| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 213083 = | 62 (0.920) | 3 (0.050) | 3/276 | 10.3 | 4.8% | coding (753/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase |
| ? | NC_000913 | 213120 = | 60 (0.920) | coding (790/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTG > NC_000913/212978‑213256 | tgCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGCTTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcag > 2:562522/1‑143 (MQ=255)tgCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcag > 1:1073338/1‑143 (MQ=255) cTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATGCGCCGCTGGCGggcaggg > 2:290634/1‑143 (MQ=255) cTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcaggg < 2:563365/143‑1 (MQ=255) tGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTAGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGAACTCTGCAGATTGTACAAATACTCACGCTGAGTTATGCCCACCACGCGAAGAATAACAGCCGCGCGCTagcaaggc > 1:383921/1‑143 (MQ=255) gAACGAGAGAGCGTGCTGGATGAGCTGCGGGCAGATGAGTGAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGAGTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGGCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCGGGCTggcagggca < 2:951157/143‑1 (MQ=255) aCAAGAGGGCGTGCTGGATGGACTGCGGGCAGATGATTTAGCACACGGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATGGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGa < 1:3637/143‑1 (MQ=255) cAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGaa > 1:496869/1‑143 (MQ=255) agagagCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGACTg > 1:661816/1‑143 (MQ=255) gagagCCTGCTGGATGACCTGCTGGCAGATGATGTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGc < 1:992222/143‑1 (MQ=255) ctgctgGATGAACTGCTGGCGGATGATTTAGCACACTGTCAAGCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGAt < 1:457619/143‑1 (MQ=255) ggATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCtt < 1:243270/143‑1 (MQ=255) gATGAACTGCTGGCAGATGATTTCGCACACTGTCAATCGCAGCAGGGGAAGCTGCAGATTGTGCCGATGCTGGCGATGAGTGGTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCAGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAAGGCACCGAAGcggtc > 1:995232/1‑139 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACCATGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc < 1:979643/143‑1 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCCACGCACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGCCCCATTCCCGCCACCCTACCATGAGCCGCCGCCGGCCTGCAGGGCCGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGAc > 1:297711/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGCTGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc > 2:252628/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc > 2:338982/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGGGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc > 2:410380/1‑143 (MQ=255) gCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGtt > 2:886922/1‑143 (MQ=255) cAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTg < 1:96324/143‑1 (MQ=255) gatgatTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt > 2:139965/1‑143 (MQ=255) gatgatTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt > 1:539250/1‑143 (MQ=255) gatgatTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt > 1:1065773/1‑143 (MQ=255) cacaCTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCGGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCTGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTgg < 2:638878/143‑1 (MQ=255) cacTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGCATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGGTCTGGCa > 1:818088/1‑143 (MQ=255) acTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGGCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGGTCTGGCAg > 2:965231/1‑143 (MQ=255) cTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGACTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAgg < 1:660305/143‑1 (MQ=255) tGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTCAGGATCTGGCAggc > 2:1007076/1‑142 (MQ=255) gTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGaa < 2:777615/143‑1 (MQ=255) aaTCGCCGCAGGGGACGCTGCGGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGCTTATCCGCCGCTGGCGGGCAGGGCAGGATGCACGGAGGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtg < 1:155369/143‑1 (MQ=255) aaTCGCCGCACGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCGGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtg < 2:678561/143‑1 (MQ=255) ttgggcgcgGGCGACGCTGGAGATTGGGCCAGTGCTGGCGATGGGTGAGGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtgg < 1:178785/138‑1 (MQ=255) aTCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtgg > 2:508485/1‑143 (MQ=255) ccgcAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGGTGCCTTCCCGCGACGCGTTGGCGAGGATCTAGCAGGAAGtggcgct > 1:406443/1‑143 (MQ=255) ggggGCGCGGCAGATTGTGGCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtggcgctggcgc < 1:598000/143‑1 (MQ=255) gACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCggg > 2:1069254/1‑143 (MQ=255) gACGCTGCAGAGTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCggg < 2:882442/143‑1 (MQ=255) gCTGCAGAGTGTGCGAATGCTGGCGATGAGTGATGCCGGCCGCGCGGGGATTATGCTCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTGGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAg < 1:1007627/143‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGGGCCAATGCTGGCGATGAGTGAGGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCCGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGAt < 1:350455/143‑1 (MQ=255) agagTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGcc < 1:729909/143‑1 (MQ=255) aGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGcc < 2:1098952/143‑1 (MQ=255) gATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCt > 2:192984/1‑143 (MQ=255) gggcgcggAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCCCGCCGCGTTTGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGt < 2:438542/136‑1 (MQ=255) ggCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGGTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGAGGCCTCACCCTggttgcggt > 1:1060113/1‑135 (MQ=255) ggCCATGAGTGCTGCCGGCCGCGCGGCGATGATCCGCCGCTGGCTGGTAGGGCAGAATGCACCGATGCCGTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGtt < 1:864695/143‑1 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGttt > 2:357595/1‑143 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGttt < 1:272611/143‑1 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGttt < 2:938496/143‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGttt < 2:517203/143‑1 (MQ=255) ccgccgCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGaaa > 1:360767/1‑143 (MQ=255) gcgcgcgGTGGTTTTCCGCCGCTGGTTTTCAGGGCAGAATGCGTCGATGCCTTCCCGCGTCGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGCAGTGGCGCTTGCGCGGTAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATcc < 1:962661/142‑1 (MQ=255) gcgcgGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGGTCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGa > 2:296456/1‑143 (MQ=255) cagcggcggataatcgccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGa > 2:1108959/15‑143 (MQ=255) cgcggcgctctgcggccgcTGGGTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTGGGTGAGGATTTGGCAGGATGTGGCGGTTGCGGGGGAAGATGTCTCACGCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGAc < 1:1010815/129‑1 (MQ=255) cgcgGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGACGTTGCCTCGCCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGAc < 1:139965/143‑1 (MQ=255) ggcgATTATCCGCTGCTGGCTGCCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGAGGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCt < 1:1072960/143‑1 (MQ=255) cgATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTAt < 2:609731/143‑1 (MQ=255) aTTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCGCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCCGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCCGTTTACGTGTGGGCGCGTTCGAACTCCCACGccctca > 1:690822/1‑138 (MQ=255) tCCGCCGCTGGCTGGCAAGGAAGAATGAACCGTTGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGACGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCCCACCCTGTTTACGGTTGGGCGCGGTTGAAATCCGACGCTATCAGTCg > 1:144036/1‑143 (MQ=255) ctggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTgtggtg < 2:918360/143‑1 (MQ=255) ctggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTgtggtg < 2:1073338/143‑1 (MQ=255) | TGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTG > NC_000913/212978‑213256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |