| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 613,679 | G→A | 4.2% | G315R (GGG→AGG) | fes → | enterobactin/ferrienterobactin esterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 613,679 | 0 | G | A | 4.2% | 328.9 / 2.7 | 95 | G315R (GGG→AGG) | fes | enterobactin/ferrienterobactin esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/44); new base A (2/2); total (49/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
CCATCGTCAGCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAG‑CCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCTAATCGACCTCTGGCAACCACTTTTCCATGACAGGAGTTGAATATGGCATTCAGTA > NC_000913/613393‑613954 | ccATCGTCAGCAACTCCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGTTCGCCGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGACCTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGgggcggg < 2:715599/289‑1 (MQ=255) cGTCAGCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGgcagc > 1:106885/1‑289 (MQ=255) cctccCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGCGGGCgtgt > 1:527513/1‑289 (MQ=255) cttgtcttggtggATCGCAGCTCTCGACACCCCGCACCGCGCCCACGAACTGCCGGGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTCTTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGaa < 2:626550/277‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |