New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3498079 | 91 (0.930) | 5 (0.050) | 5/504 | NT | 5.3% | coding (254/1374 nt) | cysG | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase |
? | NC_000913 | = 3498084 | 92 (0.970) | coding (259/1374 nt) | cysG | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CTGCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAGCTTTATTATGCCGTCGATTATTGACCGCTCACCGCTCATGGTAGCGGTCTCCTCTGGCGGCACCTCTCCGGTTCTGGCACGCCTGTTGCGCGAAAAACTTGAATCACTGCTGCCGTTACATCTGGGCCAGGTAGCGAAATACGCCGGGCAATTACGCGGGCGAGTGAAACAACAGTTCGCCACGATGGGTGAGCGTCGCCGTTTCTGGGAG > NC_000913/3497797‑3498365 | cTGCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTTAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACACTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATTATGACGCGCTTAAcc > 2:138821/1‑288 (MQ=255) cTGCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAAcc > 1:577852/1‑288 (MQ=255) aGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGcc > 2:868703/1‑288 (MQ=255) aGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGcc > 1:36139/1‑288 (MQ=255) gggTTTTTACGTGGGTCAGTTGCTGGTATGTTGCCAATTACGCGAGAGGGAGTGTGTGATTGTGCGCGGTGGTGATGTCGGTGAACGGAAAGCAAGGTGGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGGTGAACAGTGAATGCATTAGCGATTATTCCACAGTTCACCGCATGGGAAGATGCAGGCATGTTATGCATCGTCGAAGGGCCAGTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCGGGCTGGCGATTGCAGCGACAGATGATGACGCGCTTAACCagcgcgtcatcatccgtcg > 1:353025‑M2/1‑269 (MQ=255) ggATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGGCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGc < 2:516170/289‑1 (MQ=255) gATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGTTTGCAGCGACGGGTGATGACGCCCTTACCCCGCGCGGCAGCGAAGCCGCTgccgaccgtggc > 1:594869/1‑277 (MQ=255) 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tCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCAt < 1:540529/288‑1 (MQ=255) tatTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTtaaccagcgcgtcatcatccgtcgctgcaatccccagcccgcagggttcga > 2:207889‑M1/1‑238 (MQ=255) tGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCg > 2:722670/1‑289 (MQ=255) 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tCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGc < 1:389963/256‑1 (MQ=255) gcgACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAgccgc < 1:142374/289‑1 (MQ=255) gACTGTCTGCTTGTCGGCGGTGGGGATGTCGCGGAACGAAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTtaaccagcgcgtcatcatccgtcgctgcaatcgccagccagcaggtgtcgagaaggctttcatcaaatggccct < 2:554031‑M1/289‑75 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |