071/149‑1 (MQ=255) cATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATgggg < 6:198801/149‑1 (MQ=255) tGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGAtt < 7:142099/148‑1 (MQ=255) ttCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATACACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAGGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTc > 6:241205/1‑149 (MQ=255) ttGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGCCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGc > 2:148323/1‑147 (MQ=255) gCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTACTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCag > 3:120662/1‑148 (MQ=255) ccAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCag > 8:20887/1‑147 (MQ=255) cAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGAGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTTCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGAGGGGGATTACCTCGCCag > 6:61219/1‑146 (MQ=255) cAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCAACCGACATCGACAGCGATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTATCCTTTGAAATGCCTGTAGCAATTGTGCTGCTGTGATGGATGGGGATTACCTCGCCag > 4:201971/1‑146 (MQ=255) ccGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACtt < 8:189051/148‑1 (MQ=255) cgcgCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGCCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTAc < 1:148323/149‑1 (MQ=255) ggAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCGTCGGTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGGCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCTGAAGCCTTACGCata > 2:7173/1‑146 (MQ=255) gggTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGc < 4:181809/149‑1 (MQ=255) aGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTAt > 3:86593/1‑149 (MQ=255) gTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTAtgt > 5:48958/1‑149 (MQ=255) tCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAGGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCt > 7:304837/1‑149 (MQ=255) aCCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCtggt > 7:283280/1‑149 (MQ=255) ccGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCGGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTCGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCttgtt > 5:305568/1‑149 (MQ=255) tCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCa > 4:298138/1‑149 (MQ=255) tCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGAGACTCCTTTGAAGTGCAGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGAAGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCa > 2:242504/1‑149 (MQ=255) ccAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTc > 7:304363/1‑149 (MQ=255) ccAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTc < 7:20887/149‑1 (MQ=255) ccAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTACTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTc < 4:120662/149‑1 (MQ=255) aGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGt > 1:161636/1‑149 (MQ=255) tttAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCg < 8:283280/149‑1 (MQ=255) ttAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTAt > 8:77843/1‑123 (MQ=255) ttAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTAt < 7:77843/123‑1 (MQ=255) cTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGt > 8:125654/1‑149 (MQ=255) ttCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGtt > 2:31998/1‑149 (MQ=255) ttCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGGATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGtt > 3:211070/1‑149 (MQ=255) cGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGtt < 1:31998/147‑1 (MQ=255) cGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTg < 3:298138/148‑1 (MQ=255) gTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGc < 1:77189/148‑1 (MQ=255) cgcTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGAcgccg > 4:239001/1‑149 (MQ=255) tttATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGATGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGccgccg > 5:304320/1‑147 (MQ=255) gCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCTAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCGGATGtctt > 6:25199/1‑149 (MQ=255) gCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCTGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCGGATGtct < 3:79519/148‑1 (MQ=255) gCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTACTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCGGATGtct < 5:161913/148‑1 (MQ=255) gTTGGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGAGGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCGGATGtcttct < 3:201971/149‑1 (MQ=255) tgtCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCaaaaaa > 4:68706/1‑79 (MQ=255) tgtCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCaaaaaa < 3:68706/79‑1 (MQ=255) tctcCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCGGATGTCTTCTCGCAAACg > 3:170013/1‑149 (MQ=255) catagAAGTGCCGGTAGCAATTGTCCTCCTGTGCTGGAAGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTAAGAAAAAAACGACCGTATGTGCTCGTTCGAGCATACTTTGTCGGCATGTTACTCACGCCGCAGGATGACTACTCGCAAACGCTGt > 4:282847/5‑149 (MQ=255) cTTTGCAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCgg > 2:258971/1‑128 (MQ=255) cTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGa < 1:171169/110‑1 (MQ=255) cTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCgg < 1:258971/128‑1 (MQ=255) tGAGGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCGGATGTCTTCTCGCAAACGCTGtt < 5:241205/147‑1 (MQ=255) tGAGGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCGGATGTCTTCTCGCAAACGCTGTTg < 8:304837/148‑1 (MQ=255) gAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCtggttggt < 2:31308/90‑1 (MQ=255) gAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCtggttggt > 1:31308/1‑90 (MQ=255) | GCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTTCGTTATGGCGCTGTTTATGGCGTTTGGTGTCTCCTTTGAAGTGCCGGTAGCAATTGTGCTGCTGTGCTGGATGGGGATTACCTCGCCAGAAGACTTACGCAAAAAACGCCCGTATGTGCTGGTTGGTGCATTCGTTGTCGGGATGTTGCTGACGCCGCCGGATGTCTTCTCGCAAACGCTGTTG > NC_000913/4023097‑4023389 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |