New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2926899 | 60 (0.890) | 3 (0.050) | 3/270 | 10.1 | 5.0% | coding (594/1365 nt) | ygdH | UPF0717 family protein |
? | NC_000913 | = 2926909 | 58 (0.910) | coding (604/1365 nt) | ygdH | UPF0717 family protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTCTGCTGGGGCGGTCACTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGAAAAACGTCTGGAAGCG > NC_000913/2926759‑2927037 | gtCTGCTGGGGCGGTCACTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGAGATGCAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGt > 2:726367/1‑143 (MQ=255) ctgcggGGGCGGTCGCTCAATTAGCGGAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCg < 2:66240/143‑1 (MQ=255) ctgcggGGGCGGTCACTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCg < 2:1017564/143‑1 (MQ=255) gctgGGGCGGTCACTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGGAGCGCCGCTGAAAGGTGCTGGGGTCGGa > 1:589253/1‑143 (MQ=255) ggggCGGTCACTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGacac > 1:622552/1‑143 (MQ=255) ggCGGGCACTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACAcgc < 2:692259/143‑1 (MQ=255) cacgcgcttAACGAAAACGAGGATTGGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCgcagca < 1:891706/136‑1 (MQ=255) aCTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGcagcag > 2:147517/1‑143 (MQ=255) aCTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGGCGTTCTGCGCTGCAGGCGCCGATGAAACGTGCTGCGCTCGGAAACGCGgagcag > 2:973991/1‑143 (MQ=255) aCTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTAGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCCGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGCAGCGCCGATGACAGATGCTGCGGGCGGACACGCgcagcgc > 1:480711/1‑141 (MQ=255) aaTTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGtt > 2:918419/1‑143 (MQ=255) ttAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGACAGGTGCTGCGGTCGGCCACGCGCCGCGGCGTTAc > 1:321423/1‑143 (MQ=255) aCGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAGCCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACaaa < 2:852271/143‑1 (MQ=255) aaccatgTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCGCCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACa < 2:268594/137‑1 (MQ=255) cGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTc < 1:973216/143‑1 (MQ=255) cGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTc < 1:970436/143‑1 (MQ=255) tATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTCCCCCGGCTGTGGGCCGGGAGCGATGGCAGCGCCGATGAAAGGGGGTGCGGTCGGACACGCGCGGCAGTGTTACAAAGACGGTCgctc > 2:714319/1‑140 (MQ=255) tATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTCGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCCGCGTTACAAAGACAGTCgctg > 1:608620/1‑140 (MQ=255) tttGTATGCCCGTCGCGGCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTa < 2:284746/143‑1 (MQ=255) tggcgcgccGTCGCGTCGGGAACCCGCTGGGCCTGGGTGAGCTGAATATCGGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCTGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTAtt < 1:690323/136‑1 (MQ=255) aTGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCGGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGt < 2:1046611/143‑1 (MQ=255) tGCCCGTCGCGTCGGAACCCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTa < 2:305976/143‑1 (MQ=255) gCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTAt < 1:1116763/143‑1 (MQ=255) ccGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGCTTTATTGGTATGa > 1:787476/1‑143 (MQ=255) cgtcgGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGc > 1:248432/1‑143 (MQ=255) gtcgGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGcc < 2:546923/143‑1 (MQ=255) gtcgGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTCAATTGCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATTGAAGCGCCGATGAATGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGcc < 1:635365/143‑1 (MQ=255) ccAGCCGGGCCTGCGTGAGGGGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGACAGTCACGCGGAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTa < 2:491038/143‑1 (MQ=255) cAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTAt < 2:580361/143‑1 (MQ=255) tGGGCCGGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATcgcc < 2:622552/143‑1 (MQ=255) ggCCGGCGTGAGCTGAATATGTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATAAAAGGTGCTGCGGTTGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTGTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATcgccgc < 2:818457/143‑1 (MQ=255) ccTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTg > 1:331877/1‑143 (MQ=255) ccTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGAACTGCGATCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTg > 2:909951/1‑143 (MQ=255) gCGTGAGCTGAATACCTGCCCCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAAc < 2:273247/143‑1 (MQ=255) aGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGCTCTGACACGCGCAGCAGCGTTACCAAGACAGCCGTTCTCTCGGTACGACAGATCCGTCGCTGACCGCCGCTTACCCGCCt > 2:996102/1‑143 (MQ=255) tCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTg < 2:248432/143‑1 (MQ=255) cggCACCGGCTTTTGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCTGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTgg < 2:21628/141‑1 (MQ=255) tgcgctggCTGTGGTCCGGGTGCGAGAGAAGCGCCGATGAAAGGTTCTGCGGTCGGACACGCGCAGGAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGt < 1:998341/137‑1 (MQ=255) tGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGt > 2:567189/1‑143 (MQ=255) tGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGt < 1:19612/143‑1 (MQ=255) cGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTTGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACg < 2:608620/143‑1 (MQ=255) tCCGGGAGCGATGGCAGCGCCGATGAAAGGCGCTGCGGTCGGACACGCGCGGGAGCGTTACAAAGACAGTCGTCTTATTGGTACGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGatca < 1:944098/143‑1 (MQ=255) tCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGGCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGatca < 1:527463/143‑1 (MQ=255) cGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGatcatc > 2:905714/1‑143 (MQ=255) ggcgcggtggccgcCCATTAAAGGTGCTGCGGTCGGTCCCGCTCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCTCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGc < 1:748994/132‑1 (MQ=255) aggggtGGAAGCGCCGATGCAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCGGCGTTACAAAGACAGTCGGTTTATTGGTAGGACAGAGCCGTCGATGATCGCCGCTGCACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGc < 1:1049783/138‑1 (MQ=255) gCGATGGAAGCGCCGATGGAGGGTGCTGCTGTCGGACACTCTCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGcc < 1:808212/143‑1 (MQ=255) gATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGATTAAATGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACAGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTCATCAGCATGCCAg > 1:453456/1‑143 (MQ=255) aTGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTCTCTCCGCTGCACCGCCTAACCCGCTGGTCAATGACTTGCTCCACCTGCCata > 2:763761/1‑141 (MQ=255) aTGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCCGCGTGCCAGa > 2:127752/1‑143 (MQ=255) aggcgccgagtaggggTGCTGTGGGCGCGCACGGGCTGCGGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGATCCGCCTAACCTGCTGGTCATCGTATTGATCATCATGCCAGATATc < 1:60215/129‑1 (MQ=255) gcgcCTATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGa < 1:474892/143‑1 (MQ=255) gcCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGaaa < 1:147517/143‑1 (MQ=255) cGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATCTCGaaaca > 2:713246/1‑141 (MQ=255) cGAGGAAGGGTGCTGCGGTCGGCCACGCGCAGCAGCGTCACAAAGACCGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGaaaaa < 2:699713/143‑1 (MQ=255) gATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCTCAAATACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGAAAAAc < 1:1126089/143‑1 (MQ=255) ggacggggctgcGGCTGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATGATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGAAAAACGTc < 1:912248/136‑1 (MQ=255) gAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGGGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGAAAAACGTc < 2:969457/143‑1 (MQ=255) gTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGAAAAACGTCTGGaa < 2:818252/143‑1 (MQ=255) ctgcGGTCGGACACGCGCAGCAGGGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGAAACACCTCTGGAAGCg > 1:1152382/1‑143 (MQ=255) | GTCTGCTGGGGCGGTCACTCAATTAACGAAAACGAGTATTTGTATGCCCGTCGCGTCGGAAACCAGCTGGGCCTGCGTGAGCTGAATATCTGCACCGGCTGTGGTCCGGGAGCGATGGAAGCGCCGATGAAAGGTGCTGCGGTCGGACACGCGCAGCAGCGTTACAAAGACAGTCGTTTTATTGGTATGACAGAGCCGTCGATTATCGCCGCTGAACCGCCTAACCCGCTGGTCAACGAATTGATCATCATGCCAGATATCGAAAAACGTCTGGAAGCG > NC_000913/2926759‑2927037 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |