| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,136,717 | C→G | 3.7% | A148A (GCC→GCG) | flgI → | putative flagellar basal body protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,136,717 | 0 | C | G | 3.7% | 379.3 / 3.8 | 105 | A148A (GCC→GCG) | flgI | putative flagellar basal body protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/52); new base G (2/3); total (50/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCCAGACGCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAGAATATG > NC_000913/1136431‑1136999 | cccAGACGCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTCCGTCTTTGATGACCCCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGTCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCTCAGGCGccc > 2:310863/1‑287 (MQ=255) aCGCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGCCAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTg > 1:111372/1‑289 (MQ=255) tACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGc < 1:521561/289‑1 (MQ=255) aCCACACAAACGCTTAATAACATGCTTTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCa < 2:723868/289‑1 (MQ=255) ttAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACGGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTa < 1:143976/288‑1 (MQ=255) aCATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACt < 1:23650/289‑1 (MQ=255) aCAGGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACt < 1:372837/289‑1 (MQ=255) tGCGCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACCGGCACCAATAGGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGaa < 2:580923/289‑1 (MQ=255) gCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCt > 1:204695/1‑256 (MQ=255) gCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCt < 2:204695/256‑1 (MQ=255) gCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGAGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAAc > 2:379768/1‑289 (MQ=255) tctcACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTTTGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGAGTAGGGCCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTAAGGTTAACCACCTGAACgg > 2:13929/1‑289 (MQ=255) cTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGa > 2:261489/1‑289 (MQ=255) cTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGa > 1:572082/1‑289 (MQ=255) tGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACgg < 1:589521/287‑1 (MQ=255) tGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGAt < 1:57800/289‑1 (MQ=255) tGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGAt < 2:206371/289‑1 (MQ=255) aaTTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCAc < 2:410511/288‑1 (MQ=255) ccGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGTCAATATGCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGATGGCGGTAGCAGTGTTAAGGTTAACAACCTGAACGGGGGACGTAACACAGATgg > 2:441268/1‑289 (MQ=255) gTTCCGACGGGCACCTATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACATCGTCACTTCCTACGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGGTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTg < 1:752306/289‑1 (MQ=255) gTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGGGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTg < 2:483646/289‑1 (MQ=255) ccGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCgg > 2:107794/1‑289 (MQ=255) tGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAgtgt > 2:51482/1‑229 (MQ=255) tGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAgtgt < 1:51482/229‑1 (MQ=255) tGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAAtt > 2:556324/1‑289 (MQ=255) cTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAATGTGAATTGCcca > 2:196850/1‑289 (MQ=255) cTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCcca > 1:341320/1‑289 (MQ=255) cTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCcca > 1:98815/1‑289 (MQ=255) cTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCcca > 2:589767/1‑289 (MQ=255) gTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTg < 1:617438/289‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTgg > 2:325491/1‑289 (MQ=255) aaTGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGaa < 1:107794/288‑1 (MQ=255) gACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTACCCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTg > 2:366712/1‑239 (MQ=255) gACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTg < 1:366712/239‑1 (MQ=255) aCAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTa > 1:803662/1‑289 (MQ=255) aCAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTa > 1:362817/1‑289 (MQ=255) aGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCt < 1:105632/181‑1 (MQ=255) aGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCt > 2:105632/1‑181 (MQ=255) cGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAAttt > 1:699336/1‑289 (MQ=255) gTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGGTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTg < 2:491839/289‑1 (MQ=255) ttGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGGGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAacgacg < 2:678886/288‑1 (MQ=255) ggCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAATGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCa < 1:196850/288‑1 (MQ=255) aaCCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGgc > 1:24583/1‑288 (MQ=255) aCCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGgcgc > 1:642674/1‑289 (MQ=255) cGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCaa < 2:642674/289‑1 (MQ=255) gtggtgGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCg < 1:13929/289‑1 (MQ=255) gtggtTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCGTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGaa > 2:415355/1‑233 (MQ=255) gtggtTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCGTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGaa < 1:415355/233‑1 (MQ=255) gtggtTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAacgacg < 1:239086/259‑1 (MQ=255) gtggtTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAacgacg > 2:239086/1‑259 (MQ=255) tcttcCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCa > 2:288578/1‑289 (MQ=255) ttcCATGGGAAATGCCAAAAGCTGGGGGGGGGGTACGTGGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATc < 2:572082/289‑1 (MQ=255) tGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACcg < 1:111174/289‑1 (MQ=255) tGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCACAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCa > 1:643756/1‑288 (MQ=255) ttgATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATCCCCTTAATTTGCAACTTAACGACGACGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTTCGTGGGTCTGGCTGCCCCACCGCGTCAgcc > 2:734689/1‑286 (MQ=255) ttgATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACCCCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGAt > 1:442084/1‑288 (MQ=255) ttgATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCgcgtgc > 2:56708/1‑259 (MQ=255) ttgATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCgcgtgc < 1:56708/259‑1 (MQ=255) ttgATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGAt > 1:595317/1‑288 (MQ=255) tgatgaAACCGCTTAAGGGCGTTGACAGGCAGGGGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATgc < 2:803662/289‑1 (MQ=255) tgaCACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGcgcg < 2:699336/289‑1 (MQ=255) acacCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCgg > 2:706866/1‑288 (MQ=255) cacCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGa < 2:24583/288‑1 (MQ=255) cacCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGa < 2:341320/288‑1 (MQ=255) acCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGGGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACt > 1:633840/1‑289 (MQ=255) cGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGaa > 1:586599/1‑175 (MQ=255) cTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGcgcg < 1:507766/281‑1 (MQ=255) cTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGcgcg > 2:507766/1‑281 (MQ=255) tgaaGGGCGTGGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGAAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCACTGTCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCa < 2:442084/287‑1 (MQ=255) aaGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTTGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAgg < 2:628914/289‑1 (MQ=255) ttGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGa > 2:239090/1‑273 (MQ=255) ttGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGa < 1:239090/273‑1 (MQ=255) ttGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGt > 1:682711/1‑289 (MQ=255) ttGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGt > 2:506461/1‑289 (MQ=255) ttGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGt > 2:218454/1‑289 (MQ=255) ttGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGt > 2:795494/1‑289 (MQ=255) cAGGTGTATGGGCTGGGGCAGGGCAATATTCGGGTTGGCGGCGCAGGGGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGGGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGt < 2:633840/288‑1 (MQ=255) cAGGTGTATGCGCTTGCGCAGCGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCCGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGCTCTTGAACGTGAATTGCTCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCATCTTAACGACGAACATTACAGCATGGCGCAGCAAATCGCCGACACCACCAACCGCGTACGTGGAAACGGCCGCGCCACCGCGGTAGCTGCGAGCACTCTTCACGTGCGCTTACCGtgtg > 2:686028/1‑289 (MQ=255) cAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCg < 1:556324/285‑1 (MQ=255) gcTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTg > 2:202570/1‑200 (MQ=255) gcTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTg < 1:202570/200‑1 (MQ=255) tGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCCGGTGCGCGTCCCGAGTGGCAACGGTTccc > 2:324804/1‑288 (MQ=255) gggacatatGCGGGTTGGCGGCGCAGGGGCGTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTGGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCg < 2:291746/283‑1 (MQ=255) ggCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGTGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCt > 2:385745/1‑289 (MQ=255) ggCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAg > 2:745811/1‑221 (MQ=255) ggCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAg < 1:745811/221‑1 (MQ=255) atatTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCt < 1:325491/289‑1 (MQ=255) tatTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGaa < 1:475108/157‑1 (MQ=255) tatTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGaa > 2:475108/1‑157 (MQ=255) tGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCaa > 1:796837/1‑262 (MQ=255) tGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCaa < 2:796837/262‑1 (MQ=255) aggctggcgCTGGAACGTACGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGatat > 1:769210/6‑289 (MQ=255) ggcggcGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTc > 2:767992/1‑289 (MQ=255) ggggggaGGAGCGTCCGCTGGCGGTAGCGGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATTACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAAGTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCa < 2:643756/282‑1 (MQ=255) cggcgCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTAt > 2:269284/1‑81 (MQ=255) cggcgCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTAt < 1:269284/81‑1 (MQ=255) gcgcAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAGa < 1:706866/288‑1 (MQ=255) cgcAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAGAat > 1:218514/1‑289 (MQ=255) aGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAGAATATg < 1:218454/286‑1 (MQ=255) aGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAGAATATg < 1:261489/286‑1 (MQ=255) | CCCAGACGCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCACCAATATGCAGCTAAAAAACGTCGCTGCGGTAATGGTGACAGCGTCACTTCCTCCGTTTGGACGTCAGGGGCAAACCATCGATGTGGTGGTTTCTTCCATGGGAAATGCCAAAAGCTTGCGTGGAGGTACGTTGTTGATGACACCGCTTAAGGGCGTTGACAGTCAGGTGTATGCGCTGGCGCAGGGCAATATTCTGGTTGGCGGCGCAGGAGCCTCCGCTGGCGGTAGCAGTGTTCAGGTTAACCAACTGAACGGTGGACGGATCACCAATGGTGCGGTTATTGAACGTGAATTGCCCAGCCAGTTTGGCGTCGGGAATACCCTTAATTTGCAACTTAACGACGAAGATTTCAGCATGGCGCAGCAAATCGCTGACACCATCAACCGCGTGCGTGGATATGGCAGCGCCACCGCGTTAGATGCGCGGACTATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAGAATATG > NC_000913/1136431‑1136999 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |